Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,982,159 | C→T | 6.1% | R276W (CGG→TGG) | PP_5242 → | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,982,159 | 0 | C | T | 6.1% | 810.8 / 25.7 | 260 | R276W (CGG→TGG) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (120/124); new base T (6/10); total (126/134) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
TGCTGGTGTGCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCAAACCA > NC_002947/5982011‑5982308 | tGGTGTGCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCa < 2:3824449/150‑1 (MQ=255) ttcgctggccgccCGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGt > 1:3868734/8‑150 (MQ=255) gtgCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTgg < 1:723589/150‑1 (MQ=255) tgCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTggg < 2:176627/150‑1 (MQ=255) tgCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTggg < 1:1543829/150‑1 (MQ=255) tgCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTgag < 1:1103853/150‑3 (MQ=255) gCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGgc > 2:4323805/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTGAgcc < 1:1920577/150‑1 (MQ=255) aGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGgccg > 1:584076/1‑150 (MQ=255) aGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGgccg < 2:4653252/150‑1 (MQ=255) ccGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTgg > 2:2366336/1‑144 (MQ=255) gcgggcggCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCca > 2:4059379/1‑150 (MQ=255) gggcggCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTGAgccaagtcca < 1:2303989/150‑8 (MQ=255) ggcggcCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACaa < 2:359071/150‑1 (MQ=255) ccAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCa > 2:1043740/1‑150 (MQ=255) ccAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCa > 1:4698459/1‑150 (MQ=255) cAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCAt > 2:4125853/1‑150 (MQ=255) cAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCAt > 2:3257385/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGTTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATg < 2:4797736/150‑1 (MQ=255) aGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATg < 1:4458462/150‑1 (MQ=255) gCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATgg < 2:2072956/150‑1 (MQ=255) cGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTGTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCt > 1:3305991/1‑150 (MQ=255) gACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCATGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTc > 2:3063222/1‑150 (MQ=255) aCAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCa > 1:297541/1‑150 (MQ=255) gCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCAccc < 1:3827584/150‑1 (MQ=255) aaGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCa < 2:2221255/150‑1 (MQ=255) aGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAg < 2:5041290/150‑1 (MQ=255) cGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTgcg > 2:2450281/1‑150 (MQ=255) 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cTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCg > 1:4923584/1‑150 (MQ=255) tCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCgg > 2:4304841/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTa < 2:3022091/150‑1 (MQ=255) cTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGAcc < 2:872928/142‑1 (MQ=255) cTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGAcc > 1:872928/1‑142 (MQ=255) 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> 2:2700907/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCATGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTg > 1:2011667/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTg > 1:4147748/1‑150 (MQ=255) tGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGt < 1:2098435/150‑1 (MQ=255) ggCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGtt < 2:261067/150‑1 (MQ=255) ggCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGtt < 1:2599773/150‑1 (MQ=255) 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gACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTg < 1:4336232/150‑1 (MQ=255) cTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTg > 1:3173064/1‑63 (MQ=255) cTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGaa > 2:3216863/1‑150 (MQ=255) ttGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCACAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAAt > 2:4181515/1‑150 (MQ=255) ggCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATcg < 2:3786306/150‑1 (MQ=255) ggCCCACTGCCGCTGGCAGTGAGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGa > 2:5220176/1‑111 (MQ=255) ggCCCACTGCCGCTGGCAGTGAGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGa < 1:5220176/111‑1 (MQ=255) cccACTGCCGCTGGCAGTGAGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATcgcg < 1:1443281/148‑1 (MQ=255) cccACTGCCGCTGGCAGTGAGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATcgcg > 2:3918109/3‑150 (MQ=255) tCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCt > 1:1662766/1‑90 (MQ=255) tCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCt < 2:1662766/90‑1 (MQ=255) tCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGgcgc < 1:2679754/105‑1 (MQ=255) tCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGa < 2:3868734/150‑1 (MQ=255) tCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGa < 1:2700907/150‑1 (MQ=255) ccACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGa > 1:3411494/2‑150 (MQ=255) cACTGCCGCTGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAg < 1:344757/108‑1 (MQ=255) cACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGAt > 1:2253868/1‑150 (MQ=255) cTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAg < 2:1424775/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGc > 1:1229880/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCaa > 1:1046931/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCaa > 1:2961142/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCaaa < 2:5369983/150‑1 (MQ=255) aGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCAAAc > 2:4563900/1‑150 (MQ=255) aGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCAAAc < 2:1133238/150‑1 (MQ=255) aGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCAAAc < 1:5108773/150‑1 (MQ=255) cGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCAAACca < 1:308983/150‑1 (MQ=255) | TGCTGGTGTGCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCAAACCA > NC_002947/5982011‑5982308 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |