| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 5,681,116 | G→T | 5.3% | E256D (GAG→GAT) | bioA → | adenosylmethionine‑‑8‑amino‑7‑oxononanoate aminotransferase BioA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,681,116 | 0 | G | T | 5.3% | 605.6 / 14.1 | 182 | E256D (GAG→GAT) | bioA | adenosylmethionine‑‑8‑amino‑7‑oxononanoate aminotransferase BioA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (101/71); new base T (7/3); total (108/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
CCTGGCCGAACACCACGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTACCAGGCGTT > NC_002947/5680969‑5681265 | ccTGGCCGGACACCACGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGAt > 1:18741/1‑150 (MQ=255)ccTGGCCGAACACCACGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGAt > 1:1811056/1‑150 (MQ=255) gCCGAACACCACGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGATCGcc > 2:855706/1‑150 (MQ=255) 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cacGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGGCGATCTCGTCGTggataag < 1:545912/150‑6 (MQ=255) cacGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGATCGCCGTGGGCTTc > 2:1939183/1‑150 (MQ=255) acGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGTGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGGGTCCCTCAAGTTGTGGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGATCGCCGTGGGCTTCg > 1:198604/1‑150 (MQ=255) acGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGATCGCCGTGGGCTTCg < 2:3776050/150‑1 (MQ=255) tCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGc > 2:780431/1‑150 (MQ=255) 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ttATCCACGACGAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAgg > 1:5366820/1‑150 (MQ=255) tCCACGACGAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGgtgt > 1:4117460/1‑150 (MQ=255) cccACGGCGATCTCGTCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGgtgt > 2:5283683/2‑150 (MQ=255) ccACGACGAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTa > 1:1028522/1‑150 (MQ=255) acgacgAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTAcc > 1:2242776/1‑150 (MQ=255) acgacgAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTAcc > 1:2953333/1‑150 (MQ=255) acgacgAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTAcc > 2:1099/1‑150 (MQ=255) gacgaGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTACCAg > 1:4912697/1‑150 (MQ=255) gaTCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTACCAGGCGtt < 2:329174/150‑1 (MQ=255) gaTCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCACTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTACCAGGCGtt < 1:29987/150‑1 (MQ=255) | CCTGGCCGAACACCACGCCTCGATCAGCGCCGTGATCGTCGAGCCGCTGATACAGGGTGCCGGTGGCATGCGCATGTACCACCCGGTGTACCTCAAGTTGTTGCGCGAGGCCTGCGACCGCTATGACGTGCACCTTATCCACGACGAGATCGCCGTGGGCTTCGGCCGCACCGGCACGATGTTCGCCTGCGAGCAAGCCGGCATCCGCCCGGATTTCCTGTGCCTGTCCAAGGCCCTGACCGGCGGCTACCTGCCGCTGGCCGCCTGCCTGACCACCGACAAGGTGTACCAGGCGTT > NC_002947/5680969‑5681265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |