| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 5,848,161 | T→C | 5.1% | T217A (ACC→GCC) | mutM ← | formamidopyrimidine‑DNA glycosylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,848,161 | 0 | T | C | 5.1% | 569.1 / 11.7 | 177 | T217A (ACC→GCC) | mutM | formamidopyrimidine‑DNA glycosylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (90/78); new base C (6/3); total (96/81) | |||||||||||
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Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
CGGGCAGTACACGCTCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGATGTTGCCCACCC > NC_002947/5848012‑5848310 | cgGGCAGTACACGCTCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGggt > 1:5317720/1‑150 (MQ=255)cgGGCAGTACACGCTCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTGCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCGCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTACCCCGGCTGCCCGTCGCCACCGATAAAGTCGCGCAGggt < 1:832504/150‑1 (MQ=255) gggCAGTACACGCTCGCCCTCTGCCCCAGCTTCACTTCGCGCAACTCAGTTCCGCATACCTTGCACGGCTGCCCTCCACGCCCGTACACAAACAGTTCCTGCTGGAAGTAACCCTTCTGCCCGTCGCCACCGATAATGTCGCGCAGggtg < 2:2667611/150‑1 (MQ=255) 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gTCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGAt < 1:294924/150‑1 (MQ=255) atCGAGCAGGGCGGTACCACCCTGCGCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGAt > 1:867231/2‑150 (MQ=255) atCGAGCAGGGCGGTACCACCCTGCGCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGAt > 1:1576487/2‑150 (MQ=255) tCGCGCAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGATg > 1:4189687/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGGTGGTACCGCCCTGCTCGATGGCCGCCGCCAGCACCCGTTTGATCTCGATCGCCAGTTTCAGGTAGCGCGCCCGGGAAATCCCGCCCGCCTCTCGGCGTGGGTCGATACCGGCGGCAAACAACGCCTCGGTGGCGTAGATGtt < 1:1966319/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |