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Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
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ACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTG < 1:668132/250‑1 ACGCCCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTCCGCCGGATGGCATAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTCTGCGCTTAATTGAGCCCTGgg > 2:632100/1‑248 TGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAAtt > 2:1007230/1‑248 GCGNTNNGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGACAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTT < 2:918554/250‑1 GTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATC > 1:238401/1‑175 GTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATC < 2:238401/175‑1 TGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTGAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCTCGCA < 2:418238/192‑1 TGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTGAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCTCGCA > 1:418238/1‑192 GCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAAT < 2:446348/130‑1 GCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAAT > 1:446348/1‑130 ATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAA < 1:154217/146‑1 ATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTAGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGG < 2:398852/250‑1 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GGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTA > 1:65364/1‑250 GGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCAT < 1:1208432/158‑1 GGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCAT > 2:1208432/1‑158 TCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATT < 1:632100/250‑1 GCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCAC > 1:943102/1‑250 CTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTC < 2:898843/234‑1 CTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTC > 1:898843/1‑234 TGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCACACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCT < 1:101704/250‑1 CCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGCTGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCG > 2:1244743/1‑250 CGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTC < 1:831545/245‑1 CGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTC > 2:831545/1‑245 TATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCAC‑AAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGG > 2:505329/1‑215 TATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCAC‑AAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGG < 1:505329/215‑1 GACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTT > 2:197449/1‑237 GACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTT < 1:197449/237‑1 GCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTA < 2:566634/123‑1 GCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTA > 1:566634/1‑123 TGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGC > 1:661372/1‑250 TCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGC < 1:945104/248‑1 TCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGC > 2:945104/1‑248 AGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTCATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAA > 2:1146478/1‑250 GCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAAC < 2:661372/250‑1 TCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTCCTTGCGGTCTAACAC < 2:65364/250‑1 GCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGAAG < 1:676884/250‑1 GCACATCGATATACCTGACAATGGCGGCGGTGTTTATCGCCCAGGCCACTAACAGTCAGATGGATATCGTCCACCAAATCACGCTGTTAATCGTGTTGCTGCTTTCTTCTAAAGGGGCGGCAGGGGTAACGGGTAGTGGCTTTATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779_cfb/3957878‑3958122‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGAAGTGTT > NC_007779_cfb/3958157‑3958404 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |