| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,366,235 | T→C | 5.1% | E157E (GAA→GAG) ‡ | PP_1191 ← | S4 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,366,235 | 0 | T | C | 5.1% | 824.9 / 19.0 | 255 | E157E (GAA→GAG) ‡ | PP_1191 | S4 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (120/122); new base C (6/7); total (126/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
AAAGCTCCAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCA > NC_002947/1366087‑1366384 | aaaGCTCCAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGtt > 1:842432/1‑150 (MQ=255) aaGCTCCAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTc > 2:3669206/1‑150 (MQ=255) gCTCCAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCa < 2:756234/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAgcgc > 1:4946860/1‑150 (MQ=255) cgcAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCACCACCCCCCAGGCGCTGGAACGCCTgg < 2:155200/150‑1 (MQ=255) gcAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTggg < 1:411515/150‑1 (MQ=255) aGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCCCCAGGCGCTGGAACGCCTggcgc < 1:380153/150‑4 (MQ=255) ggTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTgggggg > 2:2662781/1‑150 (MQ=255) ggTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTgggggg > 2:3569599/1‑150 (MQ=255) gTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGggt < 2:4760565/150‑1 (MQ=255) tAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGggtg < 2:1945699/150‑1 (MQ=255) tAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGggtg < 2:3766675/150‑1 (MQ=255) tAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGggtg < 2:314807/150‑1 (MQ=255) aGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTGTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACCCCCCAGGCGCTGGAACGCCTGGCGcgtgg < 1:5056537/150‑1 (MQ=255) gcgcATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGtt < 2:4804059/150‑1 (MQ=255) gcATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTc > 2:4208770/1‑150 (MQ=255) cATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTcg > 2:3303706/1‑150 (MQ=255) tAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTcgcc < 1:1558660/150‑1 (MQ=255) cTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGTGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCcgcg > 2:5370394/1‑150 (MQ=255) aTCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCa > 1:4315834/1‑150 (MQ=255) tGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAatg > 1:402585/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAatga < 1:3501883/150‑1 (MQ=255) tCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAatgat < 2:715999/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACTCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCCCTTCAAtgatga > 2:3617348/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGaa < 1:908336/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGaa < 1:2123256/150‑1 (MQ=255) ggTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAAc < 2:2198394/150‑1 (MQ=255) gTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACt > 1:1459035/1‑150 (MQ=255) ttGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTc > 1:619843/1‑150 (MQ=255) gtgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACt < 2:2466008/134‑1 (MQ=255) gtgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCt < 2:1787844/150‑1 (MQ=255) gtgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCt > 2:4288788/1‑150 (MQ=255) tgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTg > 2:3830633/1‑150 (MQ=255) tgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTg < 1:3441416/150‑1 (MQ=255) gggTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGc < 1:3102297/150‑1 (MQ=255) tttttCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTcc > 2:2947991/1‑150 (MQ=255) tttttCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTcc > 2:4153593/1‑150 (MQ=255) tttCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAg > 1:779245/1‑150 (MQ=255) tCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGc > 2:4920478/1‑150 (MQ=255) aaCACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGTCCTTGGGCAACTCGCTGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGa > 2:1069660/1‑150 (MQ=255) aaCACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGa < 1:1267063/150‑1 (MQ=255) acCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGc > 1:2128222/1‑150 (MQ=255) acCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGc < 2:1660664/150‑1 (MQ=255) ccATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCa > 1:4499375/1‑150 (MQ=255) cATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAg > 1:1894711/1‑150 (MQ=255) tGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGt < 1:1319350/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGt > 2:4596127/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTc > 1:1496322/1‑150 (MQ=255) gcAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCgg > 2:3967697/1‑150 (MQ=255) aGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGcc < 2:18690/150‑1 (MQ=255) gtgtgtCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTc > 1:1764802/1‑150 (MQ=255) tgtCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGAt > 2:1234243/1‑150 (MQ=255) tgtCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGAt > 2:1234305/1‑150 (MQ=255) cGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGc > 2:2749784/1‑150 (MQ=255) gTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTcgccgc > 2:905503/1‑95 (MQ=255) gTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCg < 1:3830633/150‑1 (MQ=255) ttCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCgg < 2:58166/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATa > 2:5189450/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATAc < 2:3117975/150‑1 (MQ=255) aGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAg > 2:139340/1‑115 (MQ=255) aGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAg < 1:139340/115‑1 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGcc > 1:3064980/1‑150 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGc > 1:2059613/1‑149 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGc > 1:4796250/1‑149 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGc < 2:2059613/149‑1 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGATTCGCCGCGCACTTCAATGATCAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGcc > 1:341802/1‑150 (MQ=255) ggccttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTg < 2:5066630/150‑1 (MQ=255) gccttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCGCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTgg < 1:3013110/150‑1 (MQ=255) gccttggGCAACTCGAGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCATTGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCAGCCAGTCCTgg < 2:2215859/150‑1 (MQ=255) cttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGt > 1:100813/1‑150 (MQ=255) cttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGt < 1:4174854/150‑1 (MQ=255) cAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAacac < 2:1980010/150‑1 (MQ=255) aCTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCt < 1:4087920/150‑1 (MQ=255) aCTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCt > 1:3214129/1‑150 (MQ=255) tCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATa > 1:5333900/1‑124 (MQ=255) tCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATa < 2:5333900/124‑1 (MQ=255) tCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGc > 1:2576690/1‑150 (MQ=255) gcgGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCa > 1:4888263/1‑129 (MQ=255) cgGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAgg > 2:2605114/1‑150 (MQ=255) aTTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCt < 2:4444421/150‑1 (MQ=255) gcgcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgc < 2:43966/150‑1 (MQ=255) gcgcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgc < 2:2771472/150‑1 (MQ=255) gcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcgc < 1:752780/150‑1 (MQ=255) gcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcgc > 1:1629821/1‑150 (MQ=255) gcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcgc > 2:3340254/1‑150 (MQ=255) cATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGcc < 2:3700642/150‑1 (MQ=255) aTGGCCCCACGCGCCAGGTGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCa < 1:5370394/150‑1 (MQ=255) ggCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACg > 1:4580577/1‑150 (MQ=255) aCGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCACCACGCTCCAg < 1:1058752/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAgag > 1:4299840/1‑148 (MQ=255) gcgcCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCg > 1:2404577/1‑150 (MQ=255) gcCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCg < 2:3741236/148‑1 (MQ=255) ccAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTg > 1:5159987/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGCAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTg > 1:4679952/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCTGGAACGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTg > 1:3997643/1‑150 (MQ=255) cAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGc > 2:437992/1‑145 (MQ=255) cAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGc < 1:437992/145‑1 (MQ=255) ggCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCa < 1:3569599/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCAc < 1:3303706/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCAc > 2:4637584/1‑150 (MQ=255) | AAAGCTCCAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCA > NC_002947/1366087‑1366384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |