New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779_cfb | 2565490 = | 85 (0.690) | 4 (0.030) | 3/418 | 15.8 | 4.7% | coding (51/1404 nt) | eutA | reactivating factor for ethanolamine ammonialyase |
? | NC_007779_cfb | = 2565486 | 82 (0.700) | coding (55/1404 nt) | eutA | reactivating factor for ethanolamine ammonialyase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGCGGGTTTTCGCGCTTTCACCGGTGATGATGATGGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTACGCCGCCGATCAACTTGCCGACAATCATCGGGAAGATCATGGCGTTCATGTTGGCAGCGGCGAAGCCTAAGTGGTCGCCCAGGGCGAAAGCAGCGGAAACGGCGAAGGCGCAGTTG > NC_007779_cfb/2565237‑2565735 | tGCGGGTTTTCGCGCTTTCACCGGTGATGATGATGGCACCAGAATCAACACTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCGCCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTg < 1:383051/250‑1 (MQ=255) tccncnnttCACCGGTGATGATGATGGCACCAGAATCAGCGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGggtggtggt < 2:966070/243‑1 (MQ=255) tgatgGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTg < 1:867431/220‑1 (MQ=255) tgatgGCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTg > 2:867431/1‑220 (MQ=255) ggCACCAGAATCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTc > 1:660166/1‑250 (MQ=255) aaTCAACGCTTTCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCTACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTg > 1:545101/1‑250 (MQ=255) tttCCGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGtt < 1:181348/250‑1 (MQ=255) ccGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCAc < 2:660166/250‑1 (MQ=255) ccGGCTCAATACCCGCAGCATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCAc < 1:746996/250‑1 (MQ=255) cGGCTCAATACCCGCAACATGATATTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACTTGGGAGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTNNGNAcc > 2:970426/1‑249 (MQ=255) 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atTGCTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTG‑‑‑GGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAgtc < 1:920473/250‑1 (MQ=255) cTCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAgtcg > 2:895136/1‑250 (MQ=255) tCGAGTATTAAGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTG‑‑‑GGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAgtcgcggt > 2:786370/1‑250 (MQ=255) aaGGTTTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGggt < 2:1347098/161‑1 (MQ=255) aaGGATTTCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGggt > 1:1347098/1‑161 (MQ=255) ttCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCttt < 1:320608/250‑1 (MQ=255) ttCAGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCttt < 1:880008/250‑1 (MQ=255) aGTTCCGCTTCTTTTAAACCGCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAgtc < 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |