Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,373,973 | G→C | 5.3% | intergenic (‑67/+30) | carB ← / ← carA | carbamoyl‑phosphate synthase large subunit/carbamoyl‑phosphate synthase small subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,373,973 | 0 | G | C | 5.3% | 627.3 / 18.3 | 188 | intergenic (‑67/+30) | carB/carA | carbamoyl‑phosphate synthase large subunit/carbamoyl‑phosphate synthase small subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (99/78); new base C (5/5); total (105/83) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.53e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
TCGCAGGCCTGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTCGGTACGCTCGAT > NC_002947/5373824‑5374122 | gCAGGCCTGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTg > 1:1483385/1‑150 (MQ=255) cAGGCCTGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGc < 2:3058634/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGcc > 1:576040/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCg < 1:4007396/150‑1 (MQ=255) tggcccGATCGTGATC‑GGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑Gccc > 2:1668589/5‑150 (MQ=255) tGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑Gccc < 1:3034858/150‑1 (MQ=255) tGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGC‑CGGCACCTGCCgcgccc < 2:2815083/150‑6 (MQ=255) gCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCgg < 1:399567/150‑1 (MQ=255) gCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCgg < 1:2328760/150‑1 (MQ=255) gCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGGTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCACGCCGCGTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCgg > 2:2200935/1‑150 (MQ=255) cGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCgggg < 2:1922740/150‑1 (MQ=255) gATCACGATCGGTCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGc < 2:249665/150‑1 (MQ=255) gATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGc < 2:5066107/150‑1 (MQ=255) aTCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGC‑CGGCACCTGCCGCGCCCggcagc < 2:2381181/150‑5 (MQ=255) tCACGCCCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTGGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGTGCCt < 2:4817837/150‑1 (MQ=255) cACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCtt < 2:1225485/150‑1 (MQ=255) gtgatcggCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGc < 2:4363862/128‑1 (MQ=255) gtgatcggCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGc > 1:4363862/7‑134 (MQ=255) 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gCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGa > 1:1017519/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGa > 1:415647/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGaa < 2:3329522/142‑1 (MQ=255) gcCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCa > 2:4183323/1‑150 (MQ=255) tCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCt > 1:3906580/1‑150 (MQ=255) ggATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTgg > 2:288830/1‑150 (MQ=255) gATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGc > 1:4380207/1‑150 (MQ=255) tGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCa < 1:4132707/150‑1 (MQ=255) ttttGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATgg > 2:1227299/1‑150 (MQ=255) ttttGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATgg > 1:1461457/1‑150 (MQ=255) ttttGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATgg > 1:3070578/1‑150 (MQ=255) ttttGATGTCTGGACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGc < 2:4139489/123‑1 (MQ=255) tGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGC‑CGGCACCTGCCgcgccc < 1:3016969/107‑6 (MQ=255) tGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGC‑CGGCACCTGCCgcgccc > 2:3016969/1‑102 (MQ=255) cTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGa < 2:5176303/150‑1 (MQ=255) tGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGTGAAGGCGATGCCGGGCGCGCCAGTTGCCG‑CCCCGGGCCCTGGAGGCGGGATCATCGCCGGCGCTTGGCAATGGCAACGGTGaa > 1:2841518/1‑150 (MQ=255) 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2:2450450/150‑1 (MQ=255) cTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTg < 1:3512116/150‑1 (MQ=255) ttGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGc > 1:1316732/1‑150 (MQ=255) ttGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGc < 1:4782742/150‑1 (MQ=255) gAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGccc < 2:3499664/150‑1 (MQ=255) aaCAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCt < 2:1636986/150‑1 (MQ=255) cAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTgg < 1:1824615/150‑1 (MQ=255) cAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTgg < 2:4259776/150‑1 (MQ=255) tCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAg < 2:4656104/150‑1 (MQ=255) tGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCt < 2:850514/150‑1 (MQ=255) tGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCt < 1:31961/150‑1 (MQ=255) tGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCAAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCt < 2:4263406/150‑1 (MQ=255) gggTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTg > 2:1096613/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGGGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGaa < 2:5418173/150‑1 (MQ=255) gTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGaa > 1:3329796/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAAc < 1:2230981/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAAc > 1:2308877/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCTGCCGGGCGCGACAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTc < 1:3736475/128‑1 (MQ=255) ggCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAAcgcg > 1:820168/1‑150 (MQ=255) cgcTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGct > 2:2973657/1‑150 (MQ=255) cgcTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGct < 2:3973475/150‑1 (MQ=255) gcTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGctc < 1:4817192/150‑1 (MQ=255) gcTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGctc > 2:3747238/1‑150 (MQ=255) cccGGGC‑CGGCACCTGCCGCGCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCAt < 2:2115190/61‑1 (MQ=21) ccGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGt < 2:566579/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTc > 1:2581377/1‑150 (MQ=255) aGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTCGGTACGCTCg > 1:2474812/1‑150 (MQ=255) aGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTCGGTACGCTCg > 2:4699501/1‑150 (MQ=255) ggTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTCGGTACGCTCGa > 1:54395/1‑150 (MQ=255) ggTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTCGGTACGCTCGa > 1:3602666/1‑150 (MQ=255) gTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCGTGTCGGTACGCTCGAt > 2:4436199/1‑150 (MQ=255) | TCGCAGGCCTGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTCGGTACGCTCGAT > NC_002947/5373824‑5374122 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |