| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,121,449 | C→T | 5.5% | V295V (GTC→GTT) | PP_0982 → | YjgP/YjgQ family permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,121,449 | 0 | C | T | 5.5% | 506.4 / 12.7 | 162 | V295V (GTC→GTT) | PP_0982 | YjgP/YjgQ family permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (67/86); new base T (6/3); total (73/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
CCGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTCCT > NC_002947/1121301‑1121598 | ccGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGGCa > 1:924972/1‑150 (MQ=255) cGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCaa < 2:4230857/150‑1 (MQ=255) cGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCaa > 2:1790286/1‑150 (MQ=255) gAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAAc < 1:3023532/150‑1 (MQ=255) gAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAAc > 1:3879732/1‑150 (MQ=255) ggAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAAccc > 1:4473285/1‑150 (MQ=255) gTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTTGACCcgcga < 1:2838312/150‑2 (MQ=255) aCCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAg < 2:59604/150‑1 (MQ=255) cGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAggg < 2:1050985/150‑1 (MQ=255) cGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAggg > 2:5278315/1‑150 (MQ=255) cGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGAGCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCGGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAggg < 2:1051012/150‑1 (MQ=255) aGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGcc < 2:35398/150‑1 (MQ=255) aGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGGCGCGGGTTGACCCGCGACAgc > 2:3967090/1‑146 (MQ=255) gcgAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCt > 2:4683498/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCt > 1:3404526/1‑150 (MQ=255) gAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGATGGCCAGCGTGATCGCGACGAGATGCAAAGGCGTTAGTCGATGCCGATCATGGTGTTAGTCGTCACCCTGCTGGAGGTGCCGCTGTCGCCGGTCAACCCGCGCCAGcgccgcaac > 2:4988502/1‑147 (MQ=255) aaGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTcc > 1:2941726/1‑150 (MQ=255) aaGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTcc > 1:2941742/1‑150 (MQ=255) gcgcTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTc < 2:3868447/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTc < 1:5433292/150‑1 (MQ=255) cgcTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCa < 1:2127534/150‑1 (MQ=255) cTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAg < 1:1067492/150‑1 (MQ=255) cTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAg < 1:2228322/150‑1 (MQ=255) tCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAgct > 2:714610/1‑150 (MQ=255) cccACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAgctg > 2:4415810/1‑150 (MQ=255) ccaaCCTCAGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCAGCAATGGCGGTAGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAgctg > 2:2254475/4‑150 (MQ=255) ccACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAgctgc > 1:2325018/1‑150 (MQ=255) cACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAgctgct > 1:3028551/1‑150 (MQ=255) aCCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGctgctg > 1:5051169/1‑150 (MQ=255) aCCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGctgctg > 1:3698358/1‑150 (MQ=255) aCCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGctgctg > 2:1238479/1‑150 (MQ=255) cTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCGTCCTCACGCTGCTGcc > 2:182574/1‑150 (MQ=255) aTCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAAttctt < 2:1085331/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAAttctt < 2:4479258/150‑1 (MQ=255) cGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATtcttct < 1:4503210/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTg < 2:3369045/150‑1 (MQ=255) gaggGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATg < 1:4557030/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGcc < 1:4187869/150‑1 (MQ=255) ccTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTa > 1:2962008/1‑150 (MQ=255) gTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGa > 2:4218744/1‑150 (MQ=255) tGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTc < 2:4866848/109‑1 (MQ=255) aGCGCGCCGAGCTGCTATTGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACaa < 1:5267456/150‑1 (MQ=255) cgcCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCt < 1:600202/150‑1 (MQ=255) gcCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTg > 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cAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTa > 2:2791728/1‑150 (MQ=255) ggCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTAcgcg > 2:5267123/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCt < 2:847329/150‑1 (MQ=255) tCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTc > 1:2478382/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTc < 1:1697861/150‑1 (MQ=255) 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agcggcccTGGCGCGGGTTGACCCGCGACAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATgtggtg > 1:2143751/8‑150 (MQ=255) gTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCCTGtggtgg > 1:5362864/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGtggtgg < 2:2681197/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCGACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGt < 1:1034032/150‑1 (MQ=255) ccGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTcc > 1:4984683/1‑93 (MQ=255) ccGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTcc < 2:4984683/93‑1 (MQ=255) ccGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTc > 2:356268/1‑150 (MQ=255) cGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTcc > 1:1370677/1‑150 (MQ=255) cGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTcc > 2:3658367/1‑150 (MQ=255) cTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCAc < 1:1790286/150‑1 (MQ=255) tggcgcgGGTTGACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACg > 1:2297101/4‑150 (MQ=255) tggcgcgGGTTGACCCGCGACAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACg > 1:1425933/4‑150 (MQ=255) tCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGtggtgg < 2:2354340/141‑1 (MQ=255) cgcgGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGcc < 2:2989111/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGcc < 2:2989061/150‑1 (MQ=255) gcgGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCt < 2:3363258/150‑1 (MQ=255) gcgGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGACAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCt > 1:2532600/1‑150 (MQ=255) gggTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGa > 2:3799944/1‑69 (MQ=255) gggTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGa < 1:3799944/69‑1 (MQ=255) gggTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGt < 1:1300662/150‑1 (MQ=255) gggTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGt < 1:1238479/150‑1 (MQ=255) gTCAACCCGCGCCAGGGCCTCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTCCTTTACATGGCCGACCTGACAATGCTGTTTTCCGTACTCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACCGCCGATCGCCCTGGGCTTGTGGTGGGTCCTCGGCCTGTTc < 2:1098705/150‑1 (MQ=255) gTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTc < 1:5000365/150‑1 (MQ=255) gTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTc < 1:4537491/150‑1 (MQ=255) tCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTcc < 1:3840856/150‑1 (MQ=255) | CCGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTGTCGCGGGTCAACCCGCGCCAGGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTCCT > NC_002947/1121301‑1121598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |