| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,318,511 | T→A | 7.4% | T187S (ACC→TCC) ‡ | ilvC ← | ketol‑acid reductoisomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,318,511 | 0 | T | A | 7.4% | 501.6 / 20.7 | 158 | T187S (ACC→TCC) ‡ | ilvC | ketol‑acid reductoisomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (74/72); new base A (9/3); total (83/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
GTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGC > NC_002947/5318362‑5318660 | tCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGtcggtttcggtt > 2:723549/1‑150 (MQ=255) tACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCggtttcggtttc < 1:250249/150‑1 (MQ=255) gaCGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCggtttcggtttc < 2:3608723/149‑1 (MQ=255) tcagcttcagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCt > 1:2589816/1‑150 (MQ=255) tcagcttcagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCCGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCt > 1:1967893/1‑150 (MQ=255) gcttcatttCGTGCAGGCACTCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAATGAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGa > 2:3812120/1‑150 (MQ=255) gcttcagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGa < 1:3058779/150‑1 (MQ=255) cttcagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGaa > 2:2526920/1‑150 (MQ=255) cagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGCACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggt < 2:2030001/150‑1 (MQ=255) cagctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggt < 1:2495733/150‑1 (MQ=255) tttCGTGCAGGCACTCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAATGAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAggtgg > 2:5437722/3‑150 (MQ=255) gctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGATACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACCGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggtgg < 2:3091606/150‑1 (MQ=255) gctCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggtgg < 2:3091615/150‑1 (MQ=255) gCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCga < 1:2767457/150‑1 (MQ=255) cAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCgat < 1:5187505/150‑1 (MQ=255) cAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCgat < 1:4332755/150‑1 (MQ=255) cAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCgat > 1:1825654/1‑150 (MQ=255) ggCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCgatga > 1:2822097/1‑150 (MQ=255) aCTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATAc > 2:520900/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTTGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCg > 2:2976929/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCg > 2:5006941/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCg > 2:745997/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAATGAGTTCAACAACGCCACCGCACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCaataacgccc > 2:2851002/1‑143 (MQ=255) tCGAAGTAAGCCATTTCTGGTGCGTAACCAGCTTCGACCAGAACTTCAAAACCTGTGCGAATGAGTTCAACAACGCCACCGCAAAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCaataacgccc > 2:2851012/1‑143 (MQ=255) cGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCgg < 2:2114364/150‑1 (MQ=255) aGTAGGCCAGGTCCGGCGCGCACCCAGCTTCGACCAGGGTATCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTCCCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGCGTCGGTTTCCTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTAc < 2:2693104/150‑1 (MQ=255) ccATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGccac > 2:2023005/1‑150 (MQ=255) cATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGccacc > 2:4330766/1‑150 (MQ=255) aTTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGccacca > 1:2217219/1‑150 (MQ=255) aTTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGccacca > 1:4300867/1‑150 (MQ=255) tAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGaa > 2:1584760/1‑150 (MQ=255) cAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCAt < 1:1206640/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCAt > 1:2508607/1‑150 (MQ=255) aGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATa < 1:4154795/150‑1 (MQ=255) gCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggtg > 1:3369438/1‑105 (MQ=255) gCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAggtg < 2:3369438/105‑1 (MQ=255) gCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAg < 1:2757706/150‑1 (MQ=255) gCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAg < 1:1637485/150‑1 (MQ=255) gCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAg > 2:101493/1‑150 (MQ=255) cTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAgg > 1:4451517/1‑150 (MQ=255) ttCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCAGAGGa > 2:3430821/1‑150 (MQ=255) aCCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGt < 1:1247356/150‑1 (MQ=255) cAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGc > 2:4995417/1‑150 (MQ=255) tttCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGt > 2:3729820/1‑150 (MQ=255) tttCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGt > 1:1053168/1‑150 (MQ=255) aaaCCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTg < 1:976972/150‑1 (MQ=255) aaCCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTg‑g > 1:3474649/1‑150 (MQ=255) aCCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑Gc < 1:1679591/150‑1 (MQ=255) ccGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCg > 1:5209976/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGt < 2:929090/150‑1 (MQ=255) cTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGc > 1:4529643/1‑150 (MQ=255) tttGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGcc > 2:66266/1‑150 (MQ=255) tttGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGcc < 2:2589816/150‑1 (MQ=255) tttGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGcc < 2:2579641/150‑1 (MQ=255) aCCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGaa < 1:2873147/150‑1 (MQ=255) aCCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGaa < 1:618358/150‑1 (MQ=255) aCCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGaa < 1:4634147/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAg < 1:8404/150‑1 (MQ=255) cAGCTCGACGGTACCGCCACACAGACCAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTGTCGATGATCCCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCAGAGGACAGTGCGACGGTCTTG‑GCGTTGCCGGACGc > 2:1404884/1‑150 (MQ=255) aGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCg > 1:1866524/1‑150 (MQ=255) cTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTc < 2:921290/150‑1 (MQ=255) cGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCt < 2:3219769/150‑1 (MQ=255) gatggTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTg > 2:585162/4‑150 (MQ=255) tACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTCGa > 2:4166696/1‑150 (MQ=255) ccGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATa < 1:3238623/150‑1 (MQ=255) cGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAg > 2:4577191/1‑150 (MQ=255) cGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCGTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAg > 1:1665038/1‑150 (MQ=255) ccACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGGTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCg > 2:1243031/1‑150 (MQ=255) acacaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAt < 1:183896/150‑1 (MQ=255) acacaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAt < 1:2601683/150‑1 (MQ=255) cacaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtc < 1:2417564/150‑1 (MQ=255) cacaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtc < 2:848359/150‑1 (MQ=255) acaGAACCGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtca < 1:1404884/150‑1 (MQ=255) acaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtca > 2:3593493/1‑150 (MQ=255) aaaGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCAATAACGCCCGAACGACCGCCACCAACGCCCGAAGCGTAAGACAGAGCGA‑GATCATGTGCGTTGCCCGAAGCATCCTGATGGATCGCGAtaa > 2:178949/3‑148 (MQ=255) aGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtcagg > 1:3084199/1‑150 (MQ=255) aGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCAGTTTCGCACTCTTCCTTGAAGGTGGTTTCAATAACGCCCGAACGACCGCCACCAACGCCCGAAGCGTAAGACAGAGCGA‑GATCATGTGCGTTGCCCGAAGCATCCTGATGGATCGCGAtaagg < 2:1642063/150‑1 (MQ=255) gAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTACTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtcaggt > 2:4840574/1‑150 (MQ=255) aaCAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCtt < 2:4935454/111‑1 (MQ=255) aGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGAtcaggtcagg < 2:4247407/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAggg < 1:2969845/150‑1 (MQ=255) cTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGAt < 2:176049/150‑1 (MQ=255) gCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATgc > 2:235177/1‑150 (MQ=255) tCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATgccg > 1:70549/1‑150 (MQ=255) aCCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATgccgcc < 1:484813/150‑1 (MQ=255) ccGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACACTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATgccgccg > 2:5003766/1‑150 (MQ=255) cGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATgccgccgc < 1:4997096/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCt > 1:2222293/1‑150 (MQ=255) aCAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCtt < 1:3487380/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCttt < 1:3819437/150‑1 (MQ=255) ggTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGa < 1:2074943/150‑1 (MQ=255) gTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGAc > 2:2649849/1‑150 (MQ=255) tcggtttcggttTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACTGCCACCACATACGCCCGAAGCATAGGACAGTGAGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACg > 2:1165201/1‑150 (MQ=255) tcggtttcggttTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACg > 1:2016577/1‑150 (MQ=255) ggtttcggtttcGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCATCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGaa > 1:4521376/1‑150 (MQ=255) ggtttcgTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGa < 1:4637366/150‑1 (MQ=255) ggtttcgTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGa < 2:1568816/150‑1 (MQ=255) tttcgTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGc > 1:5079725/1‑150 (MQ=255) tttcgTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGc > 2:2993649/1‑150 (MQ=255) tttcgTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGc < 1:66266/150‑1 (MQ=255) | GTCTACGATCAGCTTCAGCTCGTGCAGGCACTCGAAGTAGGCCATTTCCGGCGCGTAGCCAGCTTCGACCAGGGTTTCGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGC > NC_002947/5318362‑5318660 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |