Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_007779_cfb | 3,742,936 | Δ1,336 bp | insD_8–insC | insD_8, insC |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_007779_cfb | 3742936–3744262 | 3744271 | 10–1336 | 110 [0] | [0] 110 | insD_8–insC | insD_8,insC |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779_cfb | = 3742935 | 0 (0.000) | 106 (0.880) | 92/420 | 0.4 | 100% | intergenic (‑123/+9) | yieE/insD_8 | phosphopantetheinyl transferase/IS2 element protein |
? | NC_007779_cfb | 3744272 = | 0 (0.000) | intergenic (‑100/+21) | insC/yidZ | IS2 element protein/DNA‑binding transcriptional regulator |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑GCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAGATTGTCGGGT > NC_007779_cfb/3744026‑3744512 | gctttgacgatgagggggaatgtttcgggcttcttgatgacactgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTcg < 1:423102‑M2/4‑1 (MQ=255) tttgacgatgagggggaatgtttcgggcttcttgatgacactgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTcgcg > 1:628685‑M2/245‑250 (MQ=255) tgacgatgagggggaatgtttcgggcttcttgatgacactgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGtt < 2:628685‑M2/8‑1 (MQ=255) acgatgagggggaatgtttcgggcttcttgatgacactgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTc > 2:144131‑M2/241‑250 (MQ=255) gatgagggggaatgtttcgggcttcttgatgacactgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCAt > 1:668836‑M2/239‑250 (MQ=255) tcgggcttcttgatgacactgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGcc < 1:383208‑M2/28‑1 (MQ=255) cggcttcttgatgacactgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattgtattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCAt < 2:668836‑M2/30‑1 (MQ=255) ggcttcttgatgacactgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATc > 1:367617‑M2/220‑250 (MQ=255) ggcttcttgatgacactgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATc < 2:367617‑M2/31‑1 (MQ=255) ggcttcttgatgacactgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagccgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATc < 1:1308143‑M2/31‑1 (MQ=255) actgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGtt > 1:544968‑M2/206‑250 (MQ=255) ctgggaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagtctaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGttt < 2:544968‑M2/46‑1 (MQ=255) gaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaaaccaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGc > 2:931345‑M2/201‑227 (MQ=255) gaggggagacgaacagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaaaacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttgcattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGc < 1:931345‑M2/27‑1 (MQ=255) acagaaatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTa < 1:1099378‑M2/62‑1 (MQ=255) aatcagatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAg > 2:483454‑M2/184‑250 (MQ=255) agatgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGa > 1:1251665‑M2/180‑250 (MQ=255) atgtccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtcccttatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGa > 2:963711‑M2/178‑210 (MQ=255) tccttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcctattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTc > 2:1271978‑M2/175‑250 (MQ=255) cttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGtt < 1:6579‑M2/45‑1 (MQ=255) cttccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGtt > 2:6579‑M2/173‑217 (MQ=255) tccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCgg > 1:624786‑M2/171‑248 (MQ=255) tccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCgg < 2:624786‑M2/78‑1 (MQ=255) ccgttaaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGAtt < 2:465023‑M2/81‑1 (MQ=255) taaaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATgg > 2:767274‑M2/166‑250 (MQ=255) aaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttatcgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGc > 2:461743‑M2/164‑190 (MQ=255) aaatccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttatcgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGc < 1:461743‑M2/27‑1 (MQ=255) atccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacatcttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGAtt < 2:1295272‑M2/81‑1 (MQ=255) atccctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacatcttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGAtt > 1:1295272‑M2/162‑242 (MQ=255) cctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTcc < 1:483454‑M2/92‑1 (MQ=255) ctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCata < 1:533697‑M2/31‑2 (MQ=255) ctcgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGATGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACTAGACGATCTTCGGATTATGGctgttgtg > 2:208587‑M2/158‑247 (MQ=255) cgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattacgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTcgc < 2:296569‑M2/5‑1 (MQ=255) cgggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattacgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTcgc > 1:296569‑M2/156‑160 (MQ=255) gggcaaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGGTCCGttt > 2:1343165‑M2/155‑250 (MQ=255) aaagtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGc < 1:1343165‑M2/100‑1 (MQ=255) gtgagtcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCcac < 1:217478‑M2/103‑1 (MQ=255) tcgccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCAcagcag > 2:225113‑M2/143‑250 (MQ=255) gccatttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAggg > 2:419847‑M2/141‑250 (MQ=255) atttttcgctccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacatttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTaa < 1:225113‑M2/113‑1 (MQ=255) tccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGTCGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAg > 2:791878‑M2/129‑195 (MQ=255) tccatgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGTCGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAg < 1:791878‑M2/67‑1 (MQ=255) catgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGt < 1:888861‑M2/61‑1 (MQ=255) catgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcattgactggaatgatggacagactaaagcggctaacagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGt > 2:888861‑M2/127‑187 (MQ=255) atgcttaatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGTCGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCa > 1:425203‑M2/126‑250 (MQ=255) taatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGTCGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCttt < 2:425203‑M2/130‑1 (MQ=255) aatggtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCAcagc > 1:307004‑M2/120‑225 (MQ=255) gtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATg > 2:389393‑M2/116‑167 (MQ=255) gtccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATg < 1:389393‑M2/52‑1 (MQ=255) ccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCcgttttt > 2:1060951‑M2/114‑209 (MQ=255) ccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTAt < 1:1060951‑M2/98‑1 (MQ=255) ccattatgaatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCttt > 1:982832‑M2/114‑243 (MQ=255) aatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATGGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAg < 2:565537‑M2/116‑1 (MQ=255) aatacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATGGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAg > 1:565537‑M2/106‑221 (MQ=255) atacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTAt > 2:506265‑M2/105‑129 (MQ=255) atacaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTAt < 1:506265‑M2/25‑1 (MQ=255) acaagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaaacggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATGCGGTTATGCCATCGACACGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTGCGTTTATGCCACAGCAGTGTAAAAGAAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTcgtaa < 2:114584‑M2/148‑3 (MQ=255) caagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcctattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCaa < 1:1271978‑M2/149‑1 (MQ=255) aagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCaaa < 1:419847‑M2/150‑1 (MQ=255) aagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGAATCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCaaa > 1:34606‑M2/101‑250 (MQ=255) atttactggaatgatggacagcctaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTaaa < 1:716910‑M2/41‑1 (MQ=255) atttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTaaa > 2:716910‑M2/91‑131 (MQ=255) atttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCAACGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTTCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGTACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACNGGAGaggg > 2:729992‑M2/91‑249 (MQ=255) tttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagctattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAag < 2:661121‑M2/162‑1 (MQ=255) actggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTCTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAagag > 1:1224610‑M2/87‑250 (MQ=255) cgggaatgatggacagactaaagcggctaaaagtgcgattcaggcaagcttattacaacgtttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTCTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGc < 2:1224610‑M2/165‑1 (MQ=255) tgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGcaaccaa > 1:66657‑M2/80‑250 (MQ=255) ggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGATGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCAGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTGCGTTTATGCCACAGCAAGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGc > 1:106652‑M2/76‑250 (MQ=255) gacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCa < 2:1251665‑M2/176‑1 (MQ=255) actaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGcttctt > 2:159963‑M2/70‑201 (MQ=255) actaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGcttctt < 1:159963‑M2/132‑1 (MQ=255) gcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGt < 1:767274‑M2/187‑1 (MQ=255) ggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCAcagc < 1:621159‑M2/106‑1 (MQ=255) ggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCAcagc > 2:621159‑M2/62‑167 (MQ=255) ttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGGCGATCTTCGGATTATGGCTGTTTCGTTT‑TGGCACAGCAGGGGAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGGAGTGCAACCAACGGCCGGTTGTGGGGGTGAttgtagtgc > 2:425315‑M2/53‑248 (MQ=255) tcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGTTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTCTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTAc < 1:831319‑M2/199‑1 (MQ=255) agacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGt > 1:1303049‑M2/45‑222 (MQ=255) agacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGt < 2:1303049‑M2/178‑1 (MQ=255) acaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑g > 1:26121‑M2/43‑250 (MQ=255) caagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑gc < 1:208587‑M2/209‑1 (MQ=255) cagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAAATTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAAAGGGAGAGGAAGAGCACCCAACGGCAGTTGATGGGGTTTTTTGTAGTTCTTaccgttgtg > 2:736956‑M2/41‑246 (MQ=255) aagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGAATCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑gcg < 2:34606‑M2/210‑1 (MQ=255) gcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCAcagca > 1:231875‑M2/39‑145 (MQ=255) gcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCAcagca < 2:231875‑M2/107‑1 (MQ=255) cttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTAGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTcc < 2:924550‑M2/124‑1 (MQ=255) cttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTAGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTcc > 1:924550‑M2/38‑161 (MQ=255) ttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGATTTTAATGGTTTCCTGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑gcgcggc > 1:1123745‑M2/37‑250 (MQ=255) tacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGGGTTGCTTGTAGTACTGACAGta‑acgcggcgccg > 2:1066386‑M2/33‑248 (MQ=255) acaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGtt < 2:111806‑M2/179‑1 (MQ=255) acaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGtt > 1:111806‑M2/32‑210 (MQ=255) aacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGCACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCTAAAGGGATAGGAAGAGCAACCCACGGCAGTTGATTGGGTTGGTTGTAGGACTGACAGTA‑ACGCGGCGCGGGCg > 2:645829‑M2/30‑250 (MQ=255) tacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑GCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGc > 2:667045‑M2/22‑250 (MQ=255) cattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑GCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAg > 1:1332963‑M2/20‑250 (MQ=255) tattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGtt > 2:1271283‑M2/15‑193 (MQ=255) tattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGtt < 1:1271283‑M2/179‑1 (MQ=255) ttgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTTCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACCTCCAGCTTTTTTTGCTGGCGTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGCTGGAGTTGATTGTTGTAGTGACAGTAGGCGCGG‑GCGGTCACCCGTAGCAGATtgtag > 2:145850‑M2/13‑248 (MQ=255) tgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCCAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑GCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAGATTGTCGGGt > 1:578122‑M2/10‑250 (MQ=255) aattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑GCGCGGCGCGGTCGCCa < 1:843447‑M2/224‑1 (MQ=255) aattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑GCGCGGCGCGGTCGCCa > 2:843447‑M2/7‑230 (MQ=255) ggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCaaa < 2:263889‑M2/150‑1 (MQ=255) | CCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTA‑GCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAGATTGTCGGGT > NC_007779_cfb/3744026‑3744512 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |