Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,755,463 | T→G | 11.6% | intergenic (+46/‑320) | glnA → / → glnL | glutamine synthetase/two‑component system sensor histidine kinase/phosphatase GlnL/GlnG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,755,463 | 0 | T | G | 11.6% | 483.0 / 45.9 | 171 | intergenic (+46/‑320) | glnA/glnL | glutamine synthetase/two‑component system sensor histidine kinase/phosphatase GlnL/GlnG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (65/85); new base G (12/8); total (78/93) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.19e-01 |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
CCGACGACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCTG > NC_002947/5755314‑5755611 | ccGACGACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGcctccct < 1:307734/150‑1 (MQ=255) cgacgaCTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCGAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGcctccctc > 2:779971/1‑150 (MQ=255) gacgacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCg > 1:2738498/1‑150 (MQ=255) gacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGa < 1:3019929/150‑1 (MQ=255) gacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGa < 2:1555015/150‑1 (MQ=255) acTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAg < 1:2960207/150‑1 (MQ=255) cTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCgagggagg < 1:2376840/150‑1 (MQ=255) ttCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGc > 1:4569484/1‑150 (MQ=255) ttCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGCGGGAGGc > 1:3309256/1‑150 (MQ=255) aTCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGt > 1:413937/1‑150 (MQ=255) aTCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGt > 2:3234128/1‑150 (MQ=255) tCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGtt < 1:5252896/150‑1 (MQ=255) tCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGtt < 2:4263088/150‑1 (MQ=255) cGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGttt < 1:3317206/150‑1 (MQ=255) gATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAATCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGtttt > 1:595918/1‑150 (MQ=255) aTGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGttttt < 2:4646726/150‑1 (MQ=255) aTGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGttttt < 1:3119099/150‑1 (MQ=255) aTGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGttttt > 2:2709041/1‑150 (MQ=255) aTGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGatttt < 1:5140884/150‑1 (MQ=255) tGCCTTCATCGAGCTGAATAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAACCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGttttga < 2:2333232/150‑3 (MQ=255) tGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGATTTTg < 2:5440792/150‑1 (MQ=255) gCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCTGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGt < 1:3208379/150‑1 (MQ=255) cTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGttt > 1:3840058/1‑150 (MQ=255) cTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGttt > 2:1247761/1‑150 (MQ=255) cTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGGACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGttt < 1:1849040/150‑1 (MQ=255) ttCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTc > 2:1382427/1‑150 (MQ=255) ttCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGttttagcaag > 1:3881753/1‑144 (MQ=255) aTCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGACTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTgc > 1:1100928/1‑150 (MQ=255) gCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGATTTTGTTTCTGCGCAcc < 1:228813/150‑1 (MQ=255) gAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTg > 1:945502/1‑150 (MQ=255) gagCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAg < 1:2661733/150‑1 (MQ=255) gagCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAg < 1:1469244/150‑1 (MQ=255) agCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGa < 1:47139/150‑1 (MQ=255) gaagaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGcgcc > 2:396069/1‑150 (MQ=255) aagaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAATACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGcgccg > 2:565164/1‑150 (MQ=255) gaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCt < 1:1617392/150‑1 (MQ=255) aaTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGa < 2:1670294/150‑1 (MQ=255) aTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGAt > 2:1805532/1‑150 (MQ=255) aTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGAt > 1:1220094/1‑150 (MQ=255) aTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCACGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGAGCCGCTGAt > 1:2550069/1‑150 (MQ=255) cAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTc > 1:809243/1‑150 (MQ=255) aaGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCg > 2:1072536/1‑150 (MQ=255) ggTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGcc < 1:3140002/150‑1 (MQ=255) tCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGt < 1:2233193/107‑1 (MQ=255) ccGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGt > 1:103045/1‑150 (MQ=255) cTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCt > 2:3561201/1‑150 (MQ=255) ttCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTa < 1:3530287/150‑1 (MQ=255) tCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTAt > 1:746805/1‑150 (MQ=255) gTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGc > 2:921429/1‑150 (MQ=255) acacCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAACCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGctc < 1:2014551/150‑1 (MQ=255) acacCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGATTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGctc < 2:342746/150‑1 (MQ=255) acCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTa < 2:1220094/150‑1 (MQ=255) aaccGCTGGTATTCGAGCTGTACTACTGCTGCTGATATGATTGGCTCCTCGCGCGGATGACTTGATCAATACGGCATCCCTCTGTTGGCCGTTTTTGTTTGTTCGAACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCATGTGACGATATTCTCTa < 2:2550069/148‑1 (MQ=255) cccGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCGGTCACGCTATGCTCTAt > 1:5066068/1‑150 (MQ=255) cGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCt < 1:3248163/150‑1 (MQ=255) gCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCtt < 1:717100/150‑1 (MQ=255) cTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTg < 1:4348254/150‑1 (MQ=255) ggAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGt > 2:2704127/1‑150 (MQ=255) gAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTg > 2:4469798/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTa < 1:404532/150‑1 (MQ=255) gAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTaa > 1:4698183/1‑150 (MQ=255) gctgctGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGcc > 2:654142/1‑150 (MQ=255) gctgATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTc < 2:4002525/150‑1 (MQ=255) gctgATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGACCTc > 2:4748981/1‑150 (MQ=255) tgatctgatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCaa > 1:4441005/1‑150 (MQ=255) tctgatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTg < 1:1830895/150‑1 (MQ=255) tgatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCt < 2:4794308/150‑1 (MQ=255) atTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTcc < 2:3840058/150‑1 (MQ=255) atTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTcc > 2:528650/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTccc > 2:1988309/1‑150 (MQ=255) tGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTcccc > 2:2357001/1‑150 (MQ=255) gcgcCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGtt > 1:3155943/1‑50 (MQ=255) tCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTgg < 2:5145951/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTgg > 2:2825058/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCGAGGACATGATCAAATCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGGTGCTGCGCACCGTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCGGTCACGCTATGCTCTATCTGGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAAGTGCTCCCCAATCTgg > 2:2932085/1‑150 (MQ=255) gcgcCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGtt < 2:297510/150‑1 (MQ=255) gcCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCa < 1:3395795/150‑1 (MQ=255) ccGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAg < 1:1382427/150‑1 (MQ=255) cGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAgg < 1:1247761/150‑1 (MQ=255) cGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAAGTGCTCCCCAATCTGGTTCAgg < 2:3305820/150‑1 (MQ=255) gATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGATTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGt < 2:2738498/150‑1 (MQ=255) aTGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGtt > 1:3928446/1‑150 (MQ=255) aTGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGtt < 2:1845238/150‑1 (MQ=255) gACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTaa < 2:2149071/150‑1 (MQ=255) agaaacaaaaaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAAc > 2:695922/8‑150 (MQ=255) acaaaaaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGccc > 2:5431361/4‑114 (MQ=255) acaaaaaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGccc < 1:5431361/111‑1 (MQ=255) tCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTc < 2:4881983/150‑1 (MQ=255) tCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTc > 2:5399817/1‑150 (MQ=255) aaaaaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCa > 2:890822/2‑150 (MQ=255) aaaaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAAtt > 1:652058/1‑99 (MQ=255) aaCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAgg > 1:455868/1‑135 (MQ=255) aaCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAgg < 2:455868/135‑1 (MQ=255) aaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCa > 2:496542/1‑150 (MQ=255) aCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCaa < 1:2709041/150‑1 (MQ=255) tccctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACttt > 2:1336916/1‑150 (MQ=255) ccctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTc < 1:2825058/150‑1 (MQ=255) ccctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTc < 2:3076110/150‑1 (MQ=255) cctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGtt < 1:4047892/122‑1 (MQ=255) cctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGtt > 2:4047892/1‑122 (MQ=255) | CCGACGACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCTG > NC_002947/5755314‑5755611 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |