Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,114,951 | G→A | 10.0% | intergenic (‑140/+39) | rlmF ← / ← valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,114,951 | 0 | G | A | 10.0% | 333.0 / 22.0 | 120 | intergenic (‑140/+39) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (64/44); new base A (8/4); total (72/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.61e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGTCGAC > NC_002947/1114804‑1115100 | ggggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGaa > 2:852309/1‑150 (MQ=255) ggggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCGTGTGTCGCGaa > 1:3977078/1‑150 (MQ=255) ggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGACAg > 1:3389050/1‑150 (MQ=255) ggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAg > 2:2130788/1‑150 (MQ=255) ggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAA‑CCTTCAAGG‑CGCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCAAAAg < 2:381121/150‑1 (MQ=14) gTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACATGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAgg > 2:5084091/1‑150 (MQ=255) ggCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGt > 2:2476399/1‑150 (MQ=255) ggCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCGTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGt > 2:2476296/1‑150 (MQ=255) aGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccc > 1:247006/1‑150 (MQ=255) aGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccc > 2:3419655/1‑150 (MQ=255) gCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGcccc > 1:387533/1‑150 (MQ=255) tataCGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACg > 2:926178/1‑150 (MQ=255) aCGAGCGGTGGCTTGAAGACCCGGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtc < 1:4361874/150‑1 (MQ=255) gcgCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctc < 2:650553/148‑1 (MQ=255) gAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGATGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctc > 2:4354969/1‑150 (MQ=255) gCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctctc < 2:4128549/150‑1 (MQ=255) gCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGa < 2:5303417/150‑1 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCGTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAtt > 1:2522044/1‑150 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGCGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGCGCGGCCGTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 1:2381956/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAAt > 1:2916805/1‑150 (MQ=255) gctgctGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGTGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATc < 2:3538480/150‑1 (MQ=255) gctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcgc < 2:2020482/150‑1 (MQ=255) ctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcgcg > 1:2092867/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGCGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCgcgc > 1:5077199/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCa > 2:641339/1‑150 (MQ=255) gcAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtg > 2:3387107/1‑150 (MQ=255) aGCCCTTTTGCGACCCAAGGCCGCTCCCACCGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGCCGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtgct < 2:964697/150‑1 (MQ=255) aGCCCTTTTGCGACACCCGGCCGCTCCCACCGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtgct < 2:964720/150‑1 (MQ=255) aGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtgct > 2:4295409/1‑150 (MQ=255) gCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtgctg > 2:313777/1‑150 (MQ=255) cTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCgcgc < 1:4870145/141‑1 (MQ=255) cTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCgcgc > 2:4870145/1‑141 (MQ=255) tGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTg < 2:2136089/150‑1 (MQ=255) GCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCC‑AACCTTCAAGGC‑GCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGa < 1:4359865‑M1/150‑1 (MQ=255) cgccacaAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGGCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGaa < 1:1074946/147‑1 (MQ=255) CGACACAAGGCCGCTCCCACTGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGACGGTTGGCGCCGTCCTGGGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGaa > 1:3814863‑M1/1‑150 (MQ=255) CGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCCTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGaa > 2:2637867‑M1/1‑150 (MQ=255) caAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCGTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCGTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACCGCGGCCCCAACGGTCTCGCGAGGGATTACAGCGCGGCAATCCGCGCATGCGGCTCGGTGAAGTTgg > 2:4697928/1‑150 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcgc < 2:729602‑M1/127‑1 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcgc > 1:729602‑M1/1‑127 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGc < 2:5426933‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAg < 2:521943‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCGCTCCCACAGGACGGCGCC‑AACCTTCAAGGC‑GCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAg < 2:4200167‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCTCCCACAGGACGGCGCC‑AACCTTCAAGGC‑GCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAggg < 2:4267400‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgcccACCGGCGGGGGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGGGGGCGCGGCCTTGTGGCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGc < 1:2476296/147‑1 (MQ=255) GCTCCCACCGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGc > 1:2476399‑M1/1‑150 (MQ=255) gctcccacaggacggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGc > 2:4505280‑M2/64‑150 (MQ=255) TCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCt < 2:3028819‑M1/150‑1 (MQ=255) 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cacaggacggcgccaaccttcaaggcgccacccacctgtgggagcggccttgtctcgcGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGGCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGtt > 1:373981‑M2/59‑150 (MQ=255) CAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCAAAAGGGCTGCGCAGCAGCCccagg > 1:4230019‑M1/1‑79 (MQ=255) acaggacggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcAAAAGGGCTGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTa > 2:721314‑M2/58‑92 (MQ=255) acaggacggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcAAAAGGGCTGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTa < 1:721314‑M2/35‑1 (MQ=255) GAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccccagggt > 2:4818729‑M1/1‑76 (MQ=255) GAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccccagggt < 1:4818729‑M1/80‑5 (MQ=255) GAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGAc < 2:1589536‑M1/150‑1 (MQ=255) 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1:5084091/150‑1 (MQ=255) tcctgtgggagcggccttgtgtcgcGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGa > 2:1090885‑M2/26‑150 (MQ=255) cctgtgggagcggccttgtgtcgcGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAAACCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTAGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGAt > 1:2148800‑M2/25‑150 (MQ=255) tgtgggagcggccttgtgtcgcGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCa > 2:1130551‑M2/23‑150 (MQ=255) tgtgggagcggccttgtgtcgcAAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCa > 1:2666710‑M2/23‑150 (MQ=255) tgggagcggccttgtgtcgcGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCAcc > 1:4595422‑M2/21‑150 (MQ=255) 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tcgcGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGt > 2:4805257‑M2/5‑150 (MQ=255) tcgcAACAGGGCTGCGCAGCAGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGt < 1:5051894‑M2/146‑1 (MQ=255) cGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCACTCTAGTGAAAACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGTAGATGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTACTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGTCGa > 1:1168624‑M2/2‑150 (MQ=255) gAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGTcgac > 1:915717/1‑150 (MQ=255) | GGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGTCGAC > NC_002947/1114804‑1115100 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |