| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,340,020 | 0 | C | G | 7.3% | 402.9 / 16.9 | 124 | intergenic (+57/‑227) | PP_4696/PP_mr53 | nitrogen regulation protein NR(I)/CrcZ ncRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/64); new base G (4/5); total (55/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACATTTTGAACCTGC > NC_002947/5339871‑5340169 | gCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCgccgcc > 2:5024398/1‑150 (MQ=255) cACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGccgccc < 1:4436888/150‑1 (MQ=255) aCGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGccgcccg > 2:1314257/1‑150 (MQ=255) 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cAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGc > 2:4769158/1‑150 (MQ=255) cAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGc > 2:4769031/1‑150 (MQ=255) ccTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTa < 2:2406508/150‑1 (MQ=255) cTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTAc < 1:4883133/150‑1 (MQ=255) tATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACg < 2:3300025/150‑1 (MQ=255) tATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAAAGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCACACCTCCCGTAAAAATAATTTAAACAAGCTTTACGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACg > 1:784028/1‑150 (MQ=37) cggcgTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTaa < 1:2047625/150‑1 (MQ=255) cggcgTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTaa < 1:5089073/150‑1 (MQ=255) ggcgTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGGAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCGGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAAc < 2:560585/150‑1 (MQ=255) tGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGc < 1:2739670/150‑1 (MQ=255) tGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGc > 1:2743171/1‑150 (MQ=255) ggccGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTccc > 2:1517068/3‑123 (MQ=255) ggccGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTccc < 1:1517068/121‑1 (MQ=255) gccGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTCAAAGGCGCTGAACGTGTCAAGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCCTAAAAATATGTTACCCAAGCATTACGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAAATTCGACa > 2:1001109/2‑150 (MQ=37) gccGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCt < 1:723187/91‑1 (MQ=255) gccGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCt > 2:723187/2‑92 (MQ=255) cGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGGACCACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACAtt > 2:4320323/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACAttt < 2:4551744/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACAtttt > 2:1623850/1‑150 (MQ=255) gccgccCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACATTTTGaa > 2:1845234/1‑150 (MQ=255) ccgcccgcGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACATTTTGAAc < 1:2591184/150‑1 (MQ=255) ccgcccgcGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACATTTTGAAc < 2:4946196/150‑1 (MQ=255) | GCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACATTTTGAACCTGC > NC_002947/5339871‑5340169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |