Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	1,756,796	G→T	E367* (GAA→TAA)	pykF →	pyruvate kinase I

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	1,756,796	0	G	T	95.0%	59.5 / NA	20	E367* (GAA→TAA)	pykF	pyruvate kinase I
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (1/0);  new base T (11/8);  total (12/8)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

ACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTCAGGGCGGTAAATCTGCTCGCGCAGTA  >  NC_000913/1756743‑1756858                                                      |                                                               aCCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCt                                                  <  1:290849/68‑1 (MQ=255)  ccGTAGACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTc                                                 >  1:28824/1‑68 (MQ=255)    gTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGACGCTCCg                                               <  1:689991/68‑1 (MQ=255)        aCTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGa                                           >  2:649320/1‑68 (MQ=255)        aCTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGa                                           >  2:200091/1‑68 (MQ=255)        aCTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGa                                           <  2:101682/68‑1 (MQ=255)                ttACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGtt                                   <  2:2263/68‑1 (MQ=255)                ttACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGtt                                   <  2:197154/68‑1 (MQ=255)                ttACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGtt                                   <  1:542110/68‑1 (MQ=255)                  aCCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAGGCTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGc                                 >  1:179884/1‑68 (MQ=255)                       aGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTc                            >  2:572070/1‑68 (MQ=255)                         cGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTCAg                          >  1:17825/1‑68 (MQ=255)                           gTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTCAggg                        <  1:546887/68‑1 (MQ=255)                             aTGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTCAGGGCg                      <  2:579018/68‑1 (MQ=255)                                 cGTGGTGCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTCAGGGCGGTaa                  >  1:219934/1‑68 (MQ=255)                                    ggtgCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGGTCGTGGTTGCTACTCAGGGCGGTAAATc               >  1:21333/1‑68 (MQ=255)                                       gCCGTTGAAACTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTCAGGGCGGTAAATCTGc            >  2:738398/1‑68 (MQ=255)                                               aaCTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTCAGGGCGGTAAATCTGCTCGCGCAg    >  2:378767/1‑68 (MQ=255)                                                aCTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTCAGGGCGGTAAATCTGCTCGCGCAGt   >  1:272378/1‑68 (MQ=255)                                                aCTGCTTAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGATGCTACTCAGGGCGGTAAATCTGCTAGCGCAGt   >  2:87294/1‑68 (MQ=255)                                                 ctgcttAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTCAGGGCGGTAAATCTGCTCGCGCAGTa  <  2:79143/68‑1 (MQ=255)                                                      |                                                               ACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGTTGCTACTCAGGGCGGTAAATCTGCTCGCGCAGTA  >  NC_000913/1756743‑1756858

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑