Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,448,259 | T→G | 14.4% | L145R (CTG→CGG) | thiE → | thiamine‑phosphate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 5,448,259 | 0 | T | G | 14.4% | 269.6 / 3.7 | 152 | L145R (CTG→CGG) | thiE | thiamine‑phosphate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (67/53); new base G (20/6); total (92/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.07e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CTCGGCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAC > NC_002947/5448111‑5448409 | cTCGGCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCCGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATGCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGGCGGCCTg > 2:3311145/1‑150 (MQ=255) tCGGCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGc > 1:1200447/1‑150 (MQ=255) tCGGCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGc < 1:5293637/150‑1 (MQ=255) ggCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTc > 1:2526740/1‑150 (MQ=255) gCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCg < 1:3185199/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGa < 1:4951614/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGa < 1:1669000/150‑1 (MQ=255) cGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGACGGCCTGCTCGAg < 2:2206737/150‑1 (MQ=255) atgggCAAGCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCa > 2:2567934/4‑150 (MQ=255) cAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAg < 2:2584562/150‑1 (MQ=255) aGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGGGCCgg > 1:1749719/1‑150 (MQ=255) ggCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGc < 2:14048/150‑1 (MQ=255) cgCAATAATCGTCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGATTCTTCAATTCTGTCACCAACCCGTGCGCGCCCGCTGCCAAAGTCGGCCTTCTCGACCAGGc < 2:598913/149‑1 (MQ=255) aaTCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCcg > 2:3885727/1‑150 (MQ=255) atcatcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCAGCTCGAGCAGGTCcgc > 1:4244506/1‑150 (MQ=255) tcatcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGGCTGCGCGAGCAGGCCcgcg > 1:1383227/1‑150 (MQ=255) tcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGccc > 2:873745/1‑150 (MQ=255) tcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGccc < 2:4395926/150‑1 (MQ=255) cGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCa > 2:1015895/1‑150 (MQ=255) cGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCa < 2:4411676/150‑1 (MQ=255) ggCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCGGGGCGCGCCCGCGGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAg < 2:5004466/150‑1 (MQ=255) tCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTg > 1:4907676/1‑150 (MQ=255) cACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGaa > 2:4859947/1‑150 (MQ=255) ccTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCCAGCAGGCCCCCCCCCAGGTGAAAc > 2:5114531/1‑150 (MQ=255) cggCCACGCCTGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACt < 2:4138786/148‑1 (MQ=255) cTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCCGGCCCCCGCCCAGGTGGAAcg > 1:838607/1‑149 (MQ=255) cACGCCAGCCTCGAACGGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCg < 2:2155224/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATc < 2:5265859/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATc > 1:4856624/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCCCCCAGGGGAAACAGCCGAGCg > 1:5234355/1‑150 (MQ=255) aGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGcc > 1:4084520/1‑150 (MQ=255) aGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCCCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGcc < 2:1202986/150‑1 (MQ=255) aGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCACCGGAAACAGCCCAACGcc > 1:1484922/1‑150 (MQ=255) ccTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGGCGGCGCGGGCAGGCCCGCGCCCCCGGGAAAATGCCGAACGccca > 1:1148621/1‑148 (MQ=255) cTCGAACTGGCCGCCCGGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCCGGTGGAACAGCCGCTCGCCGTg > 1:2145039/1‑150 (MQ=255) cTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTg > 2:1503799/1‑150 (MQ=255) cTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGGGGAACTGCCGATCGCCggg > 2:109795/1‑148 (MQ=255) cTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGGGAAACTGCCGATCGCCggg > 2:109768/1‑148 (MQ=255) cTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGACACCAAGCCGGGCGCGCCCGCAGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCCAACGACGTg > 2:2465022/1‑150 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGCGCCCGCCCGCGCCCCGGGGCAACTGCCGAGCGCCGGGa > 1:390839/1‑150 (MQ=255) aCTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCgg > 2:357121/1‑150 (MQ=255) aCTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGCCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCGGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCgg < 2:3427208/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGACGGCGCCAGCTACGTGGCCTTGGGCCGCTACTTCAATTCTGCCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGGCGGCCTGCTCGCCCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGt < 1:2699488/150‑1 (MQ=255) gccgccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGTCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCCCCCCCACGTGAAAATGCCGCTCGCCCTGGTCGGTGGc > 1:1431828/1‑150 (MQ=255) cccAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCCCCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCa < 2:4524800/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTGCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAACCTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGccgcccc > 2:4397880/1‑144 (MQ=255) gCTGCCCGCGATGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCATTTCTGTCACCACGCCGGGGGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTc < 2:390839/150‑1 (MQ=255) gCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTc > 2:4513726/1‑150 (MQ=255) 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ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCAGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGCTCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCGACctgcag > 2:4174197/1‑148 (MQ=255) tcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTgg > 1:4936542/1‑150 (MQ=255) ttccTGCCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCCCTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCgg < 2:2320625/147‑1 (MQ=255) tCACCCCGCCGGGCGCGCCCGCGGCCCCCGCCGGCCGGCCCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATcc < 1:3784303/150‑1 (MQ=255) aCCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCAc > 2:4978692/1‑150 (MQ=255) 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aaGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCGCGGc > 1:378979/1‑150 (MQ=255) aGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACCACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACCGCGCCGCCCGGCTGGCGGGGATCCACGGCt > 1:3304088/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCGCGCCCGCGGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCtt < 2:1148621/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCGCGCCCGCCGCCTCCGTCGGCCCGCTCGAGCAGGCCCGCGCCAAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCTCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCtt < 1:3399273/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCCGCGGCCCACGTCGGCCTGCTCGCCCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCg < 1:2791793/150‑1 (MQ=255) gcCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGc > 1:2914850/1‑150 (MQ=255) cccGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGcc < 1:4994272/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGAGCGCCGGGAGCGGTGGCATCACCCGCGACAACGCCGCCCCCCGGGTCGCCCACGGCGCCGACCGGCGGGCGGTGATCCACGGCTTGGTCGGTGCCg > 1:1863146/1‑150 (MQ=255) cgcccACCGCCGGCCTGCCCGCCCCGCCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACa < 1:630139/147‑1 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 2:5395816/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 1:491736/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 2:3782488/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 2:3782336/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCGTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 2:3809510/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCGCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc > 2:2407164/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCa > 1:1490841/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCTCCCGCCGGGCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGACGACTGCGCTCAGGaa < 2:1197675/150‑1 (MQ=255) ccTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGt > 2:1077028/1‑130 (MQ=255) ccTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGt < 1:1077028/130‑1 (MQ=255) ccTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGt < 2:1490841/150‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCa > 2:2885265/1‑150 (MQ=255) tGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACT‑GTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAc > 1:393741/1‑150 (MQ=255) | CTCGGCCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAC > NC_002947/5448111‑5448409 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |