| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 542,720 | G→T | 6.4% | S319S (TCG→TCT) ‡ | rpoC → | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 542,720 | 0 | G | T | 6.4% | 662.2 / 21.3 | 200 | S319S (TCG→TCT) ‡ | rpoC | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (101/85); new base T (6/8); total (107/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGC > NC_002947/542573‑542868 | ccGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGaa < 1:1845168/150‑1 (MQ=255)ccGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGaa > 2:3129388/1‑150 (MQ=255) tGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGTGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGc < 1:707954/150‑1 (MQ=255) aTCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGt < 2:3418623/150‑1 (MQ=255) aTCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGt < 2:3926812/150‑1 (MQ=255) tCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGTCTTATTGAACTGCGCGCTCCTGGCATCATTATCCGTAACGAAAAGCGTATGTTGCAGGAAGCTGTTGACGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCCGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTc < 2:2154045/150‑1 (MQ=255) cAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTcc < 2:590019/150‑1 (MQ=255) cAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTcc > 2:1260003/1‑150 (MQ=255) cAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTcc < 2:3115832/150‑1 (MQ=255) aCCGTAACAACCGTCTGAAGCGTCTTATTGAACTGCGCGCTCCTGGCATCATTATCCGTAACGAAAAGCGTATGTTGCAGGAAGCTGTTGACGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCCGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTCCGc > 1:350854/1‑150 (MQ=255) aCCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGc > 2:3787745/1‑150 (MQ=255) aCCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGc > 2:2263021/1‑150 (MQ=255) aCCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGc > 2:4595790/1‑150 (MQ=255) tAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGaa < 1:5400710/150‑1 (MQ=255) acaacCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGt < 1:2263021/150‑1 (MQ=255) aacCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTcc > 2:19247/1‑150 (MQ=255) acCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTccc > 1:633745/1‑150 (MQ=255) acCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTccc > 2:3732699/1‑150 (MQ=255) gAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGa > 1:4728097/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGAc < 1:1989221/150‑1 (MQ=255) aGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACa < 2:5199183/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAATCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACaa > 2:3068336/1‑123 (MQ=255) gcgcCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTcc > 1:2989609/1‑139 (MQ=255) gcCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGa < 2:2666285/150‑1 (MQ=255) tgctgGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCa > 2:3189915/1‑150 (MQ=255) ctgGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCaaa < 1:552282/150‑1 (MQ=255) tgGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAg < 1:3342710/150‑1 (MQ=255) tgGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAg < 1:3737737/150‑1 (MQ=255) tCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAg > 2:102934/1‑146 (MQ=255) tCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAg < 1:102934/146‑1 (MQ=255) cTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAg > 1:3075390/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCaa > 1:2226791/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAgg > 2:1908418/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAgg > 2:5090095/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAgg > 1:2728015/1‑150 (MQ=255) ggACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGttt > 2:4249140/1‑150 (MQ=255) gACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTc < 1:4249140/150‑1 (MQ=255) aCATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTcc < 1:4493748/150‑1 (MQ=255) atcatcGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGt < 2:5148021/150‑1 (MQ=255) tcatcGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTc < 1:4157361/150‑1 (MQ=255) tcatcGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTc < 1:306540/150‑1 (MQ=255) atcGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCaaa > 1:28333/1‑126 (MQ=255) atcGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCaaa < 2:28333/126‑1 (MQ=255) gcgcAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACtt < 1:3162788/150‑1 (MQ=255) gcgcAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACtt < 1:434283/150‑1 (MQ=255) cgcAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTg > 2:1390705/1‑150 (MQ=255) gtaaCGAAAAGCGTATGTTGCAGGAAGCTGTTGACGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCCGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTCCGCTGAAGTCGCTCTCCGACATGCTCAAGGGTAAGCAGGGTCGTTTCCGTCAGAAccttc > 1:2489628/3‑146 (MQ=255) gcAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCaa > 2:4860767/1‑118 (MQ=255) gcAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCaa < 1:4860767/118‑1 (MQ=255) cAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCt > 1:1261443/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCaaa > 1:756856/1‑117 (MQ=255) aaCGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGtt > 1:3789970/1‑133 (MQ=255) aaCGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTc > 2:4423353/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTc < 2:2436150/150‑1 (MQ=255) cGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCTGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCgg < 2:5389665/150‑1 (MQ=255) gAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGt > 2:786187/1‑150 (MQ=255) gAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGt > 1:2382859/1‑150 (MQ=255) aGCGTATGTTGCAGGAAGCTGTTGACGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCCGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTCCGCTGAAGTCGCTCTCCGACATGCTCAAGGGTAAGCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTTCTCGGTAAGc < 2:3976556/150‑1 (MQ=255) aGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGc < 2:2988441/150‑1 (MQ=255) gcATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAGGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTg > 1:5039899/1‑137 (MQ=255) gctgcAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGa < 2:4644047/150‑1 (MQ=255) ctgcAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGac < 2:4318217/150‑1 (MQ=255) gcAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGacta < 2:1969200/150‑1 (MQ=255) ggAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTc < 1:2814869/150‑1 (MQ=255) gTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGt > 2:3411885/1‑150 (MQ=255) ttGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGtt > 2:4698215/1‑150 (MQ=255) ttGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGtt < 2:441981/150‑1 (MQ=255) ttGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGtt < 2:656099/150‑1 (MQ=255) gACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCg < 2:1900638/150‑1 (MQ=255) gACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCg < 2:2035961/150‑1 (MQ=255) gCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTc > 1:3946676/1‑106 (MQ=255) gCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTATTGACTACTCCGGCCGTTCGGTa < 2:4750271/150‑1 (MQ=255) ctctGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTaa < 1:2945287/150‑1 (MQ=255) tctGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACCTGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAAt > 2:4462869/1‑150 (MQ=255) tctGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAAt > 2:314436/1‑150 (MQ=255) ctgGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTAcc < 2:753566/150‑1 (MQ=255) ggACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGac < 1:1604440/124‑1 (MQ=255) ggACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGac > 2:1604440/1‑124 (MQ=255) aCAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCTAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGt < 2:4725938/148‑1 (MQ=255) aaCGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCACTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTACCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGt > 1:3922237/1‑150 (MQ=255) aCGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTc < 1:5010837/150‑1 (MQ=255) cgtcgtGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACAGGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTGGACTACTCCGGCCGTTCGGTCAGTACCGTAGGTCCGAcc > 2:4568341/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCg > 1:173068/1‑150 (MQ=255) ggTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGt > 1:1229726/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCt > 2:181200/1‑90 (MQ=255) gcCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCg < 1:200695/117‑1 (MQ=255) gcCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCg > 2:200695/1‑117 (MQ=255) gcCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCAc > 1:246043/1‑150 (MQ=255) gcCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCAc > 1:5110986/1‑150 (MQ=255) ccATCACTGGCTCGAACAAGAGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTAGATCGGTAAGCGTGTTGACTACTCAGGCCGTACGGTAATTACAGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCAcc > 1:925642/1‑150 (MQ=255) tGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAATGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGACCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCgg > 2:1776626/1‑150 (MQ=255) tGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGa < 2:1353848/93‑1 (MQ=255) tGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCgg > 1:4078017/1‑150 (MQ=255) cTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCt > 2:490847/1‑150 (MQ=255) cTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCt < 1:1398962/150‑1 (MQ=255) cTCGAACAAGCGTCCACTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCt < 2:1544898/150‑1 (MQ=255) tCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTg > 1:3051266/1‑150 (MQ=255) tCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTg < 1:3117826/150‑1 (MQ=255) cGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGc < 2:4007540/150‑1 (MQ=255) cGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGc < 1:4721567/150‑1 (MQ=255) | CCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGC > NC_002947/542573‑542868 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |