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Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
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GGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACC < 1:555592/250‑1 CATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGG > 2:755935/1‑250 TTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGAT < 2:310478/138‑1 TTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGAT > 1:310478/1‑138 GCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGCTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGC < 1:265081/209‑1 GCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGCTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGC > 2:265081/1‑209 GGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTT > 2:1362132/1‑250 CTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCC < 1:445857/174‑1 CTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACAAATTATCCTCTTAATCTCATC > 2:575629/1‑156 CTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACAAATTATCCTCTTAATCTCATC < 1:575629/156‑1 GGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCA > 1:664468/1‑250 GGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTA < 2:1282932/146‑1 CGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACT > 2:1045810/1‑250 CGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCT > 2:441437/1‑142 CGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCT < 1:441437/142‑1 GCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTT < 1:301805/250‑1 GATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGGCCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATT > 2:859239/1‑196 GATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGGCCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATT < 1:859239/196‑1 GATCCTAGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCAT < 1:268534/192‑1 GATCCTAGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCAT > 2:268534/1‑192 ATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTC > 1:97947/1‑250 TCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCC < 1:838752/250‑1 CTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGGTTATTTCACTTCTTCCGT < 1:1362132/250‑1 GGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTG < 2:1195952/197‑1 GGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTG > 1:1195952/1‑197 TATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGCGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACAT > 2:880904/1‑250 ATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTT > 1:718826/1‑158 ATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTT < 2:718826/158‑1 TCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATACCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGGCATTT < 2:8219/250‑1 CGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTACGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAG > 2:983955/1‑213 CGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAG < 1:983955/213‑1 CGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCT > 2:875504/1‑206 ATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTG > 1:1261789/1‑250 TCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGG < 1:1242355/250‑1 AGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGGCCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACA > 2:1018330/1‑231 AGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGGCCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACA < 1:1018330/231‑1 TCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCGCGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTAACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACAC < 1:1047039/250‑1 TCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACAC < 2:1120675/250‑1 TCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCAT > 1:663145/1‑232 CGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGG > 2:1195276/1‑201 CGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGG < 1:1195276/201‑1 GCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGAAGTG > 1:1390977/1‑250 TTGATGGCACATCGATATACCTGACAATGGCGGCGGTGTTTATCGCCCAGGCCACTAACAGTCAGATGGATATCGTCCACCAAATCACGCTGTTAATCGTGTTGCTGCTTTCTTCTAAAGGGGCGGCAGGGGTAACGGGTAGTGGCTTTATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779_cfb/3957872‑3958122 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGAAGTG > NC_007779_cfb/3958157‑3958402 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |