| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,366,237 | C→G | 5.1% | E157Q (GAA→CAA) ‡ | PP_1191 ← | S4 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,366,237 | 0 | C | G | 5.1% | 856.4 / 25.3 | 254 | E157Q (GAA→CAA) ‡ | PP_1191 | S4 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (120/121); new base G (6/7); total (126/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 | |||||||||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
AAGCTCCAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGG > NC_002947/1366088‑1366386 | aaGCTCCAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTc > 2:3669206/1‑150 (MQ=255) gCTCCAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCa < 2:756234/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAgc > 1:3232889/1‑150 (MQ=255) gcAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTggg > 2:1465336/1‑150 (MQ=255) ggTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTgggggg < 1:3999153/150‑1 (MQ=255) ggTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTgggggg > 2:3569599/1‑150 (MQ=255) ggTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTgggggg > 2:2662781/1‑150 (MQ=255) gTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGggt < 2:4760565/150‑1 (MQ=255) gTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGggt < 1:1453744/150‑1 (MQ=255) gTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGggt < 1:5448399/150‑1 (MQ=255) tAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGggtg < 2:1945699/150‑1 (MQ=255) tAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGggtg < 2:314807/150‑1 (MQ=255) gcATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTc > 2:1305206/1‑150 (MQ=255) gcATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTc > 2:4208770/1‑150 (MQ=255) gcATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTc < 1:3567726/150‑1 (MQ=255) aTAGCTCGGAAATCTGTCGTGGTTGTGGGTCTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAAGTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTcgc > 2:3969111/1‑150 (MQ=255) tAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTcgcc < 1:1558660/150‑1 (MQ=255) tAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTcgcc > 2:3698082/1‑150 (MQ=255) aTCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCa > 1:4315756/1‑150 (MQ=255) aTCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCCCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCa > 1:4315919/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAatga > 1:5357935/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAatga > 1:5107759/1‑150 (MQ=255) tCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAatgat < 2:715999/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGaa < 1:1822154/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGaa < 2:3616182/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGaa < 1:2123256/150‑1 (MQ=255) gtgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACt < 2:2466008/134‑1 (MQ=255) gtgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCt > 2:4288788/1‑150 (MQ=255) gtgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCt < 2:1787844/150‑1 (MQ=255) gtgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCt < 2:3748314/150‑1 (MQ=255) tgGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTg > 2:3830633/1‑150 (MQ=255) gggTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGc > 1:4146702/1‑150 (MQ=255) gggTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGc < 1:3102297/150‑1 (MQ=255) tttttCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAat > 1:962960/1‑134 (MQ=255) tttttCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTcc > 2:2947991/1‑150 (MQ=255) tttttCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTcc > 2:4153593/1‑150 (MQ=255) tttttCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTcc < 2:157252/150‑1 (MQ=255) tttCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAg < 2:3283112/150‑1 (MQ=255) tttCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTGCAATGCTGAACTCCTGCTcccg > 1:3353263/1‑148 (MQ=255) tCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGc > 2:4920478/1‑150 (MQ=255) aaCACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGa > 1:2469710/1‑150 (MQ=255) aaCACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGa < 1:1267063/150‑1 (MQ=255) aaCACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGa < 1:4030127/150‑1 (MQ=255) acCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGc > 1:2128222/1‑150 (MQ=255) cATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAg < 1:4745530/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGt > 2:4596127/1‑150 (MQ=255) tGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGt < 1:1319350/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTc > 1:1496322/1‑150 (MQ=255) aGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGcc < 2:18690/150‑1 (MQ=255) aGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGcc < 1:3837676/150‑1 (MQ=255) gtgtgtCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTc > 1:1764802/1‑150 (MQ=255) tgtgtCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCg < 1:3829301/150‑1 (MQ=255) tgtCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGAt > 2:1234304/1‑150 (MQ=255) gTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTcgccgc > 2:905503/1‑95 (MQ=255) gTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTcgccgc < 1:905503/95‑1 (MQ=255) ttCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGc > 1:4935798/1‑117 (MQ=255) ttCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCgg < 2:58166/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCggg < 1:5223005/147‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATa > 2:5189450/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAg < 1:139340/115‑1 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGcc > 1:3064980/1‑150 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGc < 2:2059613/149‑1 (MQ=255) tggccttggcctTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGc > 1:2059613/1‑149 (MQ=255) ggccttggccttGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCa < 2:2707746/150‑1 (MQ=255) gccttggccttgGGCAACTCGTGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTc > 1:3647453/1‑56 (MQ=255) ggccttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTg < 1:344296/150‑1 (MQ=255) ggccttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTg < 2:5066630/150‑1 (MQ=255) gccttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCGCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTgg < 1:3013110/150‑1 (MQ=255) gccttggGCAACTCGAGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCATTGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCAGCCAGTCCTgg < 2:2215859/150‑1 (MQ=255) ccttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTggg > 1:408864/1‑150 (MQ=255) cttggGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGt > 1:100813/1‑150 (MQ=255) cAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAacac < 2:1980010/150‑1 (MQ=255) aCTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCt > 1:3214129/1‑150 (MQ=255) tCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATa < 2:5333900/124‑1 (MQ=255) tCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGc < 2:3800830/150‑1 (MQ=255) gcgGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCa > 1:4888263/1‑129 (MQ=255) gcgGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCa < 2:4888263/129‑1 (MQ=255) aTTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCt < 2:2159596/150‑1 (MQ=255) aTTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCt < 2:4444421/150‑1 (MQ=255) gcgcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgc < 2:2771472/150‑1 (MQ=255) gcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCTTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcgc < 2:4398991/150‑1 (MQ=255) gcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcgc > 1:4628502/1‑150 (MQ=255) gcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcgc > 1:1629821/1‑150 (MQ=255) gcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcgc > 2:3340254/1‑150 (MQ=255) ggCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACg > 1:4580577/1‑150 (MQ=255) ggCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACg > 1:753582/1‑150 (MQ=255) accccccAGGCGCTGGAACGCCTGGCGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTACACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAg > 1:3418245/6‑150 (MQ=255) aCGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAg < 2:5375603/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCACCACGCTCCAg < 1:1058752/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCAGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAg < 1:5008130/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCg < 1:629314/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCg > 1:2404577/1‑150 (MQ=255) gcCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGt < 2:1114697/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTg < 1:4243724/150‑1 (MQ=255) cAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGc > 2:437992/1‑145 (MQ=255) cAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGc < 1:438017/145‑1 (MQ=255) cAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGc > 2:2596174/1‑150 (MQ=255) gCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCAc > 2:4637584/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCa > 2:307645/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAgg > 2:1682465/1‑150 (MQ=255) | AAGCTCCAGGCGCAGGTAGGCGCATAGCTCGGAAATCTGTCCTGGTTGTGGGTTTTTCAACACCATGCGCAGGTGTGTCTCGTTCTGCCAGCTGGCCTTGGCCTTGGGCAACTCGCGGTCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGG > NC_002947/1366088‑1366386 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |