Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_002947 | 3,824,717 | C→T | M144I (ATG→ATA) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,824,717 | 0 | C | T | 99.8% | 1703.7 / NA | 453 | M144I (ATG→ATA) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (213/238); minor base A (1/0); total (214/239) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 453 total aligned reads displayed.
GGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGG > NC_002947/3824571‑3824862 | gggCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTAt > 2:1596079/1‑149 (MQ=255) cGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAg < 2:748458/149‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGa < 1:6086172/149‑1 (MQ=255) tCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 2:2687782/149‑1 (MQ=255) tCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 1:8165059/149‑1 (MQ=255) aTCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAgg < 2:32356/149‑1 (MQ=255) ccaccaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGgtg > 1:7824556/1‑149 (MQ=255) ccaccaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGgtg < 1:7701860/149‑1 (MQ=255) accaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGtt > 2:4708162/1‑149 (MQ=255) accaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGtt > 1:7083133/1‑149 (MQ=255) accaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGtt < 1:5678701/149‑1 (MQ=255) caGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTgg > 1:945728/1‑149 (MQ=255) caGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTgg < 2:567430/149‑1 (MQ=255) caGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTgg < 2:6224349/149‑1 (MQ=255) ggCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGgcg < 2:4409617/149‑1 (MQ=255) caccaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGa > 2:4500308/1‑149 (MQ=255) caccaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGa > 1:4412630/1‑149 (MQ=255) accaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGaa > 1:8654058/1‑149 (MQ=255) accaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGaa > 1:10002127/1‑149 (MQ=255) agaagaACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGc < 2:4199449/149‑1 (MQ=255) gaagaaCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCt < 1:10364488/149‑1 (MQ=255) aagaaCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTc < 1:9287185/149‑1 (MQ=255) aagaaCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTc < 2:8821608/149‑1 (MQ=255) aaCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTCTCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGc > 2:8688914/1‑149 (MQ=255) aaCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGc > 1:3131900/1‑149 (MQ=255) aCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGcc > 1:8821440/1‑149 (MQ=255) gCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCg < 2:8960361/149‑1 (MQ=255) gCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCg < 1:4253530/149‑1 (MQ=255) cccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCgg < 2:2207870/149‑1 (MQ=255) ccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCggg < 2:733696/149‑1 (MQ=255) aTCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGaa < 1:3506534/149‑1 (MQ=255) tCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTCTCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAAc > 2:9056552/1‑149 (MQ=255) cACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAAcc > 2:9657912/1‑149 (MQ=255) cACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAAcc < 2:5047035/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCaa < 2:1363481/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCaa < 2:759374/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCaa < 2:6443125/149‑1 (MQ=255) ggcaggcaGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGTACCAAt < 2:284149/149‑1 (MQ=255) 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atgatgAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAg < 1:6507711/149‑1 (MQ=255) atgatgAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAg < 2:10201114/149‑1 (MQ=255) atgatgAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAg > 1:9371759/1‑149 (MQ=255) gatgaACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCa < 1:8953902/149‑1 (MQ=255) aaCATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGc > 1:2059236/1‑149 (MQ=255) 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gACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGAt < 1:5904465/149‑1 (MQ=255) cATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCa < 1:4500308/149‑1 (MQ=255) aTCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAg < 1:10173256/149‑1 (MQ=255) ccACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCa < 1:75298/149‑1 (MQ=255) cacaGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCAt > 1:6832633/1‑149 (MQ=255) 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cAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCgg > 1:113002/1‑149 (MQ=255) cAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCgg > 1:6748938/1‑149 (MQ=255) | GGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGG > NC_002947/3824571‑3824862 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |