Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 563,009 | C→G | 5.5% | P30R (CCT→CGT) ‡ | rpoA → | DNA‑directed RNA polymerase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 563,009 | 0 | C | G | 5.5% | 676.8 / 20.9 | 201 | P30R (CCT→CGT) ‡ | rpoA | DNA‑directed RNA polymerase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (91/99); new base G (2/9); total (93/108) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
TCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGACGTAATTG > NC_002947/562861‑563158 | tCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCct > 1:2511030/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCctct > 1:5016676/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCctct > 1:1220752/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCctct > 2:3626849/1‑150 (MQ=255) aCGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCtctc < 2:1581509/150‑1 (MQ=255) aCGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCtctc < 2:16245/150‑1 (MQ=255) gAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGCCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGa < 1:2644963/150‑1 (MQ=255) gAAAACCTGAGTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGa < 1:3446110/150‑1 (MQ=255) aaaCCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGc < 2:573636/150‑1 (MQ=255) aCCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAACCACGCTCGAGCCTCTCGAGCGt < 1:98867/150‑1 (MQ=255) ccTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTg < 2:810975/150‑1 (MQ=255) ccTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGAGGCTCGAGCGta < 1:3962674/150‑2 (MQ=255) tGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGt > 1:2159361/1‑150 (MQ=255) tGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGt > 1:1519541/1‑150 (MQ=255) ttGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGtaatttt < 1:1706074/150‑7 (MQ=255) tGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGAGGCTCGAGCGtaattttg < 1:5194376/150‑8 (MQ=255) ttCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCgg < 2:2523821/149‑1 (MQ=255) tCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAACCACGCTCGAGAGGCTCGAGCGTAATTTTGGc < 1:2274527/150‑1 (MQ=38) 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tACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCt > 1:3309003/1‑150 (MQ=255) aCTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTg < 1:3493536/150‑1 (MQ=255) tCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTggg > 1:5043726/1‑150 (MQ=255) tCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTggg < 1:4607091/150‑1 (MQ=255) cAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCa > 1:5112035/1‑150 (MQ=255) tAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTgcgc > 1:108181/1‑150 (MQ=255) tAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTgcgc > 1:659301/1‑150 (MQ=255) tAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTgcgc > 1:967835/1‑150 (MQ=255) tAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTgcgc < 1:3744141/150‑1 (MQ=255) gAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGcgccg > 2:4029082/1‑150 (MQ=255) gAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGcgccg > 1:4656537/1‑150 (MQ=255) aaTAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCAt > 2:2727380/1‑150 (MQ=255) aTAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATc < 2:4498300/150‑1 (MQ=255) tGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCtgtt < 2:1589681/150‑1 (MQ=255) tGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCtgtt < 2:4334984/150‑1 (MQ=255) gCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCtgttg < 1:2599437/150‑1 (MQ=255) tCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGtcc > 1:857436/1‑150 (MQ=255) tCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGtcc < 2:3971629/150‑1 (MQ=255) cATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGtcctc < 1:43226/150‑1 (MQ=255) aTGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGtcctcc < 1:525464/150‑1 (MQ=255) aTGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGtcctcc > 2:5355269/1‑150 (MQ=255) gCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCAt > 1:2319965/1‑150 (MQ=255) ggTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGcgccg > 2:1297456/1‑123 (MQ=255) ggTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCtg > 1:4039493/1‑150 (MQ=255) aaTGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCa < 1:2876210/150‑1 (MQ=255) gAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCagta < 1:2937075/150‑1 (MQ=255) ttCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAAc > 1:5260057/1‑102 (MQ=255) ttCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATg > 1:4397838/1‑132 (MQ=255) ttCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTc < 1:3670059/150‑1 (MQ=255) gtCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTc < 1:5139139/149‑1 (MQ=255) ccTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGa < 2:2096915/150‑1 (MQ=255) tCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCGAAACCACGCTCGAGAGGCTCGAGCGTAATTTTGGcgcg < 1:3879328/82‑4 (MQ=14) tCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCGAAACCACGCTCGAGAGGCTCGAGCGTAATTTTGGcgcg < 1:1138288/82‑4 (MQ=14) tCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCGAAACCACGCTCGAGAGGCTCGAGCGTAATTTTGGcgcg > 2:1138288/1‑79 (MQ=14) tCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCga < 1:5373885/150‑1 (MQ=255) tCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCga > 2:3642677/1‑150 (MQ=255) tCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCga > 1:4589051/1‑150 (MQ=255) 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acaTTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATg > 2:135006/1‑150 (MQ=255) aTTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGc < 2:108181/150‑1 (MQ=255) aTTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGc < 2:3792584/150‑1 (MQ=255) ttGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCg < 1:127224/150‑1 (MQ=255) ttGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCACATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCCGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCg > 1:4134569/1‑150 (MQ=255) 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2:4961955/150‑1 (MQ=255) cgcgCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGaa < 1:736982/150‑1 (MQ=255) gcgcCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAg < 2:689210/150‑1 (MQ=255) gcgcCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAg < 1:571931/150‑1 (MQ=255) gcCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGgt > 1:942296/1‑150 (MQ=255) aaaaTTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGtt > 2:2002348/1‑150 (MQ=255) aaaTTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTc < 2:4391727/150‑1 (MQ=255) aaTTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCa < 2:3037199/150‑1 (MQ=255) aTTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAg < 2:3209524/150‑1 (MQ=255) caCGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGa > 2:3941352/2‑150 (MQ=255) cGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAg < 1:203179/150‑1 (MQ=255) cTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGAc < 2:1430401/150‑1 (MQ=255) cTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGAc < 1:2214420/150‑1 (MQ=255) tCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCagtag > 1:3389515/1‑87 (MQ=255) tCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGacgacg > 2:4243100/1‑150 (MQ=255) tCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGACg > 2:5280210/1‑150 (MQ=255) cGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGACGt < 1:4865144/150‑1 (MQ=255) gAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGaacgttct < 2:2327160/150‑7 (MQ=255) ccTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGACGTAAtt < 1:1414734/150‑1 (MQ=255) ctctCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGACGTAATTg < 1:3206680/150‑1 (MQ=255) | TCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGACGTAATTG > NC_002947/562861‑563158 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |