| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,796,977 | T→A | 7.7% | P967P (CCA→CCT) | gltB ← | L‑glutamate synthase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,796,977 | 0 | T | A | 7.7% | 455.1 / 19.7 | 142 | P967P (CCA→CCT) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (66/65); new base A (6/5); total (72/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
ATAGGCCTTGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCG > NC_002947/5796830‑5797125 | aTAGGCCTTGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTgtggcggtgg > 1:4036951/1‑150 (MQ=255) tgCCTTGGCAACACCGGCAGCAACCGTACCAACGCCCACTTCCGACACCAGCTTGACCGAAATATCAGCCGCCGGATTGACGTTCTTCAGATCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCga < 1:2543077/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCga < 1:1489253/150‑1 (MQ=255) cTTGGCAACACCGGCAGCAACCGTACCAACGCCCACTTCCGACACCAGCTTGACCGAAATATCAGCCGCCGGATTGACGTTCTTCAGATCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAAt > 2:633961/1‑150 (MQ=255) ttGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATc > 1:2519307/1‑150 (MQ=255) tGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCa < 2:1340796/150‑1 (MQ=255) tGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCa < 1:151076/150‑1 (MQ=255) gCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAgg < 2:5193173/150‑1 (MQ=255) ccACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCCGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCgaga < 1:1157217/144‑1 (MQ=255) ccACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAggg < 1:2428121/150‑1 (MQ=255) cacaCCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGt > 2:3572625/1‑150 (MQ=255) cacaCCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGt > 2:5433442/1‑150 (MQ=255) acacCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTc < 1:705382/150‑1 (MQ=255) acacCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTc > 2:618053/1‑150 (MQ=255) acCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCAc > 2:3550137/1‑150 (MQ=255) acCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCAc > 2:5381923/1‑150 (MQ=255) cTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGc < 1:3339406/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGcc < 2:376653/150‑1 (MQ=255) gcggcgATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGccc < 2:2189104/150‑1 (MQ=255) gATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTAc < 1:3572625/150‑1 (MQ=255) gTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCa > 1:1757941/1‑150 (MQ=255) cACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACg > 1:747775/1‑150 (MQ=255) gCCCACTTCCGACACCAGCTTGACCGAAATATCAGCCGCCGGATTGACGTTCTTCAGATCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCgaaa < 1:4792164/119‑3 (MQ=255) ccGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCt > 1:3465324/1‑150 (MQ=255) cGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCtt < 1:3728950/150‑1 (MQ=255) ttCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGc < 2:4705665/150‑1 (MQ=255) cTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCa < 1:218372/150‑1 (MQ=255) tACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAg > 2:4644416/1‑150 (MQ=255) aCCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAgg > 1:1952749/1‑150 (MQ=255) aGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCg > 1:2059020/1‑150 (MQ=255) cTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGtt > 1:2275097/1‑150 (MQ=255) gACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGAc > 1:4008145/1‑150 (MQ=255) gACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGAc > 1:4008134/1‑150 (MQ=255) gACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGCGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGAc < 1:2610047/150‑1 (MQ=255) aCCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGAcc > 2:2823789/1‑150 (MQ=255) ccGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAgg > 1:1804737/1‑101 (MQ=255) ccGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAgg < 2:1804737/101‑1 (MQ=255) ccGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑t > 1:1293791/1‑150 (MQ=255) gATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑ttt < 2:1193326/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGcc > 1:5409066/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGcc > 1:3512293/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGccc > 1:4182468/1‑150 (MQ=255) cTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCaa > 2:2760507/1‑150 (MQ=255) gggTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTgg < 1:4780015/150‑1 (MQ=255) ggTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGgc > 1:2636256/1‑150 (MQ=255) gTTGACCTGCTTTAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTAGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGTCGAGATCAGGGTCACGCACTGTACCGCATAACGCATCTTGGAGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGgcc > 1:3674397/1‑150 (MQ=255) gTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGgcc < 2:4036951/150‑1 (MQ=255) gTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGgcc > 2:3971741/1‑150 (MQ=255) gTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGgcc > 2:5243330/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTTCCGCCCGGCAACTGgccgcc < 2:3869031/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGccc > 1:3129880/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTgg > 1:4505897/1‑143 (MQ=255) ccTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTgg < 2:4505897/143‑1 (MQ=255) ccTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCt > 1:3595773/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCt > 1:2414447/1‑150 (MQ=255) tGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCa < 2:2059020/150‑1 (MQ=255) gCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCAc > 2:5019105/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCAc > 2:331521/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCAc > 2:331492/1‑150 (MQ=255) cTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCAcc < 2:2275097/150‑1 (MQ=255) ttGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCAccc < 1:1649881/150‑1 (MQ=255) gAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCga > 1:5358222/1‑149 (MQ=255) cagatCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCgg < 1:5443385/146‑1 (MQ=255) cagatCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCgg < 1:1955828/146‑1 (MQ=255) tCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCttt > 2:1587054/1‑149 (MQ=255) gTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGgc > 1:2698559/1‑150 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 2:3512293/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt > 1:517017/1‑150 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 1:3601521/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 1:1628098/150‑1 (MQ=255) aGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGTGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCTTTGCACCCTga < 1:5050086/150‑2 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTgg < 2:1792418/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTgg < 2:1746117/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTgg < 2:1006554/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTggg < 1:671828/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTggg < 2:3568647/150‑1 (MQ=255) cTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCTTTGCACCCTGAGc > 1:1095749/1‑150 (MQ=255) gCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAAcc < 2:3407111/150‑1 (MQ=255) ccAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCTTTGCACCCTGAGCAACCt > 2:1976558/1‑150 (MQ=255) gATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGa < 1:3772774/150‑1 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg > 1:4525609/1‑150 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg > 2:2615415/1‑150 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg < 1:2886802/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 2:5279194/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:108379/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:5383121/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:3754128/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:2804223/150‑1 (MQ=255) cgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCAc < 1:1017910/150‑1 (MQ=255) aaaTGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCgg < 2:4339221/150‑1 (MQ=255) aaaTGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCgg < 2:5047162/150‑1 (MQ=255) aaTGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGc > 1:1329813/1‑150 (MQ=255) tCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTg < 2:2498734/150‑1 (MQ=255) tCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTg > 2:101160/1‑150 (MQ=255) tCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTg < 2:5234321/150‑1 (MQ=255) gtgtGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCACATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAg > 2:713790/1‑150 (MQ=255) tggcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATa < 2:4540071/150‑1 (MQ=255) gcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACt > 2:4534485/1‑150 (MQ=255) gcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACt > 1:2627543/1‑150 (MQ=255) gtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCg > 1:2004505/1‑150 (MQ=255) | ATAGGCCTTGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCG > NC_002947/5796830‑5797125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |