| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 858,325 | C→G | 5.4% | A168P (GCA→CCA) | phr ← | deoxyribodipyrimidine photolyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 858,325 | 0 | C | G | 5.4% | 488.8 / 13.6 | 147 | A168P (GCA→CCA) | phr | deoxyribodipyrimidine photolyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (61/78); new base G (6/2); total (67/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
AGGAAGCGTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGCCGACTTT > NC_002947/858177‑858473 | gAAGCGTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAg > 1:3147404/1‑150 (MQ=255) aaGCGTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAgg < 2:2848309/150‑1 (MQ=255) aaGCGTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAgg < 2:2848165/150‑1 (MQ=255) aGCGTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAggg < 1:3856226/150‑1 (MQ=255) gCGTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAgggc < 2:2106293/150‑1 (MQ=255) cGTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAgggcg < 1:969873/150‑1 (MQ=255) cGTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAgggcg > 2:3572537/1‑150 (MQ=255) gTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAgggcgg > 1:1472518/1‑150 (MQ=255) tGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAgggcggg > 2:5281125/1‑150 (MQ=255) tGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCCTGGCAcggcggg < 1:594784/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAg > 1:2570940/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAgg > 2:2257801/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAgg > 2:2257578/1‑150 (MQ=255) gCGGGACTGTGCCTCGGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCt > 2:3013911/1‑150 (MQ=255) gCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCGCCCGCCCTGGCAcggcgggtgaagc < 2:3407859/150‑7 (MQ=255) gggACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGc > 2:4957910/1‑150 (MQ=255) ggACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCg < 1:1772148/150‑1 (MQ=255) gtgCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCa < 2:3833586/150‑1 (MQ=255) gtgCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCa < 1:1520209/150‑1 (MQ=255) cTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATg < 2:3645568/150‑1 (MQ=255) cTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATg > 1:3761457/1‑150 (MQ=255) cTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCaa < 1:768817/150‑1 (MQ=255) cACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGc < 2:4556690/150‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAg < 1:3175325/150‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAg < 1:1122838/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGtcttc < 2:1472518/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGtcttct < 2:601389/150‑1 (MQ=255) ccAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTcttctt < 1:498992/150‑1 (MQ=255) cAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGTCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTg < 1:202254/150‑1 (MQ=255) cAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTg < 1:759106/150‑1 (MQ=255) gTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGaa < 1:4389818/150‑1 (MQ=255) gTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTg < 1:5287394/150‑1 (MQ=255) gTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTg > 2:3016346/1‑150 (MQ=255) gTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTg > 1:4915959/1‑150 (MQ=255) tCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTgg > 2:2181206/1‑150 (MQ=255) cgcgCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGc < 2:2884823/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAacac < 1:2477341/150‑1 (MQ=255) ggggCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGCTGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCt < 1:2083862/149‑1 (MQ=255) gggCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTg > 2:25546/1‑150 (MQ=255) gCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGa < 1:1047951/150‑1 (MQ=255) cGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGaa < 1:2547001/150‑1 (MQ=255) gTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAg > 1:1745352/1‑150 (MQ=255) tttttCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAAt > 2:5379607/1‑150 (MQ=255) tttttCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGACTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAAt > 2:5077639/1‑150 (MQ=255) gAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACt < 2:2371329/150‑1 (MQ=255) cccTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCga < 1:5281125/150‑1 (MQ=255) cccTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCga < 2:1484945/150‑1 (MQ=255) cccTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCga < 1:2870679/150‑1 (MQ=255) cccTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCga < 1:2871010/150‑1 (MQ=255) ctctACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCgagt > 2:4004884/1‑150 (MQ=255) ctctACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCgagt < 1:2013046/150‑1 (MQ=255) ctACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCgagtga < 1:48599/150‑1 (MQ=255) aCATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCgagtgagt > 1:5172808/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTAc < 2:4532206/150‑1 (MQ=255) tGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACg < 1:547086/150‑1 (MQ=255) gggATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCga > 1:4228807/1‑135 (MQ=255) gggATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGccc < 1:3598641/150‑1 (MQ=255) gggATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGccc < 2:4430974/150‑1 (MQ=255) ggATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGGCTTCTTGAACTGGCTGAACACCGGGACGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCcg > 1:1680093/1‑150 (MQ=255) gATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCcgg > 1:4614419/1‑150 (MQ=255) gATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCcgg > 2:2195260/1‑150 (MQ=255) ttGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCcggac < 1:1745914/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGgaa > 1:4893361/1‑150 (MQ=255) tGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACa > 1:4414683/1‑150 (MQ=255) gCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAg < 2:389728/150‑1 (MQ=255) ccGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGc < 1:3244634/150‑1 (MQ=255) cGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGGTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCt > 2:134514/1‑150 (MQ=255) cGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCt < 1:1581097/150‑1 (MQ=255) gATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTg > 1:849167/1‑150 (MQ=255) aTGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTgg < 1:1638153/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCcggacgga < 2:4810525/137‑1 (MQ=255) gTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCcggacgga > 1:4810525/1‑137 (MQ=255) ttCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCg < 1:1142255/150‑1 (MQ=255) tCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCCGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGa > 2:2709505/1‑150 (MQ=255) tCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGa > 2:4882570/1‑150 (MQ=255) tCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGa < 2:4611362/150‑1 (MQ=255) tCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGa < 2:4611189/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGaa > 2:4431279/1‑96 (MQ=255) gCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGt > 1:2499495/1‑150 (MQ=255) cGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTg > 1:896777/1‑150 (MQ=255) cGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTg > 1:3638397/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCt > 2:3025352/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCtgtg > 2:3359715/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTgc > 2:374269/1‑150 (MQ=255) gcgcTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTgcgc < 1:1805472/150‑1 (MQ=255) gcTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCt < 2:4893361/150‑1 (MQ=255) ttCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTgg > 1:1439765/1‑150 (MQ=255) ttCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTgg > 2:3497209/1‑150 (MQ=255) tCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGa > 1:445252/1‑150 (MQ=255) tgcccGCCCTGGCACGGCGGGTAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGAt > 2:1127477/3‑150 (MQ=255) tgcccGCCCTGGCACGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGAt > 2:4095690/3‑150 (MQ=255) taCCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCtg > 2:1956687/2‑139 (MQ=255) taCCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCtg < 1:1956687/138‑1 (MQ=255) ccgcccTGGCACGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGc > 1:291776/1‑150 (MQ=255) ccgcccTGGCACGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGc > 1:291775/1‑150 (MQ=255) cgTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGGGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGCCGAc < 2:3761457/150‑1 (MQ=255) cgTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGCCGAc < 2:5112617/150‑1 (MQ=255) cgTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGCCGAc > 2:2740605/1‑150 (MQ=255) cgTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGCCGAc > 1:4398391/1‑150 (MQ=255) gCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGCCGACttt > 2:63482/1‑150 (MQ=255) | AGGAAGCGTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGGCTGCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTGAACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGCCGACTTT > NC_002947/858177‑858473 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |