| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,796,983 | G→A | 6.1% | I965I (ATC→ATT) | gltB ← | L‑glutamate synthase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,796,983 | 0 | G | A | 6.1% | 459.7 / 12.8 | 148 | I965I (ATC→ATT) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (73/66); new base A (6/3); total (79/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
CTTGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCAC > NC_002947/5796836‑5797132 | cTTGGCAACACCGGCAGCAACCGTACCAACGCCCACTTCCGACACCAGCTTGACCGAAATATCAGCCGCCGGATTGACGTTCTTCAGATCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAAt > 2:633961/1‑150 (MQ=255) ttGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATc > 1:2519307/1‑150 (MQ=255) tGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCa < 1:151347/150‑1 (MQ=255) gCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAgg < 2:3878265/150‑1 (MQ=255) gCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAgg < 2:5193173/150‑1 (MQ=255) ccACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCCGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCgaga < 1:1157217/144‑1 (MQ=255) cacaCCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGt > 2:5433442/1‑150 (MQ=255) cacaCCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGt > 2:3572625/1‑150 (MQ=255) acCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCAc > 2:5381923/1‑150 (MQ=255) gcggcgATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGccc > 1:2635898/1‑150 (MQ=255) gcggcgATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGccc < 2:2189104/150‑1 (MQ=255) gATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTAc < 1:3572625/150‑1 (MQ=255) gtcgatgcGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCa > 2:3601521/8‑150 (MQ=255) gTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCa > 1:1757941/1‑150 (MQ=255) cccACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATaa > 1:4540071/1‑150 (MQ=255) cACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACg > 1:747775/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCt > 1:3465324/1‑150 (MQ=255) cGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCtt < 1:3728950/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTg < 2:3465324/150‑1 (MQ=255) ttCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGc < 2:4705665/150‑1 (MQ=255) cTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCa < 1:5433442/150‑1 (MQ=255) tACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAg > 2:4644416/1‑150 (MQ=255) aGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCg > 1:2686780/1‑150 (MQ=255) aGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCg > 1:2059020/1‑150 (MQ=255) cTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGtt > 1:2275097/1‑150 (MQ=255) tGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGa < 1:4995614/150‑1 (MQ=255) gACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGAc > 1:4008145/1‑150 (MQ=255) gACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGCGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGAc < 1:2610047/150‑1 (MQ=255) aCCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGAcc > 2:2823789/1‑150 (MQ=255) ccGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAgg > 1:1804737/1‑101 (MQ=255) ccGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑t > 1:1293791/1‑150 (MQ=255) cGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑tt > 1:686457/1‑150 (MQ=255) gATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑ttt < 2:686457/150‑1 (MQ=255) gATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑ttt < 2:1193326/150‑1 (MQ=255) cTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCaa > 1:2368601/1‑150 (MQ=255) cTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCaa > 2:2760507/1‑150 (MQ=255) gTTGACCTGCTTTAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTAGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGTCGAGATCAGGGTCACGCACTGTACCGCATAACGCATCTTGGAGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGgcc > 1:3674397/1‑150 (MQ=255) gTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGgcc < 2:4036951/150‑1 (MQ=255) gTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGgcc > 2:5243330/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTTCCGCCCGGCAACTGgccgcc < 2:3869031/150‑1 (MQ=255) ccTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTgg < 2:4505897/143‑1 (MQ=255) ccTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCt > 1:2414447/1‑150 (MQ=255) cTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTc > 1:315120/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCAc > 2:5019105/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCAc > 2:331492/1‑150 (MQ=255) gAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCgg > 2:4157685/1‑150 (MQ=255) gAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCga > 1:5358222/1‑149 (MQ=255) cagatCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCgg < 1:1955828/146‑1 (MQ=255) gTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCtt > 1:894199/1‑150 (MQ=255) gTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCtt > 2:5234990/1‑150 (MQ=255) atCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCtt > 2:3557207/2‑150 (MQ=255) tCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCttt > 2:1587054/1‑149 (MQ=255) tCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTg > 1:205982/1‑150 (MQ=255) cGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTgg < 1:1987592/150‑1 (MQ=255) gTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGgc > 2:5076516/1‑150 (MQ=255) gTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGgc > 1:2698559/1‑150 (MQ=255) tAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGgcg > 2:1491847/1‑150 (MQ=255) aGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGgcgc < 1:1229839/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt > 1:517017/1‑150 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 2:3512293/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 1:3601521/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 1:3579875/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 1:1628098/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTgg > 1:1366556/1‑150 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTgg < 2:1792418/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTggg < 1:671828/150‑1 (MQ=255) cTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCTTTGCACCCTGAGc > 1:1095749/1‑150 (MQ=255) tgtgCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCTTTGCACCCTGAGCa > 2:1805805/4‑150 (MQ=255) tGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCa < 1:1744174/150‑1 (MQ=255) ccAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACC‑TTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCTTTGCACCCTGAGCAACCt > 2:1976558/1‑150 (MQ=255) gATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGa < 1:3772774/150‑1 (MQ=255) aTCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGAt < 2:5283507/150‑1 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg > 2:2075813/1‑150 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg < 1:2886802/150‑1 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg > 2:2615415/1‑150 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg > 1:4525609/1‑150 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:108379/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:3754128/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:5383121/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:5383066/150‑1 (MQ=255) cgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCAc < 1:1017910/150‑1 (MQ=255) aGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACtt > 1:3506285/1‑150 (MQ=255) gTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTc > 1:4424457/1‑150 (MQ=255) tGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGt > 1:4036520/1‑150 (MQ=255) tCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTg > 2:101160/1‑150 (MQ=255) cATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGa < 2:1757941/150‑1 (MQ=255) tGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGAcc > 1:2840736/1‑150 (MQ=255) tgtgGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGa < 2:2473320/150‑1 (MQ=255) tggcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGAtc > 2:33419/1‑149 (MQ=255) tggcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATa < 2:4540071/150‑1 (MQ=255) tggcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATa > 1:2506636/1‑150 (MQ=255) gcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACt > 2:4534485/1‑150 (MQ=255) ggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGGCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCggg < 1:2557371/150‑1 (MQ=255) ggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCggg < 2:2046259/150‑1 (MQ=255) gcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCgggg > 1:396611/1‑150 (MQ=255) cgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGt > 1:4313904/1‑150 (MQ=255) gagaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAAcc < 2:1158549/108‑1 (MQ=255) gagaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTc > 2:2557539/1‑150 (MQ=255) gaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTcac < 2:3393965/150‑1 (MQ=255) gaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTcac < 2:73571/150‑1 (MQ=255) | CTTGGCCACACCTGCGGCGATGGTGCCCACGCCCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACC‑TTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCAC > NC_002947/5796836‑5797132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |