Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,700,770 | G→A | 6.6% | intergenic (+82/‑85) | hslU → / → PP_5002 | protease HslVU ATPase subunit/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,700,770 | 0 | G | A | 6.6% | 276.4 / 6.9 | 91 | intergenic (+82/‑85) | hslU/PP_5002 | protease HslVU ATPase subunit/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/44); new base A (2/4); total (43/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 |
CGGCGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGCCTCA > NC_002947/5700621‑5700912 | cggcgTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCgggg < 1:1460785/150‑1 (MQ=255) cggcgTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCgggg < 1:2032371/150‑1 (MQ=255) gCGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgc > 1:1198048‑M2/1‑148 (MQ=255) gCGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgc > 1:940966‑M2/1‑148 (MQ=255) gCGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgc > 1:3766111‑M2/1‑148 (MQ=255) tATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcggg < 1:1311098‑M2/150‑6 (MQ=255) tATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcggg > 1:4938381‑M2/1‑145 (MQ=255) tATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcggg > 1:2203543‑M2/1‑145 (MQ=255) aTGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggc > 2:3373072‑M2/1‑144 (MQ=255) aTGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggc > 2:3373113‑M2/1‑144 (MQ=255) tgAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttg > 2:2246875‑M2/1‑141 (MQ=255) gAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgc > 1:461153‑M2/1‑140 (MQ=255) gAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgc > 2:418626‑M2/1‑140 (MQ=255) aaCAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcc > 1:734502‑M2/1‑139 (MQ=255) aCAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTGGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgccc > 1:3354560‑M2/1‑138 (MQ=255) ccACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcaagcccgccc > 1:1548838‑M2/1‑134 (MQ=255) aCCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTGGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAag < 1:3113938/150‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGGGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTTTGGTGATCCGTGGGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAaga < 2:3741497/150‑1 (MQ=255) gaacaTAACGAACACCTGTCGCTTTACTTTCTTTAAGACCGGTTT‑CGACCGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACACCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGGGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAAtcc < 1:815300/148‑1 (MQ=255) acaGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGACAAGCCCCCTCCAGCACGCGGCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGTTACGTGCGGGGGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAAtacct > 1:1292165/1‑150 (MQ=255) gAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACACCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAAtccctccc < 2:398350/150‑1 (MQ=255) gcTGTCGGTTTACATTGTTTATGACGGTTTT‑CGAATGTTTGGCGGGAATGCCGGCTCCTGCAGGGGCCACCACAACCGGTGGGCCTGTGGTGTTGCGTGGGGGGGGGGGGTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCt < 1:4846080/149‑1 (MQ=255) gTTACTTTCTTTAAGACGGGTTT‑GGACTGTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCATTGGGCGTGTGGTTTTCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCtg < 2:231172/150‑1 (MQ=255) cATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACACCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCt < 2:3335446/150‑1 (MQ=255) cTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTccat < 2:1721480/150‑1 (MQ=255) ctgtactccGGTTTCCGACAGTTGGGGGGGCACCCCGGCCCGGGCCCGCCCCACCAAACCCCGGGGGCCGGGGGTGACCGGGGGGGGGGCGGGGTGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTtcat < 1:2887004/143‑1 (MQ=255) gTATGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCGTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTtcatca < 2:3434903/150‑1 (MQ=255) gTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCCCACCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTtcatca < 2:4710398/150‑1 (MQ=255) gTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACACCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTtcatca < 1:4871708/150‑1 (MQ=255) gACCGGTTT‑CGACTGTTGCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCCCAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTc < 1:4060187/150‑1 (MQ=255) gACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCCCGCCAGCACCCGCCACCACAAACCAAGGGGCGGTGGTGTTCCCGGCGGGGGCGGGCGTGCCCCCGCAAAGGCCCATTTATCCCACCCCCAAAAACAGGAAACAGTGCGtcaaaaccac > 2:1302565/1‑143 (MQ=255) ccGGTTT‑CGACAGGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACCACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTccc < 2:5063572/150‑1 (MQ=255) ggTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCga < 2:433589/150‑1 (MQ=255) cGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcg < 1:4477155‑M2/76‑4 (MQ=255) cGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcg > 2:4477155‑M2/1‑73 (MQ=255) gccAGTTTCGCGGGCACGCCCGCACCGCCACGCGCCACCACACCCCTTGGGCCTGTGGTTAACCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGAtt < 1:3603861/148‑1 (MQ=255) aGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCCCCACCACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATCAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTg < 2:4404405/150‑1 (MQ=255) tttCGCGGGCAAGCCCGCACCTTCACGCGCCACCAAAAACCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCCAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCAGGAAGCTGTGCTTCAACAGCTCCCGAGAGAATCTggc > 2:2924422/1‑148 (MQ=255) tCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCCCGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCa < 2:1428562/150‑1 (MQ=255) acgCCCGCTCCTCCCCGCGCCACCACACCCCGTGGGCGTGTGGTTAGCGGTGGGGGGGCGGGGTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgc < 1:88075/148‑1 (MQ=255) 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gCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCAAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcct > 1:3502301/1‑150 (MQ=255) gCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGCGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcct < 2:4046019/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcctg < 2:3940708/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcctg > 1:1000150/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatac < 2:3617077‑M2/150‑98 (MQ=255) ccGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcctgc > 2:3309343/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacg < 2:1607712‑M2/150‑99 (MQ=255) gCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgc < 1:3487822‑M2/150‑100 (MQ=255) gCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCgcctgcct > 2:4962075/1‑150 (MQ=255) tCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccg < 2:1095031‑M2/150‑102 (MQ=255) 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accacAACCCTTGGGCCGGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTg < 2:1487900/150‑1 (MQ=255) cacaCCCCTGGGGCCTGGGGTGTGCCGTGGGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGca < 1:125030/150‑1 (MQ=255) cacaACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgtcgatctggatcg < 2:3664785‑M2/150‑117 (MQ=255) ccacccgttGGGCGGGGGGTGATCCGGGGGGGGGGGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGcac < 1:3276093/143‑1 (MQ=255) acaACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGcac > 1:428951/1‑150 (MQ=255) 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cTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGcc > 2:4456850/1‑150 (MQ=255) cTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGcc > 1:2322458/1‑150 (MQ=255) gggttgtgGTGGCGCGTGCAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCa > 1:383158/5‑150 (MQ=38) gCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCaa < 2:3082967/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGGTGATCCGTGCAGGAgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgtcgatctggatcggcgcttcgtcat > 2:2022197‑M2/1‑22 (MQ=255) gttgtgGTGGCGCGTGCAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAg < 2:1538978/148‑1 (MQ=38) cTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGa > 1:2861042/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCga > 2:62483/1‑91 (MQ=255) tgtgGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCga < 1:62483/91‑1 (MQ=255) tgtgGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGAc > 1:3413308/1‑150 (MQ=255) tggtgATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGAccc > 1:219806/1‑150 (MQ=255) tggtgATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGAccc < 2:4070991/150‑1 (MQ=255) gtgATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTc > 2:1228310/1‑150 (MQ=255) tgATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCa > 1:2043220/1‑150 (MQ=255) tCCGTGGGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGcc < 2:504372/150‑1 (MQ=255) tCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGcc > 2:4576405/1‑150 (MQ=255) ccGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCACATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGACTCCAAGACCCTCAGCCt > 2:759415/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGCCTCa < 2:1096165/150‑1 (MQ=255) | CGGCGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTT‑CGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACAACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGCCTCA > NC_002947/5700621‑5700912 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |