| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,346,441 | C→T | 20.0% | intergenic (+46/‑132) | pgi‑II → / → acsA‑II | glucose 6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,346,441 | 0 | C | T | 20.0% | 137.2 / 31.2 | 72 | intergenic (+46/‑132) | pgi‑II/acsA‑II | glucose 6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/22); new base T (7/7); total (39/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.80e-01 | |||||||||||
GCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCA > NC_002947/5346292‑5346588 | gcaaggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGc < 2:2751633/150‑1 (MQ=255) aggGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAAc < 2:3219351/150‑1 (MQ=255) gggCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAAc > 2:3324894/1‑149 (MQ=255) gggCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAAc < 1:3324894/149‑1 (MQ=255) ggCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAAcgc < 1:1463155/150‑1 (MQ=255) tACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTAcc < 1:144039/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTa < 2:5304752/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCgg < 1:3448399/150‑1 (MQ=255) cGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAggcgggt < 1:112124/150‑6 (MQ=25) cGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAggcgggt < 1:3492351/150‑6 (MQ=25) cGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGt < 2:4575096/150‑1 (MQ=255) ggTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCAG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGGAGGAGCGGGtt > 2:4183504/1‑150 (MQ=255) gTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCgg < 1:2171408/146‑1 (MQ=255) gTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCgg > 2:2171408/1‑146 (MQ=255) tAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTa < 2:1979654/150‑1 (MQ=25) ccTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTAccc < 2:2217872/150‑1 (MQ=21) cTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTc < 2:2761463/131‑1 (MQ=255) cTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTc > 1:2761463/1‑131 (MQ=255) tGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:4587956/150‑1 (MQ=255) tGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:848547/150‑1 (MQ=255) aaGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 1:5144359/150‑1 (MQ=255) gACAGCGCCTAAGACGGTTCCACCCACGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCAGCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGAGTTAACGCGTTGCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:3375274/150‑1 (MQ=21) gACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACGTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 2:83669/150‑1 (MQ=255) aCAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCACTGGGCGGGGGAAACCCC‑‑CCACCCAGCCACCCCGTTACCACGAGGGGGGGGGTTTGCCCCCGacgg > 1:1891544/1‑147 (MQ=19) cAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGTGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg < 1:1677516/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGGTTCCACCCATGGCCTGATCAACTAGGGCGGGGGCCGTCACCGGGGTTGATCCGTGTTTGTGCCGGCCTCTGCGG‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAAGGGGTTACCTGGTTGGTGGGGGTTTCCCCGCGAAGAGG‑CCGGccc < 2:4832859/150‑1 (MQ=255) gAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCGCGTCGC‑GGGGGAACCCG‑‑CCGACCCGGCAACGCGTTACCTCGTGGGGGCGGGTTTTCCCGCGGAGGGG‑GCGGccc > 1:4823307/1‑150 (MQ=255) aaGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACCCGTTACCAAGTAGGAGCCGGTTTACCCCCGAAGAGG‑CCGGCCCa > 1:3572136/1‑150 (MQ=39) cGGTTCCACCCATGGCATGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGGGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGAAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGTGG‑CCGGCCCAGGtt < 2:4979188/150‑1 (MQ=38) cGGTTCCACCCACGGCCTTATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACGGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTGCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCCGGCAACGCGTTCCCTCGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGtt < 2:5444794/150‑1 (MQ=38) ggTTCCACCCAAGGCCTTATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGTTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCATCTTCGC‑GGTTAAACCCG‑‑CCTACCAGGAAACGCTTTACCTCGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTg < 2:2244991/150‑1 (MQ=38) ccAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGGAAAACCG‑‑CCTACCAGGCCACCCCGTACCACGGAGGAGCGGGGTTTACCGCGAAGAGG‑CCCGCCCACGTTGAAAAcccc > 1:886098/1‑148 (MQ=255) tGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCgg > 1:4195297/1‑104 (MQ=255) tGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCgg < 2:4195297/104‑1 (MQ=255) gtaTCAACTCCTCCCGCGGCCGTCACCGGGGTTTATCCGCGCTTGGCCCGGCCACGTCGC‑GGTAAAACCCG‑‑CCAACCCGGCAACGGGTTACCTCGTAGGCGCGGTTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCCCCCACCt < 2:3572136/148‑1 (MQ=255) gATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAggcgggt > 1:351423/1‑100 (MQ=17) gATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAggcgggt < 2:351423/105‑6 (MQ=17) gATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACCC‑‑CCGACCAGGCAACGCGGTTACACGTAGGCGCGGGGTTACCCCCGGAGAGG‑CCGGCCCAGGGTGAACACCGCGCCCAGcga > 1:2221786/1‑148 (MQ=255) aaCTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACt > 2:2233920/1‑150 (MQ=255) cGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACAGTCTTATCGAATAGc > 2:3623106/1‑150 (MQ=255) cGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCGTACC‑GGGTTAACCCC‑‑CCAACCAGGCCACCCCGTACCCCGTAGGGGCGGGGTTTCCCCCCAAGAGGCCCGGCCCGGGTT‑AACCCCGCTCCCACCGACACAGTCTTAAAGAATAGc > 2:2959779/1‑150 (MQ=255) cgGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCGTCGC‑GGGTAAAACCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGGAGGACCGGGGTTACCCCCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGGTGAACACCGCACCCAGCTACACAGTCTTATCGAAGAGCCGGTGCAg > 2:4475626/1‑150 (MQ=255) tCCGAGCTTGTGCCGGCCTCGTCGC‑GGGGAAAACCC‑‑CCGAACACGCCACCCGGTACCACCGAGGGGCGGGTTTAACCCCGCACAGG‑CCCGCCCCCGGTGTACACCCCACCCCCCAACACAGGCTTATCGAAAAGCCGGTGCAGTACaacc > 2:696842/1‑147 (MQ=255) ttGTGCCGGCCTCTTAGC‑GGGTAAACCCC‑‑CCAACCAGGCAACGCCTTAACTCGTAGGAGCCGGTTTACCCCCGAAAAGG‑CCCGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTATTAACGAAAAACCGTTGCAGTCCATCGCCCCGTa > 2:1291994/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCGTCTTCGG‑GGGTAACCCCG‑‑CCTACCTGGCACGGGGTTCCCTCGTTGGCGGGGGTTTACCGGGGACGGGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACaa < 2:3780820/149‑1 (MQ=255) gCCTCTGCGG‑GGTAAAACCCG‑‑CATACCTGGAAACGCTTTACCTCTTTGTTGGGTTTTTACCCGCTAAGTGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCa < 2:1424298/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGG‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAAGGCGTTACGTGGTTGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAg < 2:3255662/150‑1 (MQ=39) tctTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAggc > 2:3175721/1‑149 (MQ=255) ttCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGacc > 2:2637770/1‑150 (MQ=255) cgc‑gGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGaccac > 2:478230/1‑150 (MQ=255) ggttAACCCCG‑‑CCTACCCGGCACCGCGTTACGTCGTCGGCGGGGTTTTCCCCGCTATGCGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCg < 1:2233920/147‑1 (MQ=255) gggTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCg > 1:1368915/1‑150 (MQ=255) ggTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGc > 2:3348225/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGcc > 1:4332888/1‑150 (MQ=21) gTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGcc > 2:1012599/1‑150 (MQ=255) ctAAACCCG‑‑CCACCCCGGAAACGGTTTACCTCGTTGGAGCGGGTTTACCGGGTATGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGcc < 2:4592796/149‑1 (MQ=255) aCCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGt > 1:1074599/1‑150 (MQ=255) aCCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGt > 1:4016776/1‑150 (MQ=255) cccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGGGCAGGACCACCCGCCATGtt > 1:2888797/7‑150 (MQ=25) ccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 1:5385930/6‑150 (MQ=25) ccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 2:5310536/6‑150 (MQ=25) ccgctccTACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 2:2437345/6‑150 (MQ=25) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 1:3693510/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc > 2:162846/1‑150 (MQ=255) ccG‑‑CCAACCCGGCACCGCGTTCCCGCTTTGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTc < 2:158979/150‑1 (MQ=255) g‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGa > 2:4991957/1‑150 (MQ=255) tACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTAc < 2:2460264/118‑1 (MQ=25) tACGAGGTAACGCGTTGCCTGGTAG‑‑GCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTAc > 1:2460264/1‑118 (MQ=25) aCCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATc > 2:411124/1‑150 (MQ=255) cAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCg > 1:4805984/1‑150 (MQ=255) ggCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCa > 2:768766/1‑150 (MQ=255) ggCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCa > 2:768793/1‑150 (MQ=255) ggCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCa > 2:768797/1‑150 (MQ=255) | GCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCG‑‑CCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG‑CCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCA > NC_002947/5346292‑5346588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |