Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,414,219 | T→C | 5.8% | S86G (AGC→GGC) ‡ | PP_1236 ← | glycine cleavage system transcriptional repressor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,414,219 | 0 | T | C | 5.8% | 588.4 / 16.0 | 190 | S86G (AGC→GGC) ‡ | PP_1236 | glycine cleavage system transcriptional repressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (100/77); new base C (7/4); total (107/83) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.60e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
CGCCAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCACCGCGC > NC_002947/1414070‑1414368 | cgcCAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCt < 1:2070522/150‑1 (MQ=255) cAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCg > 1:1229776/1‑150 (MQ=255) aggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCgg < 1:3443048/150‑1 (MQ=255) aggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCgg < 2:2872448/150‑1 (MQ=255) ggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGa < 2:4787138/150‑1 (MQ=255) gtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGAc > 1:4976427/1‑150 (MQ=255) taggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGAcc < 2:859323/150‑1 (MQ=255) ggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCAc > 1:970609/1‑150 (MQ=255) ggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCAc > 2:4643210/1‑150 (MQ=255) gtCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGTGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCAGCGCGGACCaggaa < 1:1001541/150‑5 (MQ=255) gCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAg > 2:145354/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAg > 1:4689384/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAg > 1:3122416/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAg > 2:1528623/1‑150 (MQ=255) cAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAgg > 1:2045707/1‑150 (MQ=255) tCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCa > 2:567000/1‑150 (MQ=255) aTGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAgg > 2:3379265/1‑150 (MQ=255) cTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGt < 1:4084521/150‑1 (MQ=255) 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aaGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCACGCCTGGCAg > 2:4812502/1‑150 (MQ=255) aaGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAg > 1:4511036/1‑150 (MQ=255) aaGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAg > 1:5051118/1‑150 (MQ=255) aaGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAg > 1:5067559/1‑150 (MQ=255) aGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAgg > 2:2523697/1‑150 (MQ=255) aGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAgg > 1:1411313/1‑150 (MQ=255) gaataaCTGGCACAGCTGGTTGTTGTTGTCGGGGGGGTAGGCAGGGCTCACGTAGGCCACATAGGGACGGGCCGGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt < 1:3276581/150‑1 (MQ=255) gaagaaCTGGCACAGCTCGTTGATGATGCCCGGGCGGTAGGCTGCGCTCACGTAGGCCACATACGTAAGGGCCTGCGGGCGCAATTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt < 1:3972844/150‑1 (MQ=255) gaaCTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGa > 1:456465/1‑150 (MQ=255) gaaCGGGCACAGCTGGTTTTTGAGGTCCGGGGGGTAGGCAGCGCTCACGTCGGCCACATACGGACGGGCCTGGGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGa < 1:2367303/150‑1 (MQ=255) 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ttGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGCCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAgg < 2:3331003/150‑1 (MQ=255) gTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCa > 2:5141589/1‑150 (MQ=255) gCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTgcc < 2:4130259/150‑1 (MQ=255) ggTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGcttctt > 2:1209779/1‑97 (MQ=255) gTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTgccgcc > 2:2384333/1‑150 (MQ=255) cgcTCCCGTCGGCCACATCCGGACGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTgca < 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tCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTgcagca > 2:5173672/1‑150 (MQ=255) aCGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCAcc > 2:2817620/1‑150 (MQ=255) gTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAg > 1:3571044/1‑150 (MQ=255) aGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAggg > 2:1338848/1‑150 (MQ=255) gCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGgcg < 2:2524267/150‑1 (MQ=255) ccACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGgcgc > 1:2931097/1‑150 (MQ=255) cacaTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCt < 2:3052740/150‑1 (MQ=255) acaTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTg > 1:3234818/1‑150 (MQ=255) tACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGtc > 2:1600708/1‑150 (MQ=255) cGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGtctc < 1:4521680/150‑1 (MQ=255) cGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGtctc < 2:3003042/150‑1 (MQ=255) ggACGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCg < 1:2384333/150‑1 (MQ=255) ggAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCg > 2:5022090/1‑150 (MQ=255) gAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGc < 2:2633803/150‑1 (MQ=255) gAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGc > 1:2075033/1‑150 (MQ=255) 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ggCGGGCGCACGTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTggcgg < 2:1934072/149‑1 (MQ=255) gcgcACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAg < 2:3319290/150‑1 (MQ=255) gcgcACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAg > 2:4813969/1‑150 (MQ=255) cgcACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAgg < 2:767351/150‑1 (MQ=255) aCTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGgcgc < 2:5349941/150‑1 (MQ=255) aCTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGgcgc > 1:5240748/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa < 2:3212901/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa > 2:354919/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa < 1:4050621/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa > 2:634434/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa > 1:1724672/1‑150 (MQ=255) acgtGGTCCGCAGCGCGGACCAGGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAg > 1:307593/4‑150 (MQ=255) acgtGGTCCGCAGCGCGGACCAGGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAg > 2:1081687/4‑150 (MQ=255) acgtGGTCCGCAGCGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGGTTCTTGGCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCAGCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAg > 2:4229550/4‑150 (MQ=255) ccTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAGGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAgg < 2:1393097/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAgg > 1:2483740/1‑150 (MQ=255) cTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGt < 2:4418409/150‑1 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTg > 1:1957300/1‑150 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTg > 1:1680545/1‑150 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTg < 2:3038812/150‑1 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTg > 2:1310050/1‑150 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTg > 2:1309933/1‑150 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTg > 1:5403187/1‑150 (MQ=255) ggTCCGCAGCGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGa > 1:3677112/1‑150 (MQ=255) gTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGac > 2:799482/1‑150 (MQ=255) tGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCACCgcgc > 1:799152/1‑150 (MQ=255) | CGCCAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCACCGCGC > NC_002947/1414070‑1414368 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |