| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779_cfb | = 3744263 | NA (NA) | 206 (1.320) | 163/440 | 0.0 | 98.6% | intergenic (‑91/+30) | insC/yidZ | IS2 element protein/DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_007779_cfb | 3903274 = | 3 (0.020) | coding (37/825 nt) | bax | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
GATCTCGCGCAAAAAACGGCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAACAGGTAAGCAGTAAACAAGAGTATTCTCGCAATAGTGCAAAGAGTAGTTCACTTCCTGATTTGCGAAAATACCCTTCCGGAACACCAAGGAAAAAGGCGTTTCTCCGGACCGTAATGCCTTACATTACCAGCCAAAATGCGGCCATTA > NC_007779_cfb/3903025‑3903523 | tattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaa > 2:1538337‑M2/250‑250 (MQ=255) attgcttacgacagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccaggctaAt < 1:752107‑M2/2‑1 (MQ=255) gCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTT > 1:1297394‑M1/1‑237 (MQ=255) tGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGAtt > 1:1318020/1‑232 (MQ=255) aaTTTTGCGATAACCCCCCCATTTTCTGCGCTTTAGCTCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGCTTCGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGCTATGCTTTGTGCTTCAACTCCCAACTTTGTGAAAAATTTAAGGCGTTGGAATGATTATATCCGACTTGGAGCCCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATCTGGGGCGATGATTCTTggctttgcccctctctt > 2:611705‑M1/1‑233 (MQ=255) ctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctccgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGtttt < 2:1579108‑M2/28‑1 (MQ=255) aaCCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGGAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatct < 1:909602‑M1/250‑29 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |