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| MC JC | NC_007779_cfb | 3,742,936 | Δ1,336 bp | insD_8–insC | insD_8, insC | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_007779_cfb | 3744272 = | 0 (0.000) | intergenic (‑100/+21) | insC/yidZ | IS2 element protein/DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
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1:78426‑M1/1‑23 (MQ=255) ttACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgacagtagcgcggcgcggtcgccagtag < 2:1069113‑M1/250‑229 (MQ=255) aCATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgacagtagcgcggcgcggtcgccagtagca < 2:683755‑M1/250‑231 (MQ=255) aCATTTTATCGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgacagtagcgcggcgcggtcgccagtagca < 2:727101‑M1/250‑231 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |