Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 760,133 | T→G | 6.2% | intergenic (+41/+24) | PP_5453 → / ← PP_0652 | hypothetical protein/gluconate transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 760,133 | 0 | T | G | 6.2% | 456.1 / 13.9 | 138 | intergenic (+41/+24) | PP_5453/PP_0652 | hypothetical protein/gluconate transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (64/65); new base G (5/4); total (69/69) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TTTTCGCAACACGGCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGATTCTTTCA > NC_002947/759984‑760281 | ttttCGCAACACGGCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGgctgct > 1:2516586/1‑150 (MQ=255) ttCGCAACACGGCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCtgctgc < 1:1141610/150‑1 (MQ=255) cGCAACACGGCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTgcgc < 2:3299997/150‑1 (MQ=255) gCAACACGGCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCa > 1:3265526/1‑150 (MQ=255) gCAACACGGCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCa < 2:4611845/150‑1 (MQ=255) acacGGCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGcc < 1:1918713/150‑1 (MQ=255) acacGGCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCGCAGCAGcc > 1:2399251/1‑150 (MQ=255) cacGGCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCGCAGCAGccc < 2:2808599/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCGCAGCAGccccaa < 2:2399251/150‑3 (MQ=255) ccGGTCTCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGGGAGCAGGGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCGGCTGCGCCGCCCCCggt > 2:699220/1‑148 (MQ=255) ccGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGtt < 2:2186161/150‑1 (MQ=255) ggTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGa < 1:3809437/150‑1 (MQ=255) tATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACt < 1:847094/150‑1 (MQ=255) aTCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTc > 2:4460656/1‑150 (MQ=255) ccATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGa < 2:1651895/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGt > 1:642663/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGt < 2:4505000/150‑1 (MQ=255) tCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTAt > 1:3496550/1‑150 (MQ=255) tCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTAt > 2:1078549/1‑150 (MQ=255) cGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATgt > 2:440688/1‑149 (MQ=255) cGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATgg > 2:1207269/1‑150 (MQ=255) gATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTg < 1:3305815/150‑1 (MQ=255) tcatcaGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGAt < 2:3581634/150‑1 (MQ=255) atcaGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAAc > 2:390966/1‑138 (MQ=255) atcaGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAAc < 1:390966/138‑1 (MQ=255) caGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAAcc > 1:4124532/1‑137 (MQ=255) caGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAAcc < 2:4124532/137‑1 (MQ=255) caGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGcc > 1:1463840/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCg > 2:3555188/1‑150 (MQ=255) gCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGc > 1:374302/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCa > 2:1851987/1‑150 (MQ=255) cGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCAt < 1:2112648/150‑1 (MQ=255) cGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCAt < 1:1927435/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATtc < 1:452462/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATtcaa < 2:59229/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATtcaaca < 2:4868839/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATtcaaaa < 1:1902879/150‑3 (MQ=255) ccAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATtcaacat > 1:1375464/1‑150 (MQ=255) cAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATtcaacatc > 2:5451514/1‑150 (MQ=255) tGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATtcaacatcaac < 2:374302/150‑1 (MQ=255) aGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAacac < 1:5080974/150‑1 (MQ=255) cAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAAcacca < 1:1502962/150‑1 (MQ=255) tgtgGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTc > 2:395546/1‑105 (MQ=255) tgtgGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTc > 2:395591/1‑105 (MQ=255) tgtgGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTc < 1:395591/105‑1 (MQ=255) ggAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAg < 1:4426989/150‑1 (MQ=255) gAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGc < 1:3495856/150‑1 (MQ=255) aaGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGcc > 1:53483/1‑150 (MQ=255) aaGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGcc > 1:3767325/1‑150 (MQ=255) ggAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAaccacc < 1:5451514/150‑1 (MQ=255) aCGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCGGCCCAACCACCGcc > 2:4661993/1‑150 (MQ=255) aGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGa > 2:5427006/1‑150 (MQ=255) gCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGAc < 2:3909165/150‑1 (MQ=255) gCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGAc < 1:174864/150‑1 (MQ=255) gCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGAc > 1:368347/1‑150 (MQ=255) 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ggCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATg > 1:4516096/1‑150 (MQ=255) ggCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATg > 1:2180498/1‑150 (MQ=255) ggCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATg > 1:2711205/1‑150 (MQ=255) gCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGc > 1:3951672/1‑150 (MQ=255) ccAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGcc > 2:1253510/1‑150 (MQ=255) ccAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGcc > 2:3101185/1‑150 (MQ=255) ccAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGcc > 2:3101209/1‑150 (MQ=255) gATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCaaa > 2:403902/1‑150 (MQ=255) acgggggCTGCGCAGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAg > 1:3045583/4‑150 (MQ=255) gggggCTGCGCAGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCGTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGa > 1:204559/2‑150 (MQ=255) ggggCTGCTGCGCAGCCCCCCTTGACTCGAGTTCAACCAATGGTGATGGCCGCATTCAAAATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGAt > 1:1386430/1‑150 (MQ=255) ggggCTGCGCAGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATg < 2:3484101/135‑1 (MQ=255) gggCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGAtt > 2:3536624/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGATTc < 2:682374/150‑1 (MQ=255) gctgctGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGATTCt > 1:4052907/1‑150 (MQ=255) gctgctGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGATTCt > 2:3255241/1‑150 (MQ=255) gctgcGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGATTCTTTc > 1:2353282/1‑150 (MQ=255) ctgcGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGATTCTTTCa < 2:3761194/150‑1 (MQ=255) ctgcGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGATTCTTTCa < 2:1296083/150‑1 (MQ=255) tgcGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCAtt > 1:2719460/1‑48 (MQ=255) | TTTTCGCAACACGGCCGGTATCCATCAGGCGATCCGGATCATCAGCCGGTTGGCCAGTGAGCAGTGTGGGAAGGTAATGGAACGAAGCGAGCAGGATCTGCAGCGTTAGGCCAGATCGGTGCTCGAGGGTGGGGCCAGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCCCGTTGACTCGAGTTCAACCTATGGTGATGGCCGCATTCAACATCAACACCACCATCAGCCCAACCACCGCCACGATGGACTGCACCACCGAAATGGTCTTGGTGGCTTCGCCCATGGTCATGCCAAAGGATTCTTTCA > NC_002947/759984‑760281 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |