| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,101,518 | T→G | 5.3% | S32A (TCG→GCG) ‡ | mlaD → | phospholipid ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,101,518 | 0 | T | G | 5.3% | 577.0 / 15.4 | 170 | S32A (TCG→GCG) ‡ | mlaD | phospholipid ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (82/79); new base G (5/4); total (87/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
GTGCTGGGTCTGGACTTTATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGG > NC_002947/1101375‑1101667 | gTGCTGGGTCTGGACTTTATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCa < 2:4154913/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGACTTTATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGa < 2:3913345/150‑1 (MQ=255) gTCTGGACTTTATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGGCCGACAGCCCgct < 2:3784543/150‑3 (MQ=255) ggACTTTATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGagcagc < 1:4672184/150‑1 (MQ=255) gACTTTATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCg > 1:1135085/1‑150 (MQ=255) gACTTTATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCg > 1:5167518/1‑150 (MQ=255) aCTTTATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGa < 2:722962/150‑1 (MQ=255) aCTTTATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGa < 1:5114972/150‑1 (MQ=255) tttATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATa > 1:4421092/1‑150 (MQ=255) tttATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATa > 1:332331/1‑150 (MQ=255) ttATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATAc > 2:1156746/1‑150 (MQ=255) aTTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCt < 2:4193368/150‑1 (MQ=255) ttCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCta > 1:433404/1‑150 (MQ=255) cTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCtata < 2:1217283/150‑1 (MQ=255) tGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATaa < 2:1816276/150‑1 (MQ=255) gACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATaaa < 1:463371/150‑1 (MQ=255) cGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGtt > 1:176227/1‑150 (MQ=255) cGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGCGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGtt < 1:619204/150‑1 (MQ=255) gCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGttt > 1:841841/1‑150 (MQ=255) ccTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTa > 1:483600/1‑150 (MQ=255) cTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTAt < 1:4265201/150‑1 (MQ=255) ttGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATg < 1:97382/150‑1 (MQ=255) aTGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCtt > 1:1437756/1‑150 (MQ=255) tttGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACt < 1:2902151/150‑1 (MQ=255) ttGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACtt > 2:1030100/1‑150 (MQ=255) gagaTTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGa > 1:1742229/1‑150 (MQ=255) tGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCg > 1:5070618/1‑150 (MQ=255) gATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGc < 2:4189553/150‑1 (MQ=255) aTGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGcc < 1:5134464/150‑1 (MQ=255) cAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGt > 2:4782681/1‑150 (MQ=255) cAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGt > 1:860388/1‑150 (MQ=255) aaaaCCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATTCTTACTTCGACAATATCGCCGGtt > 1:4408034/1‑150 (MQ=255) aaaCCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGttt > 2:4817972/1‑150 (MQ=255) aaCCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATCAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTg > 2:3751494/1‑150 (MQ=255) aCCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGa < 2:35209/150‑1 (MQ=255) ccGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGAc < 1:2466288/150‑1 (MQ=255) cGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACg < 2:781770/150‑1 (MQ=255) cGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACg < 2:5451542/150‑1 (MQ=255) cccTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCa < 1:2156407/150‑1 (MQ=255) ccTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCag > 1:944824/1‑150 (MQ=255) tGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATTCTTAATTCTACAATATCGCCGGTTTGAAGGTCagag > 1:569180/1‑150 (MQ=255) aTCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTaaa < 2:433404/150‑1 (MQ=255) aTCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTaaa < 2:2899581/150‑1 (MQ=255) cGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTACTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGt < 1:3877743/150‑1 (MQ=255) gtgtCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGTTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGa < 1:5434089/150‑1 (MQ=255) tgtCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGTCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGAc > 1:1255094/1‑150 (MQ=255) tgtCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGAc < 2:4675879/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGGTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACCATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCAt < 2:275918/150‑1 (MQ=255) ggCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATg > 1:3632724/1‑150 (MQ=255) gCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATgg > 2:2756356/1‑150 (MQ=255) gCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATgg > 2:2756494/1‑150 (MQ=255) ccTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGc > 2:3246350/1‑150 (MQ=255) ttCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCCGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGgt < 2:5371175/150‑1 (MQ=255) ctcctGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGcc > 2:1466465/1‑111 (MQ=255) ctcctGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGtgtg > 1:5369318/1‑150 (MQ=255) cctGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGAc > 2:40558/1‑150 (MQ=255) ctGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGAcc > 1:5335444/1‑150 (MQ=255) gCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATc < 2:841841/150‑1 (MQ=255) ccGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCg < 1:4573067/150‑1 (MQ=255) gggATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGc > 2:2582410/1‑150 (MQ=255) ggATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCa > 1:1352876/1‑150 (MQ=255) gATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCaa < 1:4487780/150‑1 (MQ=255) tCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAgg < 2:2279140/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGtt > 1:1186721/1‑150 (MQ=255) gctgctgctgctGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGc > 2:5104286/1‑150 (MQ=255) gctgctgctgGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCAt < 2:5076761/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGAt < 1:40558/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATc < 1:1030100/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATc < 1:2350152/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGAc > 2:445680/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGAc > 2:3701525/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGGTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGAc > 2:445676/1‑150 (MQ=255) cccTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTAAGCTTACTTCGACAATATCGCCGGATTGACGCTCAGAGCTAAACTGACCATCGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGAcc < 2:1254813/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGt > 1:5297435/1‑150 (MQ=255) gCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGa < 2:2329111/150‑1 (MQ=255) cGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGAt < 2:4864002/150‑1 (MQ=255) cGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGAt < 2:2130391/150‑1 (MQ=255) tgtCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTc > 1:4385833/1‑150 (MQ=255) tgtCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTc < 2:20109/150‑1 (MQ=255) gtCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTcc < 1:3870930/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTa < 2:3633149/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTa < 2:5167518/150‑1 (MQ=255) aGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTac > 2:4570053/1‑150 (MQ=255) aGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTac > 1:1242216/1‑150 (MQ=255) aGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTac > 1:4030938/1‑150 (MQ=255) tcGGGCTGGCCGACAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCACGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTaca > 2:5178142/2‑150 (MQ=255) tcGGGCTGGCCGACAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATc > 2:1597652/2‑132 (MQ=255) tcGGGCTGGCCGACAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATc < 1:1597652/131‑1 (MQ=255) tcGGGCTGGCCGACAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTaca > 1:1672780/2‑150 (MQ=255) ggCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGc > 1:2533999/1‑61 (MQ=255) ggCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGc > 1:2534013/1‑61 (MQ=255) ggCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGc < 2:2533999/61‑1 (MQ=255) ggCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCg > 2:1745423/1‑150 (MQ=255) tGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTc > 1:2502103/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCg > 1:1990719/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCgg < 1:4228358/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCgg > 2:4908465/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCgg < 2:332331/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCgg > 1:883272/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCgg < 1:621028/150‑1 (MQ=255) | GTGCTGGGTCTGGACTTTATTCTGACCGCCTTGATGTTTGGAGATTTCTGATGCAAAACCGCACCCTGGAAATCGGTGTCGGCCTGTTCCTCCTGGCCGGGATCCTGGCGCTGCTGCTGCTGGCCCTGCGTGTCAGCGGGCTGTCGGCCAGCCCGAGCAGCGATACCTATAAAGTTTATGCTTACTTCGACAATATCGCCGGTTTGACGGTCAGAGCTAAAGTGACCATGGCCGGTGTGACCATCGGCAAGGTTACCGCCATCGATCTGGACCGTGATTCCTACACCGGTCGG > NC_002947/1101375‑1101667 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |