| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 344,665 | T→A | 5.9% | E314V (GAG→GTG) | mutY ← | A/G‑specific adenine glycosylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 344,665 | 0 | T | A | 5.9% | 613.4 / 16.0 | 184 | E314V (GAG→GTG) | mutY | A/G‑specific adenine glycosylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (69/104); new base A (7/4); total (76/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
GCGGCACATCACGGTGCGGGTCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCA > NC_002947/344518‑344812 | gCGGCACATCACGGTGCGGGTCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCg > 1:3641359/1‑150 (MQ=255) ggCACATCACGGTGCGGGTCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGcc < 2:4185967/150‑1 (MQ=255) gCACATCACGGTGCGGGTCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCg > 1:4013602/1‑150 (MQ=255) 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gcctcggccACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTgg < 2:4135680/150‑1 (MQ=255) ctcggccACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGCCCAGCTCGACGACCTggcc < 1:4044888/150‑3 (MQ=255) ctcggccACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGCCCAGCTCGACGACCTggcc < 1:2018638/150‑3 (MQ=255) tcggccACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCg > 1:4821268/1‑150 (MQ=255) ggccACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGa < 2:2051568/68‑1 (MQ=255) gccACGTGCTCGCCGCCCGGGTCGACGTGCACGAGCCCTGGCTCGCACGCCAGCCGGAAGTGGCGGAAGGTATGGGTCAGGCCGGCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGGCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATg < 2:179225/150‑1 (MQ=255) ccACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGGAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATgt > 1:4430126/1‑150 (MQ=255) tcGTGCACGTCGACCCGGTCGGCGAGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATgtcg > 2:363368/2‑150 (MQ=255) tcGTGCACGTCGACCCGGTCGGCGAGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATgtcg > 2:1196073/2‑150 (MQ=255) gTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATgtcgtc > 2:2648167/1‑150 (MQ=255) gTGCACGTCGACCCGGTCGGCGAGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATgtcgtc > 2:4482658/1‑150 (MQ=255) gTGCACGTCGACCCGGTCGGCGAGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATgtcgtc > 2:4482578/1‑150 (MQ=255) tGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTcc < 2:5355317/150‑1 (MQ=255) tGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTcc < 2:875460/150‑1 (MQ=255) | GCGGCACATCACGGTGCGGGTCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCA > NC_002947/344518‑344812 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |