| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,721,236 | 0 | A | T | 5.1% | 579.3 / 13.6 | 175 | intergenic (+40/‑218) | PP_5020/PP_5021 | methyl‑accepting chemotaxis protein/methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (75/89); new base T (4/5); total (81/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
ATTTCCGACCAGACCTCGGCGGCCAGTGAGGAGACGGCCAGCTCCAGCGTGGAACTGGCGCGGTTGGGTACCCATTTGCAAGGGTTGGTTGGGCGGTTCAGGCTGTGATCTGAACTAGCGGTCGCCCGGTCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTAATGGGCCAAGCCGGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCATTGCCGCCGCGAAGAGACCGGCACAGGACGAAATATATCCTACTGTTCGCGGCGAATTTTCCTACTTGATTATCAGGTCAAGTCCTACAGCTCCGCT > NC_002947/5721089‑5721384 | tttCCGACCAGACCTCGGCGGCCAGTGAGGAGACGGCCAGCTCCAGCGTGGAACTGGCGCGGTTGGGTACCCATTTGCAAGGGTTGGTTGGGCGGTTCAGGCTGTGATCTGAACTAGCGGTCGCCCGGTCGGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 1:938236/1‑150 (MQ=255) ttCCGACCAGACCTCGGCGGCCAGTGAGGAGACGGCCAGCTCCAGCGTGGAACTGGCGCGGTTGGGTACCCATTTGCAAGGGTTGGTTGGGCGGTTCAGGCTGTGATCTGAACTAGCGGTCGCCCGGTCGGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc > 1:4425238/1‑150 (MQ=255) aCCAGACCTCGGCGGCCAGTGAGGAGACGGCCAGCTCCAGCGTGGAACTGGCGCGGTTGGGTACCCATTTGCAAGGGTTGGTTGGGCGGTTCAGGCTGTGATCTGAACTAGCGGTCGCCCGGTCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 1:4747920/147‑1 (MQ=255) 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ttCGCGGGTAAACCCGCTAATGGGCCAAGCCGGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCATTGCCGCCGCGAAGAGACCGGCACAGGACGAAATATATCCTACTGTTCGCGGCGAATTTTCCTACTGGATTATCAGGTCAAGTCCTACa > 1:4396330/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTAATGGGCCAAGCCGGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCATTGCCGCCGCGAAGAGACCGGCACAGGACGAAATATATCCTACTGTTCGCGGCGAATTTTCCTACTTGATTATCAGGTCAAGTCCTACAGCTcc > 2:2876984/1‑150 (MQ=255) tAAACCCGCTAATGGGCCAAGCCGGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCATTGCCGCCGCGAAGAGACCGGCACAGGACGAAATATATCCTACTGTTCGCGGCGAATTTTCCTACTTGATTATCAGGTCAAGTCCTACAGCTCCGCt < 2:1002465/150‑1 (MQ=255) tAAACCCGCTAATGGGCCAAGCCGGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCATTGCCGCCGCGAAGAGACCGGCACAGGACGAAATATATCCTACTGTTCGCGGCGAATTTTCCTACTTGATTATCAGGTCAAGTCCTACAGCTCCGCt < 2:1663477/150‑1 (MQ=255) | ATTTCCGACCAGACCTCGGCGGCCAGTGAGGAGACGGCCAGCTCCAGCGTGGAACTGGCGCGGTTGGGTACCCATTTGCAAGGGTTGGTTGGGCGGTTCAGGCTGTGATCTGAACTAGCGGTCGCCCGGTCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTAATGGGCCAAGCCGGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCATTGCCGCCGCGAAGAGACCGGCACAGGACGAAATATATCCTACTGTTCGCGGCGAATTTTCCTACTTGATTATCAGGTCAAGTCCTACAGCTCCGCT > NC_002947/5721089‑5721384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |