| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 663,081 | T→C | 5.2% | intergenic (‑124/‑57) | PP_0569 ← / → yfhM | MATE efflux family protein/lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 663,081 | 0 | T | C | 5.2% | 562.0 / 11.6 | 174 | intergenic (‑124/‑57) | PP_0569/yfhM | MATE efflux family protein/lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (73/92); new base C (4/5); total (77/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
CGCCAGTCGGCAGCGAGTTGGGGCATGTGCATTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCGGGTAAACCAGCACCGGTCGAGAA > NC_002947/662932‑663229 | tCGGCAGGGTGTTGGGGCATGTGCATTCCTTGATTTTTTGGGGCCGGTGTGTGCCCCTTTACCGAATGGCCACTTTGTAACGACCAGGCAACCTTTTAGCGCGCCCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGtt < 2:2447081/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGTTTTGGGGCTTGGGCATTCCATGATATTTGGGGGCCTAGGTTTGCCCCTTTACCTATTGGCCACAGTGTACCTACCAGGCAACAATTTAGCGCGACATTGGTCTGACCTGGCGCGAAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGa < 2:2394758/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGTGTTGGGGCATGTGCATTCCATGATATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACATTTTAACGCCCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCGGACCGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGa < 1:1803406/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGAGTTGGGGCATGTGCCTTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGTTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGa < 2:1623914/150‑1 (MQ=255) gCAGCGAGTTGGGGCATGTGCATTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAg > 2:2548975/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGTTGGGGCATGTGCATTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGTCAGGTGCAGCACCCGGCGTTgcgc < 2:2887171/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGTTGGGGCATGTGCATTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGTCAGGTGCAGCACCCGGCGTTgcgc < 1:961245/150‑1 (MQ=255) tcacgcttGGGGCATGTGCATTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGAGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCACCGCCGGGTGCTGCACCTGACGATGAGCt > 2:3617944/7‑150 (MQ=255) gAGTTGGGGCATGTGCTTTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACCGTGTAACGACCAGGCAACCATTTCGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCtata < 2:5235138/150‑1 (MQ=255) gAGTTGGGGAATGTGCATTCCATTATATTTTGGCGCCGCTGTGTGACCATTTAACGAATCCCCACAGTTTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGACTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCtata < 2:4076946/150‑1 (MQ=255) tGGGGCTTGTGCATTACTTGAGATTTTGGGGCGGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACAATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTtg < 2:717174/150‑1 (MQ=255) gggCTTGTGCTTTCCATGATTTTTTGGGGCGGCTGTGGGCCCCTTTAACGAAGGGCCCCTGTGTACCGACCAGGCAACCTTTTTGCGCGACCAGGGTCTGACCGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTtgct < 1:4908393/150‑1 (MQ=255) gggCTTGTGCTTTCATTGTGTTTGTGGGGCGGCTGGGTGCCCTTTTAACGAATGCCCACTGTGAACCCACCCGCAAACCTTTTCGCGCGACCTTGGTCTGACGTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTtgct < 1:1529518/150‑1 (MQ=255) tgCATTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCa < 2:5385546/150‑1 (MQ=255) gCATTCCTTGAGTTTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCCGGCAACCATTTAGCGCGACCAGGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTTCTGCCCTCAc < 2:2934005/150‑1 (MQ=255) gCATTCCTTGAGATTTGGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCAc < 2:1912949/150‑1 (MQ=255) gCATTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCAc < 2:2118014/150‑1 (MQ=255) aTTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCCACGTCAGGTGCAGCACCCGGCGTTgc > 1:520364/1‑127 (MQ=255) aTTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGt > 1:134334/1‑150 (MQ=255) cATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTacac > 2:3951505/1‑150 (MQ=255) cATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTacac > 1:264869/1‑150 (MQ=255) aTGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACg > 2:342166/1‑150 (MQ=255) aTGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACg > 1:2970189/1‑150 (MQ=255) cgaTTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTg > 1:3666192/2‑150 (MQ=255) agaTTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTg > 1:4338229/1‑150 (MQ=255) tttttGGGGCCGGTGTGGGCCCCTTTAACTACTGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACATTTTCGCGCGACCTTGGTCTGACCGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGcc < 1:1031998/149‑1 (MQ=255) aTTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACATTTTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCTTGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGcc < 1:4079814/150‑1 (MQ=255) aTTTGGGGGCCGCGGGGCCCCCCTTTAACTACGGGCCACTTTTTCCCGACCCGGAAACCATTTAGCGCGACCTTGGTCTCCCGGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCGGcc < 1:1032003/150‑1 (MQ=255) ttttGGGGCCGGTGGGTGCCCCTTTACCGATTGGCCACTTTTTAACCACCAGGCACCATTTTCGCGCGACCTTGGTCTGACGGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGccc < 1:2309343/150‑1 (MQ=255) ttttGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGccc > 1:5419941/1‑150 (MQ=255) ggggCCGCTTTGTGCACCTTTAACTTATGGCCATAGTTTAACGACCTTGCAACCATTTTGCTCTACAATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAaga < 1:4060660/150‑1 (MQ=255) ggggCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCCGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAaga < 2:2385630/150‑1 (MQ=255) ggggCCGCTGTGTGCCCATTTAACTAATGGCCACTGTTTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCTTGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAaga < 1:4060705/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGtt > 1:2424610/1‑150 (MQ=255) gcggtgtttgCCCCTTTAAGTATTGGCAACTTTTTAACCAACAGTCAACATTTTCGCGCGACCTTGGTCTGACCGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTc < 1:544395/146‑1 (MQ=255) cggCTGTGTGCCCATTTAACTAATGGCAACTTTGTAACGACCAGGAAACCATTTAGCGCGACCTGGGTCTGCCCGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTc < 1:990204/148‑1 (MQ=255) ccGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACATTGTAACGACCAGCAAACAATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTc < 1:3388160/150‑1 (MQ=255) gCTGTGTGCCCATTTAACGAATGGCCACAGTTTAACGACCAGGAAACCTTTTCGCGCGACCTTGGTCTGACCGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCt < 1:5299990/150‑1 (MQ=255) ggtgtgCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCCGGCAACCTTTTCGCGCGCCCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTAt < 1:3519860/149‑1 (MQ=255) gtgtgCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTTTAACGACCAGGCAACCTTTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTAtc < 1:1782739/150‑1 (MQ=255) gtgtgCCCATTTAACGAATGGCCACAGTTTAACCACCAGCCAACCATTTCGCGCGACCTTTGTCTGACCGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTAtc < 1:385338/150‑1 (MQ=255) gtgCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTAtctc < 1:4434272/150‑1 (MQ=255) tgCCCCTTTAACTTTTGGCCAACGTGTAACGACCAGGAAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCa < 2:2058408/150‑1 (MQ=255) ccccTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTCGCGGGACCTGGGTCTGCCGGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATg < 1:376328/150‑1 (MQ=255) ccccTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATg > 2:2799509/1‑150 (MQ=255) tttAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTca > 1:2802649/1‑150 (MQ=255) tttAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTca > 1:2975007/1‑150 (MQ=255) ttAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTcaa < 2:4595625/150‑1 (MQ=255) tAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTcaac < 2:777250/150‑1 (MQ=255) cGACTGCCCACAGTTTAACCACCCGCAAACATTTTCGCGCCACCCTGGTCTGACCTGGCGCCCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACaaa < 1:1385900/150‑1 (MQ=255) cGAATGGCCACTGTGTAACGACCAGCCAACCATTTCGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACaaa < 2:1066387/150‑1 (MQ=255) cGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACaaa > 2:4147903/1‑150 (MQ=255) gAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTCTCTCATGTTCAACAAAg > 2:3896815/1‑150 (MQ=255) gAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAg > 1:1066387/1‑150 (MQ=255) gAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAg > 2:5391235/1‑150 (MQ=255) gAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCAGTTAGCGCGACCATGGTCTGACCCGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAg > 2:4373488/1‑150 (MQ=255) ccACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGAttgt > 1:2602981/1‑150 (MQ=255) ccACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGAttgt < 2:4314942/150‑1 (MQ=255) cacaGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGAttgtt > 1:4461364/1‑150 (MQ=255) cacaGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGAttgtt > 2:5018848/1‑150 (MQ=255) actgtttAACGACCAGGAAACATTTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGAttgttg < 1:2087683/144‑1 (MQ=255) gtgtAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTCTCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTg > 2:2261419/1‑150 (MQ=255) tAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGtt < 2:1578960/73‑1 (MQ=255) aaCGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCt > 1:5117704/1‑150 (MQ=255) aaCGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCt < 2:1294220/150‑1 (MQ=255) aCCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTgcgc > 1:1919965/1‑150 (MQ=255) aGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTCTAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTAGCTCATGTTCAACAAAGGAGTGTTGCTGGCCTGCGCGCt > 2:3126026/1‑150 (MQ=255) ggCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTg < 2:1334288/150‑1 (MQ=255) aCCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGt < 2:1654407/150‑1 (MQ=255) ccATTTCGCGCGACCTTGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGtt < 1:3855389/150‑1 (MQ=255) cATTTCGCGCGACCTTGGTCTGACCGGGCGCGCCACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTg < 1:1620232/150‑1 (MQ=255) cATTTCGCGCGACCATGGTGTGCCCGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTg < 1:1620313/150‑1 (MQ=255) aGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAg > 2:923604/1‑150 (MQ=255) gcgACCATGGTCTGACCGGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGc < 2:1987431/150‑1 (MQ=255) ccATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCtgt < 2:4846227/150‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCtgt < 2:4484235/150‑1 (MQ=255) caaTGGTCGTACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCtgt < 1:2706580/148‑1 (MQ=255) cATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCtgtg > 2:5227097/1‑150 (MQ=255) aTGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGa < 2:3992071/150‑1 (MQ=255) tGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGAc > 2:1024765/1‑150 (MQ=255) gTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGActc > 1:490147/1‑150 (MQ=255) gTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGActc > 1:180169/1‑150 (MQ=255) tCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCAAGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGActct > 1:337721/1‑150 (MQ=255) tGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTc < 2:4796309/150‑1 (MQ=255) cccTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCa < 1:3800749/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCAc < 1:4749391/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACg > 2:4938589/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGc > 1:4532834/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGcc < 1:193681/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCg < 2:3983189/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCg < 2:3982925/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCg < 2:81932/150‑1 (MQ=255) gcgcAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCggg > 2:1175624/1‑150 (MQ=255) tcAACGTCAGGTGCAGCACCCGGCGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGAttg < 2:381699/94‑1 (MQ=38) tcAACGTCAGGTGCAGCACCCGGCGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCGGGTa > 2:4128606/2‑150 (MQ=255) cAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCGGGTaa < 2:1646818/150‑1 (MQ=255) aaCGTCAGGTGCAGCACCCGGCGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCGGGTaaa > 1:1832191/1‑150 (MQ=255) aCCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCGGGTAAACCAGCACCGGTCgag < 2:4532834/150‑1 (MQ=255) ccTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCGGGTAAACCAGCACCGGTCga < 1:2383767/148‑1 (MQ=255) cTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCGGGTAAACCAGCACCGGTCGAGaa > 2:4638598/1‑150 (MQ=255) | CGCCAGTCGGCAGCGAGTTGGGGCATGTGCATTCCATGAGATTTTGGGGCCGCTGTGTGCCCCTTTAACGAATGGCCACAGTGTAACGACCAGGCAACCATTTAGCGCGACCATGGTCTGACCTGGCGCGCAACGCCGGGTGCTGCACCTGACGTTGAGCTATAGTTGCTGCCCTCACGTACACGCTGCCCAAGAGTTCCTATCTCATGTTCAACAAAGGATTGTTGCTGGCCTGCGCGCTGGCGTTGCTCAGTGCCTGTGACTCTTCCACGCCGGGTAAACCAGCACCGGTCGAGAA > NC_002947/662932‑663229 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |