| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,318,466 | T→C | 9.4% | T202A (ACC→GCC) ‡ | ilvC ← | ketol‑acid reductoisomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,318,466 | 0 | T | C | 9.4% | 527.3 / 30.8 | 181 | T202A (ACC→GCC) ‡ | ilvC | ketol‑acid reductoisomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (81/83); new base C (13/4); total (94/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.15e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GGAGATCGAGTAGTTCATGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGA > NC_002947/5318317‑5318615 | ggAGATCGAGTAGTTCATGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGt > 1:2276987/1‑150 (MQ=255) gaTCGAGTAGTTCATGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTAcc > 2:3058779/1‑150 (MQ=255) gaTCGAGTAGTTCATGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTAcc < 1:982093/150‑1 (MQ=255) gAGTAGTTCATGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCca > 2:5174328/1‑150 (MQ=255) ttCATGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGa > 2:3487380/1‑150 (MQ=255) tCATGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGaa < 1:1139063/150‑1 (MQ=255) aTGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACa < 1:1546770/150‑1 (MQ=255) aTGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACa < 2:116588/150‑1 (MQ=255) tGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAg > 2:1217649/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGc < 1:3011980/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCca > 2:1821262/1‑138 (MQ=255) ttGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCca < 1:1821262/138‑1 (MQ=255) ttGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCGCACAGAACAGcc > 2:4637366/1‑150 (MQ=255) ttGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGcc > 1:1071164/1‑150 (MQ=255) ttGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGcc < 1:3487039/150‑1 (MQ=255) gCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGc > 2:1731064/1‑150 (MQ=255) cGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCt < 1:4598804/150‑1 (MQ=255) gATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTc > 2:8404/1‑150 (MQ=255) gccTTCATAGATCAGGTCTACGATGAGCTTCATTTCGTGCAGGCACTGGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAAT‑GAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGaa < 1:4378368/150‑1 (MQ=255) ttCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAg > 2:4332755/1‑150 (MQ=255) ttCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAg < 1:3378309/150‑1 (MQ=255) tCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAgg > 1:1568816/1‑150 (MQ=255) cGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGt < 1:3095211/150‑1 (MQ=255) cGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGt < 1:3823723/150‑1 (MQ=255) tagatcaGGTCTACGATGAGCTTCATTTCGTGCAGGCACTCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTG‑TGCGACTGAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtca > 2:2376439/7‑149 (MQ=255) atcaGGTCTACGATGAGCTTCATTTCGTGCAGGCACTCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAAT‑GAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAgg < 1:3545579/141‑1 (MQ=255) caGGTCTACGATGAGCTTCATTTCGTGCAGGCACTCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAAT‑GAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcagtttc < 2:2398123/149‑1 (MQ=255) aGGTCTACGATGAGCTTCATTTCGTGCAGGCACTCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAAT‑GAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcagtttcg > 2:1985383/1‑150 (MQ=255) aGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcggtttcg < 1:2010160/150‑1 (MQ=255) aGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcggtttcg < 2:5365406/150‑1 (MQ=255) aGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTACGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcggtttcg < 2:5090922/150‑1 (MQ=255) gTCTACGATGAGCTTCATTTCGTGCAGGCACTCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAAT‑GAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcagtttcgca > 2:1449409/1‑148 (MQ=255) gTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcggtttcggt < 1:1731064/150‑1 (MQ=255) tCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcggtttcggtt > 2:2969845/1‑150 (MQ=255) tACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCCGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAAc < 2:5272556/117‑1 (MQ=255) tACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAAc > 1:5272556/1‑117 (MQ=255) tACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCggtttcggtttc > 2:4448685/1‑150 (MQ=255) tACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCggtttcggtttc < 1:250249/150‑1 (MQ=255) gaCGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCggtttcggtttc < 2:3608723/149‑1 (MQ=255) gATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTc > 1:4247407/1‑150 (MQ=255) tcagcttcagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCCGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCt > 1:1967893/1‑150 (MQ=255) gcttcatttCGTGCAGGCACTCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAAT‑GAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGa > 2:3812120/1‑150 (MQ=255) gcttcagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGa < 1:3058779/150‑1 (MQ=255) cttcatttCGTGCAGGCACTCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAAT‑GAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGaa < 1:1673985/150‑1 (MQ=255) cttcagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGaa > 2:2526920/1‑150 (MQ=255) cagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggt < 1:2495733/150‑1 (MQ=255) cagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggt < 1:2705454/150‑1 (MQ=255) gctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGATACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACCGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggtgg < 2:3091606/150‑1 (MQ=255) gctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggtgg < 2:156972/150‑1 (MQ=255) ctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggtggt > 2:5445438/1‑150 (MQ=255) gCAGGCTCTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCga < 2:2059458/150‑1 (MQ=255) gCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCga < 1:2767457/150‑1 (MQ=255) cTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATAcc > 2:1267211/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTTGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCg > 2:2976929/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcggtttcg > 1:5171685/1‑117 (MQ=255) tCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcggtttcg < 2:5171685/117‑1 (MQ=255) tCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCg > 2:5006941/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCg > 2:745997/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAAT‑GAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCaataacgccc > 2:2851012/1‑143 (MQ=255) cGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCgg < 2:2114364/150‑1 (MQ=255) aGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTAc < 2:2692975/150‑1 (MQ=255) ccATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGccac > 2:2023005/1‑150 (MQ=255) cATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGccacc > 1:1326425/1‑150 (MQ=255) aTTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGccacca > 1:4300867/1‑150 (MQ=255) tttCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcggtttcgg > 1:4528768/1‑105 (MQ=255) tAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGaa < 2:2713580/150‑1 (MQ=255) ccAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCa > 1:3219769/1‑150 (MQ=255) cAGCTTCGACCCGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCAt < 2:4830273/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCAt < 1:1206640/150‑1 (MQ=255) aGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATa > 1:4359984/1‑150 (MQ=255) gCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggtg < 2:3369438/105‑1 (MQ=255) gCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggtg > 1:3369438/1‑105 (MQ=255) gCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAg < 1:1637259/150‑1 (MQ=255) ttCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGa < 1:1835761/150‑1 (MQ=255) aCCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGt < 1:1247356/150‑1 (MQ=255) aCCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGt > 2:2550095/1‑150 (MQ=255) ccAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTg > 1:857086/1‑58 (MQ=255) cAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGc > 2:4995456/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCGTAGGACAGTGCGa > 1:251592/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGa > 1:2423158/1‑150 (MQ=255) tttCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGt > 1:1053168/1‑150 (MQ=255) tttCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGt > 2:3729820/1‑150 (MQ=255) gAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCtt > 1:4781587/1‑150 (MQ=255) gAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCtt < 2:4945226/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTg < 1:976972/150‑1 (MQ=255) aaCCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTgg > 2:3395336/1‑150 (MQ=255) aaCCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTgg > 1:3474649/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCg > 1:5209976/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACTGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCTAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCttttcgt < 2:928939/150‑6 (MQ=255) ggCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGtt < 2:3505792/150‑1 (MQ=255) tttGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGcc < 2:2589816/150‑1 (MQ=255) tttGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGcc > 2:66266/1‑150 (MQ=255) aC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGCCGGaa < 1:618358/150‑1 (MQ=255) aC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGCCGGaa < 1:2873147/150‑1 (MQ=255) aC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGCCGGaa < 2:914674/150‑1 (MQ=255) aGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGCCGGAAGCg > 1:1866524/1‑150 (MQ=255) cGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGCCGGAAGCGTCCt < 2:3219769/150‑1 (MQ=255) gatggTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGCCGGAAGCGTCCTg > 2:585162/4‑150 (MQ=255) gACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGCCGGAAGCGTCCTg > 1:2103624/1‑150 (MQ=255) tACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTCGa > 2:4166696/1‑150 (MQ=255) | GGAGATCGAGTAGTTCATGTTGGCGATGCCGCCTTCGTACATGAGGTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGAC‑CAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTGGCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGA > NC_002947/5318317‑5318615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |