Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_007779_cfb | 2,288,259 | (TTATCGCCT)2→3 | coding (550/1761 nt) | yejM → | hydrolase, inner membrane |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779_cfb | = 2288240 | 2 (0.030) | 51 (0.670) +TTTATCGCC |
57/382 | 0.4 | 96.2% | coding (531/1761 nt) | yejM | hydrolase, inner membrane |
? | NC_007779_cfb | 2288241 = | 2 (0.030) | coding (532/1761 nt) | yejM | hydrolase, inner membrane |
AATGACGCTATTACTGATCGATAGCGAAGTCTTTACTCGTTTCCATCTCCATCTTAATCCCATCGTCTGGCAACTGGTTATCAACCCAGACGAAAATGAGATGGCGCGCGACTGGCAGCTGATGTTCATCAGCGTGCCGGTTATTTTATTGCTTGAACTGGTGTTTGCGACGTGGAGCTGGCAAAAGCTGCGCAGCCTGACGCGTCGTCGACGCTTCGCGCGCCCGCTGGCCGCATTCTTATTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCAACGCCGTCTTATTGAGCAAGGTAATCCAGACGCCGTTTCCGTTCAGTATCCGTTAAGCGAACTGCGCTATCGCGATATGGGCACCG > NC_007779_cfb/2288000‑2288484 | attactgatcgatagcgaggtctttactcgtttccatttccatcttaatcccatcgtctggcaactggttatcaaccccgacgaaaatgagatggcccgcgactggcagctgatgttcaacagcctgccggttattttaccgcctgacctggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgctcagcctgaccggtcgtccacggcttgtgcgctcgccggccgctgtcttttttatcgcctttatggac > 2:722897‑M2/242‑246 (MQ=255) tgaccgatatcgaagtctttactcgtttccatctccatcttaatcacctcgtctggcaacttgttatcatccctgacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttatttttttgcttgacctggtgtttgcaacgtggagctggcaaaagctgcgcagcaggacgcgtcgtcgacgcttggcgcgcccgctggccgcattattatttatcgcctttatcgcctttat < 2:922197‑M2/14‑1 (MQ=255) cgaagtctttactcgtttccatctccatcttaatcccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggtgcgcgaccggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgtgcgcccgctggccgctttcttattcatcgccTTTATCACCTTTATCGCCTCGcag > 2:896043‑M2/227‑249 (MQ=255) tttactcgtttccatctccatcttaatcccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaagatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGgtgt < 1:722897‑M2/31‑1 (MQ=255) ttccatctccatcttaatcccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgatcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTggg > 2:676912‑M2/211‑250 (MQ=255) tccatctccaacttaatcccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGc < 2:63158‑M2/41‑1 (MQ=255) ctccatcttaatcccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCa < 2:376450‑M2/23‑1 (MQ=255) ctccatcttaatcccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCa > 1:376450‑M2/205‑227 (MQ=255) cccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATc < 1:676912‑M2/58‑1 (MQ=255) cgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGc > 2:218591‑M2/188‑247 (MQ=255) cgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGc < 1:218591‑M2/60‑1 (MQ=255) tctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgatggccgcattcttctttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCCCGCACGTGGTGTATATCTAGGACGATTCCACCTACTATCNCCNgac > 2:797074‑M2/186‑249 (MQ=255) gcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCCTGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCACCTTCTATCGCCCGNTCacn > 2:537392‑M2/182‑249 (MQ=255) tatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAgcgc > 1:775821‑M2/173‑250 (MQ=255) cgaaaatgagatggtgcgcgaccggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttattcatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCg < 1:896043‑M2/90‑1 (MQ=255) gaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGc > 1:306510‑M2/160‑250 (MQ=255) aaaatgagatggcgcgcgcctggcagctgatgttcagcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCg > 2:73438‑M2/159‑221 (MQ=255) aaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCg < 1:73438‑M2/63‑1 (MQ=255) aganggnggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTc < 2:775821‑M2/95‑1 (MQ=255) cgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttgtcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGAt > 1:346288‑M2/147‑250 (MQ=255) tgtcgcgcgACTGGCAGCTGATGTTCATCAGCGTGCCGGTTATTTTATTGCTTGAATTGGTGTTTGCGACGTGGAGCTGGCAAAAGCTGCGCAGCCTGACGCGTCGTCGACGCCTCGCGCGCCCGCTGGCCGCATTCTTATTTATCGCCTTTATCTCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGAAGCCAACTTCTATCGCCTGATCACCAACCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGANGACGgc > 2:754032/4‑250 (MQ=255) ggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGcgcg > 1:338478‑M2/138‑250 (MQ=255) 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2:263595‑M2/133‑149 (MQ=255) ctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgcctttatcgcctttatcgc < 1:263595‑M2/17‑1 (MQ=255) cagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAg > 1:8641‑M2/122‑250 (MQ=255) ttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTatat > 1:455929‑M2/111‑145 (MQ=255) ttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTatat < 2:455929‑M2/35‑1 (MQ=255) 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tttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCAACGcc < 1:537392‑M2/163‑1 (MQ=255) gcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgccgcttcgcgcgcccgctggccgccttcttatttatcgccTTTCTCGCCTTTATCGCCTCGCATCTGGAGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGCTCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGCTGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGCAGCATGGTCTGCTTGAGGCGCAGGAGCCTCAANNcngcc > 2:638158‑M2/85‑248 (MQ=255) gagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGCATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGgcg > 1:762829‑M2/77‑187 (MQ=255) gagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGCATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGgcg < 2:762829‑M2/111‑1 (MQ=255) 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attcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATg < 1:83975‑M2/133‑1 (MQ=255) attcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATg > 2:83975‑M2/17‑149 (MQ=255) tcttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATTTCTGGGCCAATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCAACGCCGTCTTATTGAGCAAGGTAATCCAGACGCCGTTTCCGTTCAGTATCCGTTAAGCGAACTGCGCTATCGCGatat > 1:640454‑M2/15‑250 (MQ=255) cttatttatcgccTTTATCGCCTTTGTCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCAACGCCGTCTTATTGAGCAAGGTAATCCAGACGCCGTTTCCGTTCAGTATCCGTTAAGCGAACTGCGCTATCGCGATATg < 2:351984‑M2/237‑1 (MQ=255) cttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCaa > 1:521658‑M2/14‑172 (MQ=255) cttatttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCaa < 2:521658‑M2/159‑1 (MQ=255) ttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGACGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCAACGCCGTCTTATTGAGCAAgg < 1:383675‑M2/179‑1 (MQ=255) ttatcgccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGACGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCAACGCCGTCTTATTGAGCAAgg > 2:383675‑M2/9‑187 (MQ=255) ccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCAACGCCGTCTTATTGAGCAAGGTAATCCAGACGCCGTTTCCGTTCAGTATCCGTTAAGCGAACTGCGCTATCGCGATATGGGCACCg > 2:832828‑M2/3‑246 (MQ=255) ccTTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCAACGCCGTCTTATTGAGCAAGGTAATCCAGACGCCGTTTCCGTTCAGTATCCGTTAAGCGAACTGCGCTATCGCGATATGGGCACCg < 1:832828‑M2/244‑1 (MQ=255) | AATGACGCTATTACTGATCGATAGCGAAGTCTTTACTCGTTTCCATCTCCATCTTAATCCCATCGTCTGGCAACTGGTTATCAACCCAGACGAAAATGAGATGGCGCGCGACTGGCAGCTGATGTTCATCAGCGTGCCGGTTATTTTATTGCTTGAACTGGTGTTTGCGACGTGGAGCTGGCAAAAGCTGCGCAGCCTGACGCGTCGTCGACGCTTCGCGCGCCCGCTGGCCGCATTCTTATTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCAACGCCGTCTTATTGAGCAAGGTAATCCAGACGCCGTTTCCGTTCAGTATCCGTTAAGCGAACTGCGCTATCGCGATATGGGCACCG > NC_007779_cfb/2288000‑2288484 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |