Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,921,616 | A→T | 5.5% | K75M (AAG→ATG) ‡ | PP_5190 → | type II secretion system protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,921,616 | 0 | A | T | 5.5% | 558.7 / 12.6 | 176 | K75M (AAG→ATG) ‡ | PP_5190 | type II secretion system protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (83/79); new base T (5/5); total (92/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
CGCCAGCGATACCCTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCAGCGCCCAGCCT > NC_002947/5921467‑5921764 | cGCCAGCGATACCCTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACaa < 1:1499005/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGATACCCTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAg > 2:354297/1‑150 (MQ=255) ccAGCGATACCCTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAgg < 2:2983453/150‑1 (MQ=255) gCGATACCCTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCg < 2:4940180/150‑1 (MQ=255) aTACCCTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACCTTGTCGGcc > 2:3660665/1‑150 (MQ=255) tACCCTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACCTTGTCGGCCa < 1:3660665/150‑1 (MQ=255) tACCCTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACCTTGTCGGCCa < 2:5263388/150‑1 (MQ=255) ccTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGGCAAGGTCGGCCAAcc > 1:2329357/1‑150 (MQ=255) ccTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAAcc < 2:1890773/150‑1 (MQ=255) ccTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAAcc > 1:1890773/1‑150 (MQ=255) cTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCAACAAGGTCGGCCAAccc > 1:3974916/1‑150 (MQ=255) gTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTAccgg > 1:372730/1‑148 (MQ=255) tACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTgc < 1:1271239/150‑1 (MQ=255) tCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCa > 2:478967/1‑150 (MQ=255) tCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCGACCAGCGCa > 1:3795217/1‑150 (MQ=255) tCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCAACCTGCGCa > 1:3364132/1‑150 (MQ=255) tCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGGCGGCCCCCCCGACCGGCGCa > 1:972229/1‑150 (MQ=255) gAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATc > 1:1628505/1‑150 (MQ=255) cacGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGAc > 2:4636331/1‑150 (MQ=255) ccgcTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCa > 2:4917295/1‑150 (MQ=255) cgcTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCAt < 1:4519421/150‑1 (MQ=255) gcTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATg < 2:2286841/150‑1 (MQ=255) aCCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCg > 1:506340/1‑150 (MQ=255) aCCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCg > 1:5238367/1‑150 (MQ=255) cGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCt < 2:3086398/150‑1 (MQ=255) cACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAg < 2:1625496/150‑1 (MQ=255) cccGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGt > 2:4596759/1‑150 (MQ=255) cccGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGt < 1:2527088/150‑1 (MQ=255) cTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCAcc < 2:2765394/150‑1 (MQ=255) gAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGc > 2:1446629/1‑150 (MQ=255) aGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGcc < 1:4626209/150‑1 (MQ=255) aGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGcc < 1:2069501/150‑1 (MQ=255) gCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCt < 1:5229851/150‑1 (MQ=255) 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gccAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACg < 2:1926345/150‑1 (MQ=255) ccAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACgg > 2:3935098/1‑150 (MQ=255) aGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCGGGCCGCCCAGGGCGGCCCCCCCGACCGGCGCCTCGCCCCCCGGCAACGCGCCCAGCCCCAGGTCACCCGCCGGCTCGCCCCAGCCGTCGCCCCGCGCCCCGGcc > 1:3687524/1‑149 (MQ=255) gCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCAt < 1:5443454/150‑1 (MQ=255) cACCCCGGCCTGCCCCTGGACTTTGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATc < 2:662660/150‑1 (MQ=255) 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tttGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCa > 2:817279/1‑150 (MQ=255) tttGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCa < 2:2885662/150‑1 (MQ=255) tttGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCa < 1:144001/150‑1 (MQ=255) tttGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCa > 2:5160645/1‑150 (MQ=255) tGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCAcc < 2:4053902/150‑1 (MQ=255) gTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGcc > 2:4321350/1‑127 (MQ=255) gTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGcc < 1:4321350/127‑1 (MQ=255) gTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGc < 1:2700944/150‑1 (MQ=255) gTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGc < 1:1422856/150‑1 (MQ=255) ggctggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCa < 2:5130959/150‑1 (MQ=255) gttggcCGACCTTGTCGGCCAGCCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGc > 1:91579/3‑136 (MQ=255) gttggcCGACCTTGTCGGCCAGCCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGc < 2:91328/134‑1 (MQ=255) gctggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCACCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCAg > 2:5340607/1‑150 (MQ=255) ttggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCAgc > 2:4035805/2‑150 (MQ=255) tggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCa < 1:1107584/132‑1 (MQ=255) tggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCa > 2:1107584/1‑132 (MQ=255) tggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCAgcg > 1:3417063/1‑150 (MQ=255) tggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCAgcg < 1:4834474/150‑1 (MQ=255) tggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCAgcg > 1:696521/1‑150 (MQ=255) tggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCAgcg > 1:4061702/1‑150 (MQ=255) ggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGTCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTc < 1:2646483/136‑1 (MQ=255) ggcCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGTCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTc > 2:2646483/1‑136 (MQ=255) cGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCTACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGccc > 1:3004087/1‑89 (MQ=255) cGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCCACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGccc < 2:3004087/89‑1 (MQ=255) aCAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCAGCGCCCCGc > 1:4785948/1‑150 (MQ=255) aCAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCAGCGCCCAGc > 1:4786034/1‑150 (MQ=255) | CGCCAGCGATACCCTGCAAGTACTCGAACACGCCGCTGCCCACCCCGCTAGCCACCCGCTGGAGCACATCGCCGCCTGCAGCCTGGAAAGCCGCCAGCACCCCGGCCAGCCCCTGGACTTGGAGCACCTTTGCCAGTGGCTGGCCGACAAGGTCGGCCAACCCTACCTGCGCATCGACCCCATGCAACTCGACCTGCCCCAGGTCACCAGCCTGATCTCCCCAGCCTTCGCCCAGCGCCACGGCATCCTCATCGTCGCGGCCGATGCCTCCAGCGTCACCGTCGCCAGCGCCCAGCCT > NC_002947/5921467‑5921764 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |