Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 543,119 | G→C | 14.0% | L452L (CTG→CTC) | rpoC → | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 543,119 | 0 | G | C | 14.0% | 487.6 / 62.2 | 171 | L452L (CTG→CTC) | rpoC | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (75/72); new base C (11/13); total (86/85) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.66e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
CGCGAGCTGCCAGAGGTGTGGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGTGAGCCAATCATCGTTC > NC_002947/542970‑543267 | cgAGCTGCCAGAGGTGTGGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGt > 1:1252228/1‑150 (MQ=255) gCTGCCAGAGGTGTGGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCtg < 1:666674/150‑1 (MQ=255) ccAGAGGTGTGGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGtgct < 1:2390612/150‑1 (MQ=255) cAGAGGTGTGGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGtgctg < 2:565261/150‑1 (MQ=255) agagGTGTGGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGtgctgc > 1:3906742/1‑150 (MQ=255) agagGTGTGGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGtgctgc < 2:2956380/150‑1 (MQ=255) agGTGTGGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGt < 1:480898/150‑1 (MQ=255) gtgtGGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTAc > 2:5157998/1‑150 (MQ=255) gtgGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACaa < 2:933172/150‑1 (MQ=255) tgGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAAc > 1:3447820/1‑150 (MQ=255) gACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGcc < 2:1000074/150‑1 (MQ=255) gACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGcc < 1:4284630/150‑1 (MQ=255) gACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGcc < 1:2367640/150‑1 (MQ=255) aCGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCg < 1:320535/150‑1 (MQ=255) cTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACg < 1:3408576/150‑1 (MQ=255) gAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGt > 1:3763299/1‑150 (MQ=255) ttCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACCACGCCGACTTCGACGGTGACCAGa > 1:2487981/1‑150 (MQ=255) tCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGAt < 2:3547321/150‑1 (MQ=255) cgAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGc > 1:5207216/1‑150 (MQ=255) cacCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGtt < 2:3944652/150‑1 (MQ=255) acCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTc > 2:2112386/1‑150 (MQ=255) ccccGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCa < 2:2877739/150‑1 (MQ=255) cccGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCAc > 2:4920261/1‑150 (MQ=255) cccGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCAc > 1:146504/1‑150 (MQ=255) ccGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACg > 2:117429/1‑150 (MQ=255) ccGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACg > 2:117462/1‑150 (MQ=255) cGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGt > 1:1473806/1‑150 (MQ=255) tACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGc < 1:2032114/150‑1 (MQ=255) cttctgaaCCGTGCGCCTACGCTGCACCGTCTTGGTATTCAGGCATTCGAACCCACGCTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTcct < 2:2783369/144‑2 (MQ=255) tGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTCAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGc > 2:1140347/1‑150 (MQ=255) tCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGa < 1:2068516/150‑1 (MQ=255) gaaCCGTGCGCCTACGCTGCACCGTCTTGGTATTCAGGCATTCGAACCCACGCTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTgtc < 1:2236796/149‑3 (MQ=255) gaaCCGTGCGCCTACGCTGCACCGTCTTGGTATTCAGGCATTCGAACCCACGCTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTgtc > 1:2011992/2‑148 (MQ=255) gaaCCGTGCGCCTACGCTGCACCGTCTTGGTATTCAGGCATTCGAACCCACGCTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTgtc < 1:181501/149‑3 (MQ=255) aaCCGTGCGCCTACGCTGCACCGTCTTGGTATTCAGGCATTCGAACCCACGCTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGAt > 2:2044473/1‑128 (MQ=255) aaCCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGAcc < 2:2932088/150‑1 (MQ=255) aaCCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGAcc > 2:2671548/1‑150 (MQ=255) ccGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCt < 2:4645536/150‑1 (MQ=255) aCCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGc > 2:4651166/1‑150 (MQ=255) aCCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGc > 2:2580462/1‑150 (MQ=255) aCCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGc > 2:5144729/1‑150 (MQ=255) ccGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGcc > 2:1773843/1‑150 (MQ=255) ccGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGcc > 1:1373312/1‑150 (MQ=255) cgctgcACCGTCTTGGTATTCAGGCATTCGAACCCACGCTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTGTCGCTTGAAGCTCAGc > 2:1749073/6‑150 (MQ=255) gctgcACCGTCTTGGTATTCAGGCATTCGAACCCACGCTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTGTCGCTTGAAGCTCAGCt > 2:5350005/5‑150 (MQ=255) cTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTc > 2:329348/1‑150 (MQ=255) ttCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCg > 1:3892406/1‑150 (MQ=255) gcACCGTCTTGGTATTCAGGCATTCGAACCCACGCTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTGTCGCTTGAAGCTCAGCTTGa > 2:4482745/2‑150 (MQ=255) gTCTTGGTATTCAGGCATTCGAACCCACGCTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTGTCGCTTGAAGCTCAGCTTGAAgcac < 1:5350005/150‑3 (MQ=255) tCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAgcgc > 2:2836620/1‑149 (MQ=255) tCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAgcgc < 1:2836670/149‑1 (MQ=255) ggTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTgcg > 2:2898366/1‑150 (MQ=255) gTATTCAGGCATTCGAACCCACGCTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTGTCGCTTGAAGCTCAGCTTGAAGcacgcgtgc < 1:4120652/150‑6 (MQ=255) cAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCtgatg < 1:2641480/150‑1 (MQ=255) cAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCtgatg > 1:5236690/1‑150 (MQ=255) cAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGCTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAgcgc < 2:325619/139‑1 (MQ=255) aGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGTCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCtgatga > 1:2904274/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCtgatga > 1:4445135/1‑150 (MQ=255) ggCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACg < 1:2060979/83‑1 (MQ=255) ggCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTgatgat < 1:424493/150‑1 (MQ=255) gTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTc > 1:5431610/1‑150 (MQ=255) tttGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCg > 2:854721/1‑150 (MQ=255) ttGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGa < 2:4198731/150‑1 (MQ=255) ttGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGa < 1:183891/150‑1 (MQ=255) gAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGAcc < 1:2664960/150‑1 (MQ=255) aCCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACcaa > 2:949204/1‑150 (MQ=255) aCCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACcaa < 1:50691/150‑1 (MQ=255) ccGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAg > 2:4024463/1‑80 (MQ=255) ccGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACcaaca > 1:2175035/1‑150 (MQ=255) cacgcTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTGTCGCTTGAAGCTCAGCTTGAAGCACGCGTGCTGATGATGTCGACcaacaa < 2:5240686/146‑1 (MQ=255) cGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACcaacaa > 1:3188364/1‑150 (MQ=255) cGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACcaacaa > 1:4897883/1‑150 (MQ=255) gTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGaa > 2:4621075/1‑120 (MQ=255) acgcTGATCGAAGGCAAGGCCATTCAGCTGCATCCGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTGTCGCTTGAAGCTCAGCTTGAAGCACGCGTGCTGATGATGTCGACCaacaac > 1:1110036/4‑150 (MQ=255) tGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACcaac < 2:3450750/143‑1 (MQ=255) tGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATc < 1:423733/149‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGACGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGccc > 2:5407048/1‑106 (MQ=255) aTCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGACGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGccc < 1:5407048/106‑1 (MQ=255) tCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGaa > 2:2141422/1‑113 (MQ=255) tCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGaa < 1:2141422/113‑1 (MQ=255) tCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGt > 1:462270/1‑150 (MQ=255) cGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTc < 2:1744827/150‑1 (MQ=255) cGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTc < 1:4525359/150‑1 (MQ=255) gAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCg > 2:973236/1‑150 (MQ=255) aaGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCgc < 1:4651166/150‑1 (MQ=255) tgTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCgcca < 2:3985041/149‑1 (MQ=255) ggTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCgcca < 2:619279/150‑1 (MQ=255) ggCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCaa > 2:4019365/1‑150 (MQ=255) tATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACgg > 2:3455468/1‑150 (MQ=255) aTTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGt > 2:1435636/1‑150 (MQ=255) tCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGTGa < 2:462327/150‑1 (MQ=255) aGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGTGAGc > 1:272686/1‑150 (MQ=255) aGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGTGAGc < 1:2814241/150‑1 (MQ=255) gCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGTGAGcc > 2:4298397/1‑150 (MQ=255) catccGCTCGTCTGTACAGCGTTCAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTGTCGCTTGAAGCTCAGCTTGAAGCACGCGTGCtg < 2:4283613/99‑1 (MQ=255) cACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGTGAGCCAatc < 2:1373312/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGTGAGCCAatcatc > 2:3924164/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGTGAGCCAatcatc < 1:3509797/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGTCTGTACAGCGTACAACGCTGACTTCGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTTCCTCTGTCGCTTGAAGCTCAGCTTGAAGCACGCGAGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGCACCCGGCAAACGGCGCACCGatcatc < 2:1752403/150‑1 (MQ=255) tGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGTGAGCCAATCATCGTTc > 2:1543714/1‑150 (MQ=255) | CGCGAGCTGCCAGAGGTGTGGGACGTTCTCGCTGAAGTGATTCGCGAACACCCCGTACTGCTCAACCGTGCACCGACCCTTCACCGTCTGGGTATCCAGGCGTTTGAACCCGTACTGATCGAAGGTAAGGCTATTCAGCTGCACCCGCTGGTCTGTGCTGCGTACAACGCCGACTTCGACGGTGACCAGATGGCCGTTCACGTGCCGCTGACCCTGGAAGCCCAGCTCGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCGACCAACAACATCCTGTCGCCAGCCAACGGTGAGCCAATCATCGTTC > NC_002947/542970‑543267 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |