Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,479,362 | G→A | 5.1% | R140H (CGC→CAC) | moaC → | cyclic pyranopterin monophosphate synthase accessory protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,479,362 | 0 | G | A | 5.1% | 493.9 / 9.6 | 156 | R140H (CGC→CAC) | moaC | cyclic pyranopterin monophosphate synthase accessory protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/92); new base A (2/6); total (58/98) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.11e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
GCAGGATGCCGTGCGCATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGCGTTCAAGGTGCTCGATGATGTGC > NC_002947/1479213‑1479510 | gCAGGATGCCGTGCGCATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTgcg > 1:1846153/1‑150 (MQ=255) cAGGATGCCGTGCGCTTCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGACAGCGTGGCCGCTCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTgcgc < 2:3768319/150‑1 (MQ=255) cAGGATGCCGTGCGCATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTgcgc > 2:3025478/1‑150 (MQ=255) gATGCCGTGCGCATCGTCACCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCctg < 1:2404191/150‑1 (MQ=255) gCCGTGCGCATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGCGCACctgctc < 2:65133/150‑2 (MQ=255) cGTGCGCATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGa < 1:5360894/150‑1 (MQ=255) gTGCGCATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGaa < 2:3616803/150‑1 (MQ=255) gTGCGCATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCCAGCAGGCGCACCTGCTCGat < 2:15861/150‑2 (MQ=255) tGCGCATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGCGCACCTGCTCGatg < 1:156843/150‑3 (MQ=255) tGCGCATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGCGCACCTGCTCGatg < 2:4110694/150‑3 (MQ=255) cgcATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGaaaaa < 1:4242431/150‑1 (MQ=255) gcATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAAc > 1:1215569/1‑150 (MQ=255) tcgtcgCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCg < 2:2076894/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCg < 2:1936995/150‑1 (MQ=255) cgtcgCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCgg < 2:1654265/150‑1 (MQ=255) tcgCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTg > 1:287342/1‑150 (MQ=255) gCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAaga < 1:4543651/150‑1 (MQ=255) gCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAaga < 1:787802/150‑1 (MQ=255) gCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAaga > 1:863307/1‑150 (MQ=255) cTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAagag > 2:1739096/1‑150 (MQ=255) gCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTg < 1:1739096/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCg < 1:2274038/134‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCg > 2:2274038/1‑134 (MQ=255) gCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCa < 2:701963/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCa < 2:702059/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACt < 1:1954776/150‑1 (MQ=255) ggCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTa < 1:2621849/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTAc < 1:5221781/150‑1 (MQ=255) cGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACaa < 2:2424323/150‑1 (MQ=255) cGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACaa > 1:610587/1‑150 (MQ=255) cGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACaa < 1:5118947/150‑1 (MQ=255) ggCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTAGCCACTACAAgg < 1:4031166/150‑1 (MQ=255) gCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGt > 2:3419992/1‑150 (MQ=255) gACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGa < 2:1596678/150‑1 (MQ=255) aCCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGaa > 1:5133499/1‑114 (MQ=255) aCCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAg > 1:4725008/1‑150 (MQ=255) cGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCaa > 1:3861199/1‑126 (MQ=255) ggTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGTGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCg < 1:4015967/150‑1 (MQ=255) gtgtGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCg < 2:716964/117‑1 (MQ=255) gtgtGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCg > 1:716964/1‑117 (MQ=255) gtgtGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGt < 2:2971078/150‑1 (MQ=255) gtgtGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGt < 1:2043925/150‑1 (MQ=255) tgGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGtgat > 2:2549058/1‑150 (MQ=255) tgGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGtgat > 2:1184567/1‑150 (MQ=255) tgGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGGGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTCTGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGtgat > 2:2310183/1‑150 (MQ=255) ggAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGtgatg > 2:2126267/1‑150 (MQ=255) ggAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGtgatg > 2:4042037/1‑150 (MQ=255) gagaTGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCgg < 2:3490137/113‑1 (MQ=255) gagaTGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCgg > 1:3490137/1‑113 (MQ=255) agaTGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGaa < 1:1067996/150‑1 (MQ=255) gaTGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAg < 1:2313199/150‑1 (MQ=255) gaTGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAg < 1:5171027/150‑1 (MQ=255) gaTGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAg < 1:1624430/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCaa > 2:4329151/1‑150 (MQ=255) cgcTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGt < 1:4093740/150‑1 (MQ=255) cTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGa < 2:3121184/150‑1 (MQ=255) cTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGa < 2:4296065/150‑1 (MQ=255) tGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGAt > 2:5274700/1‑150 (MQ=255) tGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGAt < 1:3364921/150‑1 (MQ=255) tGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGAt < 1:3364853/150‑1 (MQ=255) tGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGAt > 1:799732/1‑150 (MQ=255) cgccgcCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTAc < 1:1400247/150‑1 (MQ=255) cgccgcCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTAc > 1:4728150/1‑150 (MQ=255) aGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGccc < 1:5118430/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGtt < 1:422984/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGtt < 2:4850872/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGtt < 1:4294020/150‑1 (MQ=255) gATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTg > 1:5401452/1‑150 (MQ=255) tATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGa > 2:140434/1‑95 (MQ=255) tATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCg < 1:1419703/150‑1 (MQ=255) tATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCg > 2:2843558/1‑150 (MQ=255) aTGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGt < 1:3300957/150‑1 (MQ=255) aTGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGt < 2:2835700/150‑1 (MQ=255) tGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTg > 1:404835/1‑150 (MQ=255) aCATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGa > 1:4813335/1‑150 (MQ=255) cATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGtga > 2:2038932/1‑97 (MQ=255) aTGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATg > 2:1231270/1‑150 (MQ=255) gtgCACGGCTGGGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGcc > 2:1034975/1‑150 (MQ=255) tgCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCg > 2:3417979/1‑150 (MQ=255) cAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAg > 2:940526/1‑150 (MQ=255) gCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCggg < 1:2060322/150‑1 (MQ=255) cTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGt > 1:1143620/1‑150 (MQ=255) cTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGt < 1:3025478/150‑1 (MQ=255) gtgGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTgg > 2:5079874/1‑150 (MQ=255) ggATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAg < 1:3417979/150‑1 (MQ=255) gATTAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAATCTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGGGTGATGAAGGTCATTGTGATGTACTTCGCCCGTTTCCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAgg > 2:842128/1‑150 (MQ=255) gATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGt > 2:823358/1‑145 (MQ=255) gATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAgg > 1:2831164/1‑150 (MQ=255) aTAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAggg < 1:2774918/150‑1 (MQ=255) aaaGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAggggg < 2:2757812/150‑1 (MQ=255) aaGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGc < 2:2692098/150‑1 (MQ=255) gTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGCGTTCAAgg > 1:4886439/1‑150 (MQ=255) tCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTgg > 2:183536/1‑113 (MQ=255) tCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGCGTTCAAGGt < 1:3534873/150‑1 (MQ=255) ccaGCAGGCGCACCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGCGTTCAAGGTGCTc > 2:4250250/3‑150 (MQ=255) aGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGCGTTCAAGGTGCTCga < 2:1846153/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGCGTTCAAGGTGCTCgat > 2:4752974/1‑150 (MQ=255) gTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGCGTTCAAGGTGCTCGatgatg > 2:1198737/1‑150 (MQ=255) gTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGCGTTCAAGGTGCTCGatgatg > 2:537795/1‑150 (MQ=255) cgcCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGCGTTCAAGGTGCTCGATGATGTgc < 2:2700848/150‑1 (MQ=255) | GCAGGATGCCGTGCGCATCGTCGCCCGCTGCAAGCTGGCCGGGCAGACCGGTGTGGAGATGGAGGCGCTGACCGCCGCCAGCGTGGCCGCGCTGACGATCTATGACATGTGCAAGGCTGTGGATAAAGGTATGGTCATCGAGCAGGTGCGCCTGCTGGAAAAACTCGGTGGCAAGAGTGGCCACTACAAGGTGGAGGCGTGATGAAGGTCAAAGTGATGTACTTCGCCCGTTACCGCGAACTGTTGGGCGTGGATGCCGAGCGGGTGGAGGGGGCGTTCAAGGTGCTCGATGATGTGC > NC_002947/1479213‑1479510 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |