| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,681,112 | 0 | A | G | 5.7% | 554.5 / 14.0 | 174 | D255G (GAC→GGC) | bioA | adenosylmethionine‑‑8‑amino‑7‑oxononanoate aminotransferase BioA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (94/70); new base G (7/3); total (101/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GCAGACCCTGGCCGAACACCACGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTACCAG > NC_002947/5680963‑5681260 | gCAGACCCTGGCCGAACACCACGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCacga > 2:3608620/1‑150 (MQ=255) cAGACCCTGGCCGAACACCACGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCacgac > 1:2959000/1‑150 (MQ=255) aGACCCTGGCCGAACACCACGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCacgacg < 2:4803976/150‑1 (MQ=255) 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gacgaGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTACCAg > 1:4912697/1‑150 (MQ=255) | GCAGACCCTGGCCGAACACCACGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTACCAG > NC_002947/5680963‑5681260 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |