| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 6,157,193 | 0 | C | G | 5.8% | 332.9 / 9.0 | 103 | intergenic (‑25/+181) | PP_5398/PP_5399 | transposase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/55); new base G (3/3); total (45/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.26e-01 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TGGCTGATGGCGACACTGGACACGGTTGCGCCAGGTTGCAGGCATTCCTGAACGACCTGGGCTTTGAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCA > NC_002947/6157071‑6157342 | tcaccacgatgttggccagaagcaaaaagcttcctcgaataggcctgatacatagatgcaaccgggttcctatggtaagcgtccggcgaactcaccttccgaactccaGCATTAAGGGCGATGGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACAcc > 2:144146‑M2/109‑150 (MQ=255) ccacgatgttggccagaagcaaaaagcttcctcgaataggcctgatacatagatgcaaccgggttcctatggtaagcgtccggcgaactcaccttccgaactccaGCATTAAGGGCGATGGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATc < 1:144146‑M2/45‑1 (MQ=255) acgatgttggccagaagcaaaaagcttcctcgaataggcctgatacatagatgcaaccgggttcctatggtaagcgtccggcgaactcaccttccgaactccaGCATTAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGc < 1:2460503‑M2/47‑1 (MQ=255) cagaagcaaaaagcttcctcgaataggcctgatacatagatgcaaccgggttcctatggtaagcgtccggcgaactcaccttcagaactccaGCATTAAGGGCGATGGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTg < 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TGGCTGATGGCGACACTGGACACGGTTGCGCCAGGTTGCAGGCATTCCTGAACGACCTGGGCTTTGAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCA > NC_002947/6157071‑6157342 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |