| Predicted mutation | ||||||
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| JC | NC_002947 | 3,827,335 | Δ51 bp | coding (626‑676/1020 nt) | ptxS ← | 2‑ketogluconate utilization repressor |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 3827386 = | 1 (0.000) | coding (625/1020 nt) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor | |||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
GCCCGACATCGGCAACCAGGTTGCGCCCGGCCTCGAGCAGCGCCCGGGTGACCGCCAAGGTGGCAACGCCGTTGAAGGTGAAGATGGCTTGCGGACCATGACCACTGTGGGCAAGAAACGAAGCCAGTTGGCCCTGCAGCCCGGCGCCGATTTCCAGTACCTGCTGACGCATGCCTGGCCGTCGGCTGATCGACGCGCCGAATGCCTGCACCCGCTCCAGGCGTGAACTGGTGCCATCGAGGGGTTCGCTGACCGCCAGGATGTCGCGGTAGCCCTGGGCTTGCAGGTGGTCC > NC_002947/3827185‑3827477 | gCCCGACATCGGCAACCAGGTTGCGCCCGGCCTCGAGCAGCGCCCGGGTGACCGCCAAGGTGGCAACGCCGTTGAAGGTGAAGATGGCTTGCGGACCATGACCACTGTGGGCAAGAAACGAAGCCAGTTGGCCCTGCAGCCCGGCGCCGA > 2:1838785‑M1/1‑150 (MQ=255)gCCCGACATCGGCAACCAGGTTGCGCCCGGCCTCGAGCAGCGCCCGGGTGACCGCCAAGGTGGCAACGCCGTTGAAGGTGAAGATGGCTTGCGGACCATGACCACTGTGGGCAAGAAACGAAGCCAGTTGGCCCTGCAGCCCGGCGCCGA > 2:5061846‑M1/1‑150 (MQ=255) cccGACATCGGCAACCAGGTTGCGCCCGGCCTCGAGCAGCGCCCGGGTGACCGCCAAGGTGGCAACGCCGTTGAAGGTGAAGATGGCTTGCGGACCATGACCACTGTGGGCAAGAAACGAAGCCAGTTGGCCCTGCAGCCCGGCGCCGAa > 2:3848679‑M1/1‑149 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |