Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,797,015 | G→T | 5.4% | L955M (CTG→ATG) | gltB ← | L‑glutamate synthase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,797,015 | 0 | G | T | 5.4% | 538.0 / 12.9 | 161 | L955M (CTG→ATG) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (76/76); new base T (6/3); total (82/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTGGCCACCTGCTT > NC_002947/5796868‑5797159 | cGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCtt < 1:3728950/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTg < 2:3465324/150‑1 (MQ=255) ttCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGc < 2:4705665/150‑1 (MQ=255) cTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCa < 1:218372/150‑1 (MQ=255) aCCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAgg > 1:1952749/1‑150 (MQ=255) aGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCg > 1:2686780/1‑150 (MQ=255) aGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCg > 1:2059020/1‑150 (MQ=255) tGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGa < 1:4995614/150‑1 (MQ=255) gACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGAc > 1:4008145/1‑150 (MQ=255) gACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGCGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGAc < 1:2610047/150‑1 (MQ=255) aCCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGAcc > 2:2823789/1‑150 (MQ=255) ccGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCt > 1:1293791/1‑150 (MQ=255) cGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCtt > 1:686457/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGcc > 1:3617418/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGcc > 1:5409066/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGccc > 1:4182468/1‑150 (MQ=255) cTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCaa > 1:2368601/1‑150 (MQ=255) ggTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGgc > 1:2636256/1‑150 (MQ=255) 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tGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCa < 2:2686780/150‑1 (MQ=255) gCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCAc > 2:331521/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCAc > 2:5019105/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCAc > 2:331492/1‑150 (MQ=255) gAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCga > 1:5358222/1‑149 (MQ=255) cagatCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACCTTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCgg < 1:5443385/146‑1 (MQ=255) gTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCtt > 1:894199/1‑150 (MQ=255) gTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCtt > 2:5234990/1‑150 (MQ=255) atCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACCTTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCtt > 2:3557207/2‑150 (MQ=255) tCGTAGATCAGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACCTTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCttt > 2:1587054/1‑149 (MQ=255) tCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTg > 1:205982/1‑150 (MQ=255) cGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTgg < 1:1987592/150‑1 (MQ=255) gTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGgc > 2:5076516/1‑150 (MQ=255) tAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGgcg > 2:1491847/1‑150 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 2:3512293/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 1:3601521/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 1:3579875/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCt < 1:1628098/150‑1 (MQ=255) aGCTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGTGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACCTTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCTTTGCACCCTga < 1:5050086/150‑2 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTgg < 2:1792418/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTgg > 1:1366556/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCAGATCTTCGATCGAGTAGATGTCATGATGTGGCGGAGGCGAAATGAGGCCAACGCCCGGCGTCGAGTGACGGGTCTTGGCAATCGTCGCATCAACCTTATGGCCCGGCAGCTGACCGCCTTCACCCGGCTTTGCACCCTGAGc > 1:1095749/1‑150 (MQ=255) tGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCa < 1:1744174/150‑1 (MQ=255) gATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGa < 1:3772774/150‑1 (MQ=255) aTCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGAt < 2:5283507/150‑1 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg > 2:2615415/1‑150 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg > 1:4525609/1‑150 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg > 2:2075813/1‑150 (MQ=255) ttCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTg < 1:2886802/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:108379/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 2:5279194/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:3754128/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:5383121/150‑1 (MQ=255) cgatcgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTgca < 1:2804223/150‑1 (MQ=255) cgaGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCAc < 1:1017910/150‑1 (MQ=255) aGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACtt > 1:3506285/1‑150 (MQ=255) aaaTGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCgg < 2:4339221/150‑1 (MQ=255) tGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGt > 1:4036520/1‑150 (MQ=255) tCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTg < 2:5234321/150‑1 (MQ=255) tCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTg < 2:2498734/150‑1 (MQ=255) tCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTg > 2:101160/1‑150 (MQ=255) cATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGa < 2:1757941/150‑1 (MQ=255) aTGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGAc < 1:2550934/150‑1 (MQ=255) gtgtGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCACATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAg > 2:713790/1‑150 (MQ=255) tgtgGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGa < 2:2473320/150‑1 (MQ=255) tggcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATa < 2:4540071/150‑1 (MQ=255) tggcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATa > 1:2506636/1‑150 (MQ=255) gcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACt > 1:3904077/1‑150 (MQ=255) gcggtggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACt > 2:4534485/1‑150 (MQ=255) ggcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCggg < 2:2046259/150‑1 (MQ=255) gcgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCgggg > 1:396611/1‑150 (MQ=255) cgAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGt > 1:4313904/1‑150 (MQ=255) gagaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAAcc > 1:1158549/1‑108 (MQ=255) gagaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAAcc < 2:1158549/108‑1 (MQ=255) gagaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTc > 2:2557539/1‑150 (MQ=255) gagaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTc > 2:1868827/1‑150 (MQ=255) agaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTca < 1:2284266/150‑1 (MQ=255) gaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTcac < 2:3393965/150‑1 (MQ=255) gaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTcac < 2:73571/150‑1 (MQ=255) gaTCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTcac < 1:5381923/150‑1 (MQ=255) tCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCacac > 1:1783775/1‑150 (MQ=255) 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1:4876138/1‑150 (MQ=255) cGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGt < 2:5003715/150‑1 (MQ=255) ggTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTg < 2:4604460/150‑1 (MQ=255) ggTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTg < 2:550141/150‑1 (MQ=255) ggTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTg < 2:2004505/150‑1 (MQ=255) tACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTGGc > 2:3509713/1‑150 (MQ=255) aCCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTGGcc > 2:4377728/1‑150 (MQ=255) ccGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTGGCCa < 2:4008134/150‑1 (MQ=255) gCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTGGCCAcc > 2:4824099/1‑150 (MQ=255) aaCGCAGATTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGAAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGAACTTCGGCGTTGACCATATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTGGCCACCTGCt < 1:3550137/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCTTGGCGATCCGGCCGTTGACCCGTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCTCTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTGGCCACCTGCtt < 2:3129880/150‑1 (MQ=255) | CCGCTTCGGCTACCAGCTTGACCGATACCAGCGCCTGCGGGTTGACCTGCTTGAGGTCGTAGATCAGCTGGGCCAGATCTTCGATCGAGTAAATGTCATGGTGTGGCGGTGGCGAGATCAGGGTCACGCCCGGTACCGCATAACGCAGCTTGGCGATCAGGCCGTTGACCTTTCCGCCCGGCAACTGGCCGCCCTCACCCGGCTTGGCGCCCTGGGCAACCTTGATCTGCAGCACTTCGGCGTTGACCAGATACTCCGGGGTCACACCAAAACGGCCGGTGGCCACCTGCTT > NC_002947/5796868‑5797159 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |