Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_007779_cfb | 3,268,825 | A→G | T186A (ACA→GCA) | yhaC → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779_cfb | 3,268,825 | 0 | A | G | 100.0% | 276.1 / NA | 94 | T186A (ACA→GCA) | yhaC | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (48/46); total (48/46) |
TACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAACAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCAATTATAAAATCTATACCAAGGGCAACTCT > NC_007779_cfb/3268578‑3269063 | tACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACATAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTcagca < 1:160680/250‑1 (MQ=255) gAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTa > 2:715923/1‑250 (MQ=255) cTTACCATTAATAAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATNNTNCTa > 2:652796/1‑250 (MQ=255) aCCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AGACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATg > 2:103236/1‑250 (MQ=255) tGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATg < 1:652796/250‑1 (MQ=255) gAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGt < 2:70367/250‑1 (MQ=255) aaaaaaCCAGGAAATATCTACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGtt > 1:75530/1‑250 (MQ=255) aCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AGACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAAttt < 1:103236/250‑1 (MQ=255) aCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAAttt < 1:639553/250‑1 (MQ=255) ccAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAAtttt > 1:80932/1‑250 (MQ=255) aGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGt < 2:348752/237‑1 (MQ=255) aGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGt > 1:348752/1‑237 (MQ=255) tatCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTATGTAATGTCGATTTAGCTTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAATACGcc > 1:426661/1‑250 (MQ=255) atCAATATTACTTGCCCATCAAAAGACACTAACAATGAAATAAGGAGGTTAAACGTAGTTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATACTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGATAATAATATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTCCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACNACACGCca > 2:477963/1‑250 (MQ=255) tCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACACANCCNcac > 2:787312/1‑250 (MQ=255) tAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTACTTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTcc > 2:493705/1‑250 (MQ=255) aaTTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCt < 1:715923/250‑1 (MQ=255) aTTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACAt < 2:238039/195‑1 (MQ=255) aTTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACAt > 1:238039/1‑195 (MQ=255) aCAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGGTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATAATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTACTTCAACACAAAACGCCACAGTCTCCTGGGATAATTGACTAAAAATAAc < 2:80932/250‑1 (MQ=255) aggaggTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAAtttt > 2:65291/1‑156 (MQ=255) aggaggTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAAtttt < 1:65291/156‑1 (MQ=255) ttAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGtt > 1:192933/1‑167 (MQ=255) ttAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGtt < 2:192933/167‑1 (MQ=255) aaTTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGt > 1:612878/1‑158 (MQ=255) aaTTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGt < 2:612878/158‑1 (MQ=255) aaTTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGat > 2:198232/1‑250 (MQ=255) aaTTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGat > 2:729715/1‑250 (MQ=255) aTTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGata > 1:350666/1‑250 (MQ=255) tttttAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGCTCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGatat > 2:807898/1‑250 (MQ=255) ttAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTa > 1:775754/1‑250 (MQ=255) tAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAAAGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTAt < 1:648583/250‑1 (MQ=255) tgtgGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTGTTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTg > 2:25154/1‑250 (MQ=255) gtgGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTga > 1:801271/1‑250 (MQ=255) gACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAGTTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTgaagaa > 1:744086/1‑250 (MQ=255) cTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCa < 2:148040/145‑1 (MQ=255) cTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCa > 1:148040/1‑145 (MQ=255) gagaTATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAg < 2:320657/157‑1 (MQ=255) gagaTATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAg > 1:320657/1‑157 (MQ=255) atCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAg > 2:441617/1‑250 (MQ=255) gTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAAt < 1:866159/194‑1 (MQ=255) gTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATAGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCATCACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAAt > 2:866159/1‑194 (MQ=255) gATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCg < 1:787312/250‑1 (MQ=255) aTCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGtttt > 1:708588/1‑202 (MQ=255) aTCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGtttg < 2:708588/202‑2 (MQ=255) aTCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGc < 2:38797/215‑1 (MQ=255) aTCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGc > 1:38797/1‑215 (MQ=255) ctctGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTct < 2:725397/140‑2 (MQ=255) ctctGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCa > 1:725397/1‑140 (MQ=255) ctGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTGTTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAAAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTaa < 1:25154/250‑1 (MQ=255) gACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAAATCAGCAAATTTTCCTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACCCAAAACGCCACAATCTACTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCGTTGGCGATAAGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCTAAAGTTGTTTagctg < 2:75530/250‑5 (MQ=255) aCTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTa < 1:18185/208‑1 (MQ=255) aCTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTa > 2:18185/1‑208 (MQ=255) tCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTa > 2:119232/1‑158 (MQ=255) tCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTa < 1:119232/158‑1 (MQ=255) tCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACAt > 1:566215/1‑250 (MQ=255) gATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACAt > 1:808466/1‑248 (MQ=255) gATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACAt < 2:808466/248‑1 (MQ=255) ttattaTGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATa > 1:865093/1‑154 (MQ=255) ttattaTGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATa < 2:865093/154‑1 (MQ=255) ttattaTGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTACTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCgaagaa < 1:493705/250‑1 (MQ=255) tttCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTAcc > 1:464150/1‑235 (MQ=255) tttCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTAcc < 2:464150/235‑1 (MQ=255) aT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCGAATTTTACTAATGCCAGCATGCTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAGCACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACg < 2:615095/140‑1 (MQ=255) aT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCGAATTTTACTAATGCCAACATGCTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACg > 1:615095/1‑140 (MQ=255) t‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATgaga > 1:379785/1‑250 (MQ=255) aCATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTtaa < 2:641435/146‑1 (MQ=255) aCATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTtaa > 1:641435/1‑146 (MQ=255) aCATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTc < 1:916541/168‑1 (MQ=255) aCATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGGTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTc > 2:916541/1‑168 (MQ=255) cATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTg < 2:379785/250‑1 (MQ=255) tatGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTGCCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCa < 1:477963/250‑1 (MQ=255) taaggtnaaTACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAGTTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTACTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCa < 2:744086/243‑1 (MQ=255) atGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTg < 1:228088/166‑1 (MQ=255) atGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTg > 2:228088/1‑166 (MQ=255) gCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAg > 2:453430/1‑149 (MQ=255) gCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAg < 1:453430/149‑1 (MQ=255) cTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAAt > 2:581154/1‑225 (MQ=255) cTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAAt < 1:581154/225‑1 (MQ=255) aTACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGaaa > 1:193491/1‑183 (MQ=255) aTACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGaaa < 2:193491/183‑1 (MQ=255) ttttAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCAATTATAAAATCtat < 2:350666/250‑1 (MQ=255) ttAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGAc < 1:502684/198‑1 (MQ=255) ttAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGAc > 2:502684/1‑198 (MQ=255) tCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCAATTATAAAATCTATACCAAgg < 2:775754/250‑1 (MQ=255) ttttAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAg < 2:484307/168‑1 (MQ=255) ttttAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAg > 1:484307/1‑168 (MQ=255) ttAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCAATTATAAAATCTATACCAAGGGCAAc < 1:198232/250‑1 (MQ=255) tAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCAATTATAAAATCTATACCAAGGGCAAct < 1:441617/250‑1 (MQ=255) gaTTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATc < 1:9896/148‑1 (MQ=255) gaTTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATc > 2:9896/2‑149 (MQ=255) tGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCAATTATAAAATCTATACCAAGGGCAActct > 1:494672/1‑247 (MQ=255) tGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCAATTATAAAATCTATACCAAGGGCAActct < 2:494672/247‑1 (MQ=255) aaTTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCAATTATAAAAt < 1:471656/226‑1 (MQ=255) aaTTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCAATTATAAAAt > 2:471656/1‑226 (MQ=255) | TACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAT‑AAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAACAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGAAGAACAATTAAAAATTATGAGATTTGCAATTATAAAATCTATACCAAGGGCAACTCT > NC_007779_cfb/3268578‑3269063 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |