Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,126,648 | 0 | A | T | 5.2% | 341.6 / 3.0 | 107 | intergenic (‑97/+53) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/64); new base T (4/2); total (41/66) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTT‑‑ACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGC‑ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTT > NC_002947/1126501‑1126796 | gCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACGTGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTT‑‑ACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGC‑ATTCGCGGGTaaa < 1:4629815/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTT‑‑ACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGC‑ATTCGCGGGTaaa < 1:795957/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTT‑‑ACCCCCGAAAGCGGAGGTATAGCCACCAACCC‑ATTAGCGGGTaaa > 2:3570826/1‑150 (MQ=255) 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c‑ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGACCACGTTGTCGACCCGGCCGACcggcg < 1:1788157/150‑1 (MQ=255) gagcgGGTTTACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAacac < 1:1980400/122‑1 (MQ=255) gagcgGGTTTACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAacac > 2:1980403/3‑124 (MQ=255) gagcgGGTTTACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAacac > 2:1980400/3‑124 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggc < 1:4373206/145‑1 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggc > 2:4373206/1‑145 (MQ=255) tcgGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAg > 2:2193099/2‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTa < 1:816505/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACt > 2:2197448/1‑150 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACtt < 1:3447788/150‑1 (MQ=255) | GCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTT‑‑ACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGC‑ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGC‑CCG‑CCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTT > NC_002947/1126501‑1126796 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |