Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 542,102 | C→T | 5.0% | H113H (CAC→CAT) | rpoC → | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 542,102 | 0 | C | T | 5.0% | 636.3 / 13.6 | 199 | H113H (CAC→CAT) | rpoC | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (94/95); new base T (6/4); total (100/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.48e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
CCAGTCAAGGACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGCCAGCTGCTGAACGACG > NC_002947/541953‑542250 | ccAGTCAAGGACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCcac > 2:1489356/1‑150 (MQ=255) aGTCAAGGACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACAt < 2:1453188/150‑1 (MQ=255) tCAAGGACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCt > 1:1819052/1‑150 (MQ=255) aaGGACTACGAGTGCCTGTGCGGCACGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTgg > 1:4271732/1‑150 (MQ=255) aaGGACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACCTCTgg > 1:2723120/1‑150 (MQ=255) aaGGACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTgg < 2:3244329/150‑1 (MQ=255) aaGGACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTgg > 1:1409322/1‑150 (MQ=255) aaGGACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTgg > 1:1409342/1‑150 (MQ=255) aGGATTATGAATGCTTGTGCGGCAAGTACAAGCGTATGAAATACAAAGGCATCATCTGCGAAAAGTGCGGCGTTGAAGTCACGCTGTCGCGCGTTCGTCGTGAGCGCATGGGCCATATTGAGCTCGCAGCACCTGTTGCCCATATCTGGt > 2:1377240/1‑150 (MQ=255) gACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTc > 2:3829967/1‑150 (MQ=255) gACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTc < 2:4785147/150‑1 (MQ=255) gACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTc < 2:5258731/150‑1 (MQ=255) aCTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTcc < 2:1006815/150‑1 (MQ=255) tACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTg > 1:953933/1‑150 (MQ=255) tgaatGCTTGTGCGGCAAGTACAAGCGTATGAAATACAAAGGCATCATCTGCGAAAAGTGCGGCGTTGAAGTCACGCTGTCGCGCGTTCGTCGTGAGCGCATGGGCCATATTGAGCTCGCAGCACCTGTTGCCCATATCTGGTTCTTGaa > 1:1778378/5‑150 (MQ=255) cGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGaa < 1:4829244/150‑1 (MQ=255) cGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGaa > 2:1267651/1‑150 (MQ=255) gaatGCTTGTGCGGCAAGTACAAGCGTATGAAATACAAAGGCATCATCTGCGAAAAGTGCGGCGTTGAAGTCACGCTGTCGCGCGTTCGTCGTGAGCGCATGGGCCATATTGAGCTCGCAGCACCTGTTGCCCATATCTGGTTCTTGAAg > 1:918944/4‑150 (MQ=255) gAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAg > 2:4211373/1‑150 (MQ=255) gAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAg > 2:3646930/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGc < 1:3247122/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTg < 1:4406910/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTg < 1:1246145/150‑1 (MQ=255) ggCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTcc < 1:4921872/150‑1 (MQ=255) gCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCATATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTccc > 1:1268839/1‑150 (MQ=255) gCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTccc > 1:4915232/1‑150 (MQ=255) aaGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGt > 2:4714640/1‑150 (MQ=255) ccTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCt > 2:1822044/1‑150 (MQ=255) ccTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCt > 1:4189230/1‑150 (MQ=255) cTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTg > 2:3133327/1‑150 (MQ=255) tCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGa > 2:1182796/1‑150 (MQ=255) tCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGa > 2:3923388/1‑150 (MQ=255) tCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACAGCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGa > 2:3303981/1‑150 (MQ=255) 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aTCTGCGAAAAGTGCGGCGTTGAAGTCACGCTGTCGCGCGTTCGTCGTGAGCGCATGGGCCATATTGAGCTCGCAGCACCTGTTGCCCATATCTGGTTCTTGAAGTCGCTGCCATCGCGCATCGGCACGCTGCTGGACATGACGCtcaag < 1:3035398/150‑5 (MQ=255) tGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGat > 2:1252540/1‑150 (MQ=255) gCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGata < 1:583762/150‑1 (MQ=255) gCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGata < 2:4435336/150‑1 (MQ=255) gTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGc > 2:2106026/1‑119 (MQ=255) tGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAgcgc > 1:855222/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGctc > 1:1491481/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTc < 2:971628/80‑1 (MQ=255) ttGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTc > 1:971641/1‑80 (MQ=255) ttGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGctct > 2:3170149/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCCCATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTAc < 2:2945168/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGctctcgaagta < 2:453381/150‑8 (MQ=255) gCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCgag < 2:4146163/150‑1 (MQ=255) cccTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGATCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCgaga < 2:2219427/150‑1 (MQ=255) cccTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCgaga < 1:2272304/150‑1 (MQ=255) cccTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCgaga < 2:2467225/150‑1 (MQ=255) 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cATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCAt < 2:1883286/150‑1 (MQ=255) cATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCAt > 2:3692991/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATg > 2:5035546/1‑150 (MQ=255) tGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGa < 1:5276080/150‑1 (MQ=255) tGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGa < 1:2549163/150‑1 (MQ=255) cacaTCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTAcc > 2:4140666/1‑150 (MQ=255) tCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTgg < 1:1370938/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGa < 1:3646930/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAgg < 2:982902/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAgg < 1:1198517/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAgg < 1:5046678/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAgg < 1:3956552/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAgg < 1:3469049/150‑1 (MQ=255) gCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGc > 2:2368649/1‑58 (MQ=255) gCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGc < 1:2368649/58‑1 (MQ=255) gCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGc > 1:684933/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGcc > 2:1669588/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGcc < 1:2445237/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGACCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGCCa > 2:70652/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGCCAg > 2:1763653/1‑150 (MQ=255) tGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGCCAGCTGCTGaa < 2:158133/150‑1 (MQ=255) tGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGCCAGCTGCTGaa < 1:1489356/150‑1 (MQ=255) cccACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGCCAGCTGCTGAacg < 1:975298/150‑1 (MQ=255) ccACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGCCAGCTGCTGAacga > 2:4275014/1‑150 (MQ=255) cacaTCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGCCAGCTGCTGAacgac < 1:4211373/150‑1 (MQ=255) acaTCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGCCAGCTGCTGAacgacg > 2:3444684/1‑150 (MQ=255) | CCAGTCAAGGACTACGAGTGCCTGTGCGGCAAGTACAAGCGCCTCAAGCACCGCGGCGTAATCTGCGAGAAGTGCGGCGTTGAAGTTGCCCTGGCGAAGGTTCGTCGTGAGCGCATGGCGCACATCGAGCTGGCCTCGCCGGTTGCCCACATCTGGTTCCTGAAGTCGCTGCCGTCCCGTATCGGCTTGCTGATGGACATGACCCTGCGTGATATCGAGCGCGTGCTCTACTTCGAGAGCTATGTCGTTATCGACCCGGGCATGACTACCCTGGAAAAGGGCCAGCTGCTGAACGACG > NC_002947/541953‑542250 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |