| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_007779_cfb | 2,474,595 | G→T | V7L (GTA→TTA) | gtrS → | inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779_cfb | 2,474,595 | 0 | G | T | 98.2% | 343.9 / ‑2.1 | 110 | V7L (GTA→TTA) | gtrS | inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base T (54/54); total (55/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTA‑GGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAAGAGAGTCAAAAAATGAATAAAGCAATAAAAGTATCATTGTATATATCTTTTGTTTTGATTATTTGCGCCTTATCTAAAAACATAATGATGTTAAATACATCTGATTTCGGAAGAGCCATTAAGCCATTAATTGAAGACATACCAGCATTTACATATGACTTACCTTTATTGTATAAATTGAAAGGTCATATTGATTCAATTGATAGCTATGAGTATATAAGTTCATATAGTTATATTTTGTATACATACGTCCTGTTTATTAGCATTTTTACTGA > NC_007779_cfb/2474351‑2474839 | acataGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTA‑GGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAAGAGAGTCAAAAAATGAATAAAGCAATAAAATTATCa > 1:1400304/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |