Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	583319	583338	20	4 [1]	[0] 2	tfaX/appY	pseudogene, DLP12 prophage;Phage or Prophage Related/global transcriptional activator; DLP12 prophage

ATTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTC  >  NC_000913/583251‑583320                                                                    |   aTTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGt    <  1:149640/68‑1 (MQ=255) aTTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGt    <  1:73537/68‑1 (MQ=255) aTTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGt    <  2:574105/68‑1 (MQ=255)   tttCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTc  >  1:119978/1‑68 (MQ=255)                                                                    |   ATTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTC  >  NC_000913/583251‑583320

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑