New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_007779_cfb | = 4504190 | NA (NA) | intergenic (+10/‑89) | insD_3/yjgW | IS2 insertion element transposase InsAB'/hypothetical protein |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
CGCAAAAAACGGCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAACAGGTAAGCAGTAAACAAGAGTATTCTCGCAATAGTGCAAAGAGTAGTTCACTTCCTGATTTGCGAAAATACCCTTCCGGAACACCAAGGAAAAAGGCGTTTCTCCGGACCGTAATGCCTTACATTACCAGCCAAAATGCGGCCATTACTGC > NC_007779_cfb/3903032‑3903527 | cctaaanacggCTGCATTTTGCGATAACCCCCACACTTTCTGCGAGTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTAATCCGTGGGGTGCTCGTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAAGTTGTGAAAAATATAAGGTGTTAGAAAGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTGTGACTCCCAGACGACGATATGGGGCGATGATTCTTgga < 2:1136092‑M1/247‑4 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |