Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,686,772 | C→T | 5.8% | S700N (AGC→AAC) | PP_4988 ← | signal transduction histidine kinase CheA/CheY‑like receiver |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,686,772 | 0 | C | T | 5.8% | 646.3 / 18.9 | 207 | S700N (AGC→AAC) | PP_4988 | signal transduction histidine kinase CheA/CheY‑like receiver |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (92/103); new base T (6/6); total (98/109) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
CCAGAGCGTCACGCTGGCCGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCAGCCATTCCATTTCGGCCATTTG > NC_002947/5686623‑5686920 | cAGAGCGTCACGCTGGCCGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGTGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCt > 2:159013/1‑150 (MQ=255) cAGAGCGTCACGCTGGCCGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGTGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCt > 2:17024/1‑150 (MQ=255) cAGAGCGTCACGCTGGCCGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCt > 2:3883631/1‑150 (MQ=255) agagCGTCACGCTGGCCGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTg < 2:1442922/150‑1 (MQ=255) agagCGTCACGCTGGCCGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTg > 1:4399330/1‑150 (MQ=255) gTCACGCTGGCCGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAg > 1:2989313/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGCCGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAggc < 1:1024175/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAggcggc < 2:4221933/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGAGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCa > 1:2542968/1‑150 (MQ=255) gCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACgg > 1:513135/1‑150 (MQ=255) cTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGc > 2:4996561/1‑150 (MQ=255) tGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGcc < 2:4627441/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTg < 2:4470779/150‑1 (MQ=255) tgctgcCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTgg > 2:2915440/1‑150 (MQ=255) tgctgcCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTgg < 1:3095832/150‑1 (MQ=255) tgctgcCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCCGTGGACCGCCGCCTgg < 1:3316843/150‑1 (MQ=255) gcCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGTTGGCCAGGCCGTGGACCGCCGCCTgg > 2:591883/1‑146 (MQ=255) gcCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGTTGGCCAGGCCGTGGACCGCCGCCTgg < 1:591883/146‑1 (MQ=255) gcCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCaa < 1:1498192/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAAc < 2:1260432/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAAc > 1:3027409/1‑150 (MQ=255) aGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCt > 1:510940/1‑150 (MQ=255) gcgACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGTTGGCCAGGCCGTGGACCGCCGCCTGGCCAGCCTGca > 1:5112580/1‑149 (MQ=38) cgACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTc < 2:3122008/150‑1 (MQ=255) gACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTgg > 1:462893/1‑138 (MQ=255) caacaaCGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGTTGGCCAGGCCGTGGACCGCCGCCTGGCCAGCCTGcatgaa < 2:5112580/150‑6 (MQ=37) aacaacGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATc > 2:4880552/1‑150 (MQ=255) acaacGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCa < 1:1260848/150‑1 (MQ=255) caacGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAg > 2:855188/1‑150 (MQ=255) caacGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAg > 2:1519137/1‑150 (MQ=255) caacGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGACCAg > 2:2724897/1‑150 (MQ=255) tctcTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCcg > 2:2672220/1‑150 (MQ=255) ctctGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCcgc < 2:3318778/150‑1 (MQ=255) tctGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCcgcg < 2:4210292/150‑1 (MQ=255) ctGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCgg > 1:542302/1‑150 (MQ=255) tGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGc > 1:1933401/1‑150 (MQ=255) gCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCt > 1:5059291/1‑130 (MQ=255) cATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCAc > 2:2824871/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCAGCgg < 1:260155/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCggg < 1:690131/150‑1 (MQ=255) gCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCggggg > 2:5054015/1‑149 (MQ=255) gATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATggc < 1:4698156/150‑1 (MQ=255) gATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATggc < 2:2652799/150‑1 (MQ=255) catggcatggGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAg > 1:4809223/1‑150 (MQ=255) catggcatggGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAg > 1:3690106/1‑150 (MQ=255) atggcatggGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAgg > 2:5087590/1‑150 (MQ=255) atggcatggGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAgg < 1:3679702/150‑1 (MQ=255) tggcatggGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAggg > 1:1256093/1‑150 (MQ=255) atggGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGt > 1:2301147/1‑150 (MQ=255) gggCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGttg < 2:691076/150‑3 (MQ=255) gggCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGc < 1:924799/150‑1 (MQ=255) gggCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGc < 2:1554509/150‑1 (MQ=255) gggCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGc > 2:4325459/1‑150 (MQ=255) 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cAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATc < 1:2686072/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATc > 2:2596241/1‑150 (MQ=255) ggAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGa < 1:2780239/150‑1 (MQ=255) ggAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACACTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGa < 2:517882/150‑1 (MQ=255) tGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTgcg > 2:1183889/1‑150 (MQ=255) ggCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGc > 1:1910636/1‑94 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cGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGaacaac < 1:5005097/150‑1 (MQ=255) tgcGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACcgcg > 2:5325346/1‑150 (MQ=255) gcGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCgcgc < 2:3485197/150‑1 (MQ=255) gcGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCgcgc < 2:750499/150‑1 (MQ=255) cggccggcATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCa > 2:5218788/1‑150 (MQ=255) gccggcATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGc < 1:4047060/150‑1 (MQ=255) ggcATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTc > 1:4867233/1‑150 (MQ=255) gcATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCCGCCTcc > 1:3511992/1‑150 (MQ=255) cATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGTTGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCTGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCa < 1:1519137/150‑1 (MQ=255) cATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCa < 1:855188/150‑1 (MQ=255) cATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCa < 2:2174015/150‑1 (MQ=255) cATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCa < 1:3883631/150‑1 (MQ=255) tGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCAGc < 2:183488/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCAGccat > 2:3862466/1‑150 (MQ=255) cGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCTGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCAGccattc < 1:4197380/150‑1 (MQ=255) cGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCAGccattc > 2:3640353/1‑150 (MQ=255) tCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCAGCCATTCCATTTCg < 2:1933401/150‑1 (MQ=255) tCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCAGCCATTCCATTTCg < 1:17024/150‑1 (MQ=255) tCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCAGCCATTCCATTTCg < 1:159013/150‑1 (MQ=255) cgagCAGGTTGGCCAGGCCGTGGACCGCCGCCTGGCCAGCCTGCATGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGc > 2:4286514/4‑130 (MQ=25) 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CCAGAGCGTCACGCTGGCCGGGCTGTTGCTGCCAGCGCGACAACAACGTCTCTGCATCGAGCAGGATGTCCATGGCATGGGCCAGGAAGCTGGCGACCAACTGCGGATCACGCTTGCTGCGGCCGGCATGGTGCGGGTCTTCATGCAGGCTGGCCAGGCGGCGGTCCACGGCCTGGCCAACCTGCTCGATCAGTTCCGCGGCACCGGGGATGGCGGCCAGGGGCGTGCTATCGAGTTGCGCCAAGCCCAGATGGAACAACGACCGCGCAGCCTCCAGCCATTCCATTTCGGCCATTTG > NC_002947/5686623‑5686920 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |