| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,469,818 | A→T | 5.4% | L111Q (CTG→CAG) | algK ← | alginate biosynthesis protein AlgK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,469,818 | 0 | A | T | 5.4% | 555.6 / 14.7 | 167 | L111Q (CTG→CAG) | algK | alginate biosynthesis protein AlgK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (85/73); new base T (6/3); total (91/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
CGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGC > NC_002947/1469670‑1469966 | cgcgTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACcag > 1:1331849/1‑150 (MQ=255)cgcgTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACcag > 1:4082882/1‑150 (MQ=255) gTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGTCACcagcag > 2:2724798/1‑150 (MQ=255) tGGGGAAACTCTGGGGGTAGCTGTGGTTGAGCATTGCCAGCTGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCaa < 2:139710/150‑1 (MQ=255) tGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCGCCTGCTGGTGGCCaa < 1:884517/150‑1 (MQ=255) tGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCaa < 1:5145768/150‑1 (MQ=255) ggggAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAg < 1:3782749/150‑1 (MQ=255) ggggAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAg < 2:605010/150‑1 (MQ=255) ggggAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAg < 2:604797/150‑1 (MQ=255) gggAAACTCTGCGGGTCGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAgg > 2:1849423/1‑150 (MQ=255) ggAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGgc > 2:1116401/1‑150 (MQ=255) aCTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCGCCTGCTGGTGGCCAAGccggac < 1:1013760/150‑4 (MQ=255) tctGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCtt > 2:4822430/1‑150 (MQ=255) tctGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCACGCGCCCAA‑gcgcgcctt > 2:4034652/1‑147 (MQ=255) cGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCTGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCATGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGCTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGgc > 1:266051/1‑150 (MQ=255) ggTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGgcgc > 2:238307/1‑150 (MQ=255) tAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTg > 2:1291656/1‑150 (MQ=255) aTTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGcc > 1:174988/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAg > 1:677742/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAg > 2:1637166/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAg > 2:2764568/1‑150 (MQ=255) aGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAgcg > 2:1757323/1‑150 (MQ=255) aGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAgcg > 2:2627265/1‑150 (MQ=255) tCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGt > 2:2715980/1‑130 (MQ=255) tCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGt < 1:2715980/130‑1 (MQ=255) tCAGGGTATTACTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAgg > 1:5247410/1‑150 (MQ=255) cAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGt < 1:3882272/150‑1 (MQ=255) tATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCt > 1:1176315/1‑150 (MQ=255) ttGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCg < 2:1260804/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTTAGCAGGGTATCGGCTTCCTCACGTTAGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGAGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGc > 2:4037581/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCt > 1:4746388/1‑150 (MQ=255) tttGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGAGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCtt > 2:5016311/1‑150 (MQ=255) gCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCtt < 2:2164122/98‑1 (MQ=255) gCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCtt > 1:2164122/1‑98 (MQ=255) cTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGAt > 1:4785888/1‑150 (MQ=255) cTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGAt > 1:4997987/1‑150 (MQ=255) gTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGAttt < 1:1849423/150‑1 (MQ=255) tttCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCCGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTg > 2:2879314/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCg > 1:2747268/1‑150 (MQ=255) cgcgGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGa < 2:4673209/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGa < 1:4501207/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGa < 2:1469353/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGa < 2:1161942/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGa < 1:2327694/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAgggg > 2:4784701/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGt < 2:4692700/150‑1 (MQ=255) tGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTcg > 2:2485291/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTcgcg > 1:1417096/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTcgcg < 2:4900154/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGgcgc < 2:4407155/73‑1 (MQ=255) gAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGgcgc > 1:4407155/1‑73 (MQ=255) 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1:4872006/150‑1 (MQ=255) tGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGc > 2:5436586/1‑150 (MQ=255) tGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGAGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGc > 2:5436511/1‑150 (MQ=255) gTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCg < 2:2685851/98‑1 (MQ=255) gTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCt > 2:5251273/1‑150 (MQ=255) tCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTg > 1:3648475/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTa > 1:2689267/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTa > 1:3925541/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTa > 1:3040625/1‑150 (MQ=255) ggCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAg > 2:4654865/1‑150 (MQ=255) gCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGc > 2:3271209/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCGCCTGCTGGTGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGcc > 2:3019636/1‑150 (MQ=255) ggCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCa > 2:973162/1‑149 (MQ=255) ggCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCa < 1:973162/149‑1 (MQ=255) gccgccTGCTGGTGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGAttt < 2:4100110/85‑1 (MQ=255) gCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAgg > 2:3396325/1‑150 (MQ=255) gCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAgg > 2:3265392/1‑150 (MQ=255) gCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAgg > 1:1838798/1‑150 (MQ=255) gCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAgg > 2:2943261/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGt > 2:5091876/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGt > 1:5033829/1‑150 (MQ=255) caccaGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTc > 2:4518657/1‑150 (MQ=255) cagcagGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGc > 1:2601275/1‑150 (MQ=255) | CGCGTTGACCTTGGGGAAACTCTGCGGGTAGCTGAGGTAGAGCATTGCCAGCGGAATCAGGGTATTGCTTTGGCCCTGTTTCGCGGCCTGCTTGAGCAGGGTTTCGGCTTCCTCACGTTCGGCCTGGGTGCTGTCCGGCTTGGCCACCAGCAGGCGGCCAAGGCGCGCTTGGGCGCGTGGCGACGTGGCGGCCGCAGCGCGATAGGTGGCCTCGGCTTCCTTGATTTGCGAGGGGTCGCGGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGC > NC_002947/1469670‑1469966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |